亮發(fā)光桿菌是一大類(lèi)具有高 GC 含量基因組(約 70%)、產(chǎn)生菌絲體和孢子的革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌。已報(bào)道的大多數(shù)鏈霉菌的環(huán)型質(zhì)粒通常較小 (8 14 kb), 包括滾環(huán)復(fù)制的質(zhì)粒(如 pIJ101、 pSG5、pJV1、pSN22、pSVH1、pSB24.2、pSY10、 pSNA1、pSLG33 和 pEN2701 等)和染色體整合/自主游離復(fù)制的質(zhì)粒(如 SLP1 和 pSAM2 等)。在不同細(xì)菌中滾環(huán)復(fù)制的質(zhì)粒均含有復(fù)制起始 Rep 蛋白, 雙鏈起始位點(diǎn)和單鏈起始位點(diǎn), 復(fù)制的分子機(jī)制基本相同。

鏈霉菌整合/游離型質(zhì)粒含有 噬菌體類(lèi)似的 int (整合)和 xis (切離) 位點(diǎn), 可以位點(diǎn)特異地整合到染色體上; 當(dāng)游離存在時(shí), pSAM2 可以進(jìn)行滾環(huán)復(fù)制, 而 SLP1 可能進(jìn)行 Theta 型復(fù)制。細(xì)菌 Theta 型復(fù)制的質(zhì)?？梢苑譃閱蜗蚝碗p向復(fù)制, 復(fù)制蛋白、復(fù)制原點(diǎn)以及調(diào)控方式具有多樣性, 而鏈霉菌 Theta 型復(fù)制的質(zhì)粒報(bào)道較少。與大多數(shù)其它細(xì)菌不同的是, 利用脈沖場(chǎng)凝膠電泳技術(shù), 在鏈霉菌中檢測(cè)到線(xiàn)型結(jié)構(gòu)的染色體和質(zhì)粒, 在少數(shù)鏈霉菌菌株中檢測(cè)到多個(gè)線(xiàn)型質(zhì)粒。

已報(bào)道的鏈霉菌線(xiàn)型質(zhì)粒的大小從 12 kb 到 1 800 kb, 它們的端粒包含從 44 bp 到 180 kb 的倒轉(zhuǎn)重復(fù)序列。鏈霉菌線(xiàn)型染色體和線(xiàn)型質(zhì)粒雙鏈 DNA 的 5 端被末端蛋白共價(jià)結(jié)合, 而 3 端為游離末端。近年來(lái), 隨著亮發(fā)光桿菌大片段 DNA 檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展, 大的環(huán)型質(zhì)粒(常為 Theta 型復(fù)制, 如 SCP2、pFP11、pZL12、pFP4 和 pSV1 等)的分離和復(fù)制的研究進(jìn)展較快, 一些大質(zhì)粒上發(fā)現(xiàn)了完整功能的噬菌體片段。隨著高通量 DNA 測(cè)序技術(shù)的普及應(yīng)用, 過(guò)去難以開(kāi)展的質(zhì)粒的進(jìn)化及其分子機(jī)理的研究得以進(jìn)行。本文重點(diǎn)綜述鏈霉菌大的環(huán)型質(zhì)粒和線(xiàn)型質(zhì)粒的復(fù)制, 還將探討環(huán)型、線(xiàn)型質(zhì)粒與噬菌體的進(jìn)化關(guān)系。
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亮發(fā)光桿菌  

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