2016年5月2日,河北科技大學(xué)副教授韓春雨課題組在Nature Biotechnology上發(fā)表了關(guān)于NgAgo基因編輯技術(shù)的論文,引發(fā)了科學(xué)界的強烈關(guān)注。然而,從一開始被認(rèn)為是顛覆性的技術(shù),到不久后大批科學(xué)家表示無法重復(fù)這一研究成果,現(xiàn)在,NgAgo是否具有“基因編輯”功能還是個大大的問號。
圖片來源:Nature Biotechnology
關(guān)于這一事件的最新動向還停留在今年5月。5月9日,Nature Biotechnology(NBT)發(fā)布了一則“編輯部關(guān)切”。文中稱,NBT的編輯注意到了讀者們對有關(guān)NgAgo論文重復(fù)性的擔(dān)憂。此前NBT雜志也發(fā)布了韓國、德國、美國三個小組的研究結(jié)果(。他們試圖重復(fù)原始論文中關(guān)鍵的Figure 4中的結(jié)果。然而,沒有一個小組在任何位點或任何條件下觀察到任何由NgAgo誘導(dǎo)的突變。此外,另一個不同研究小組也在Protein & Cell雜志上報道了相似的結(jié)果(doi:10.1007/s13238-016-0343-9)。
NBT編輯部稱,他們已經(jīng)與原始論文的作者們進行聯(lián)系。作者們正在調(diào)查研究結(jié)果缺乏重復(fù)性的潛在原因,并已被通知NBT會發(fā)表這則聲明。一旦相關(guān)調(diào)查完成,NBT將會更新最新的進展。
同月20日,央視CCTV13《新聞?wù){(diào)查》欄目用43分鐘的長視頻對截止到當(dāng)時的事件發(fā)展過程和最新進展進行了報道。之后的兩個月,鮮有關(guān)于這一事件的最新報道。
最新成果:NgAgo可抑制乙肝病毒復(fù)制
近日,小編注意到,一個中國研究團隊發(fā)表了一項關(guān)于NgAgo的新成果。首先需要強調(diào)的是,該研究也未證實NgAgo的基因編輯功能。
圖片來源:Antiviral Research
具體來說,7月11日,發(fā)表在Antiviral Research雜志上題為“NgAgo-gDNA system efficiently suppresses hepatitis B virus replication through accelerating decay of pregenomic RNA”的論文中,來自山東大學(xué)等機構(gòu)的研究人員證實,NgAgo-gDNA系統(tǒng)能夠通過促進pgRNA(pregenomic RNA)的降解有效抑制乙肝病毒的復(fù)制。
該研究在結(jié)論中稱,這一研究結(jié)果首次證明了NgAgo/gDNA在抑制乙肝病毒復(fù)制方面的潛力。研究發(fā)現(xiàn),抑制效果明顯與gDNA靶向區(qū)域(gDNA targeting region)有關(guān)。此外,盡管HBsAg(hepatitis B surface antigen,乙肝表面抗原)、HBeAg(hepatitis B e-antigen,乙型肝炎E抗原)和pgRNA的水平明顯下降,但作者們未能檢測到NgAgo的任何DNA編輯能力。最后,作者們證明,NgAgo/gDNA顯著縮短了乙肝病毒pgRNA的半衰期。他們認(rèn)為,這些結(jié)果為將NgAgo/gDNA系統(tǒng)用于控制病毒感染提供有趣的線索。
前情回顧:基因敲低、切割RNA,反正就不是基因編輯
圖片來源:Cell Research
事實上,關(guān)于NgAgo的“非基因編輯”功能,去年Cell Research 雜志上的一篇論文也有報道。在這篇題為 NgAgo-based fabp11a gene knockdown causes eye developmental defects in zebrafish 的文章中,南通大學(xué)神經(jīng)再生重點實驗室副教授劉東團隊觀察到,NgAgo 確實可以改變斑馬魚的表型,但這并非是通過基因編輯實現(xiàn)的。團隊通過實驗得出結(jié)論,NgAgo 系統(tǒng)可以在不改變目標(biāo)基因序列的情況下,對基因表達實現(xiàn) knockdown(即下調(diào)其目標(biāo) mRNA 表達水平),且這可能與 NgAgo 的基因剪切活性沒有關(guān)系。
圖片來源:BioRxiv
此外,今年1月,在生命科學(xué)預(yù)印本網(wǎng)站BioRxiv上,來自韓國的一個研究小組發(fā)表的題為“DNA-dependent RNA cleavage by the Natronobacterium gregoryi Argonaute”的成果指出,NgAgo能作為一種DNA引導(dǎo)的核酸內(nèi)切酶切割RNA,而不是DNA。這意味著NgAgo或許可以作為“RNA干擾”的一種工具發(fā)揮作用。