Pikogreen dsDNA定量試劑盒(超敏)(兼容Qubit 3.0)產(chǎn)品描述
Pikogreen dsDNA 定量試劑盒(Pikogreen HighSensitivity dsDNA Quantitation Kit)不同于常規(guī)的基于吸光度的測量,這款試劑盒可以區(qū)分dsDNA、ssDNA或RNA,有選擇性地檢測dsDNA(見圖1)。與傳統(tǒng)DNA定量方法相比,該產(chǎn)品具有檢測范圍廣、高靈敏度、高特異性等優(yōu)點(diǎn)。試劑盒主要包含Pikogreen High Sensitivity dsDNA Quantitation Buffer, Enhancer solution以及pre-diluted dsDNA Standards三個(gè)組分,可以在200 uL體系內(nèi)定量0.2-100 ng的dsDNA(見圖2)。此外,試劑盒還可以將其他污染物的影響降低至zui低,可以耐受常規(guī)污染物例如蛋白質(zhì),鹽,有機(jī)溶劑和洗滌劑等(見表1),該試劑盒不具有細(xì)胞膜通透性,沒有細(xì)胞毒性和誘發(fā)突變性,對人體安全無害。
Pikogreen dsDNA定量試劑盒(超敏)(兼容Qubit 3.0) 產(chǎn)品組分
組分
D1101L1127
D1101L1126
A: Pikogreen High Sensitivity dsDNA Quantitation Solution
50 mL
250 mL
B: Pikogreen High Sensitivity dsDNA Enhancer, 100
1 mL
5 mL
C: dsDNA Standards 0 , 0.5, 1, 2 ,4 ,6, 8 and 10 ng/uL dsDNA from calf thymus
每組 0.1 mL(8組)
每組 0.5mL(8組)
技術(shù)參數(shù)
Ex/Em 485/530nm (結(jié)合dsDNA)
運(yùn)輸和保存方法
冰袋運(yùn)輸,4℃避光保存,推薦條件下至少可以儲(chǔ)存6個(gè)月
Pikogreen dsDNA定量試劑盒(超敏)(兼容Qubit 3.0)使用方法
1、為了得到zui佳結(jié)果,請使用精確校準(zhǔn)的移液器和去RNA酶的槍頭、試管以及檢測板。建議檢測時(shí)每個(gè)DNA標(biāo)樣和未知樣品都設(shè)定3個(gè)復(fù)孔。如果檢測時(shí)不只一塊96孔板,建議每塊96孔板都設(shè)定一條標(biāo)準(zhǔn)曲線,盡量減少檢測板之間的誤差。
2、使用前,將產(chǎn)品從儲(chǔ)存條件下取出恢復(fù)至室溫。如果100XEnchancer儲(chǔ)存液出現(xiàn)沉淀,可37℃水浴溶解。每個(gè)組分應(yīng)充分震蕩或渦旋混勻、離心,以免造成不必要的試劑損耗
3、每個(gè)待測樣品對應(yīng)200uL的Pikogreen工作液。對于一個(gè)96孔板,吸取200uL 100X Enchancer,加入到20mL Quantitation Solution 中,渦旋混勻,配置成Pikogreen工作液,為得到zui佳結(jié)果,工作液應(yīng)在一小時(shí)內(nèi)使用完畢。如果將工作液重新儲(chǔ)存并在24小時(shí)內(nèi)使用,結(jié)果的準(zhǔn)確性會(huì)有輕微損失。儲(chǔ)存過程中,增強(qiáng)液可能會(huì)出現(xiàn)沉淀現(xiàn)象,可以通過渦旋震蕩使其重懸。
4、對于每個(gè)樣品,吸取200 uL的工作液至黑色的96孔板微孔中。為確保結(jié)果精確可靠,建議每個(gè)測試樣品和DNA標(biāo)樣分別做平行的3個(gè)復(fù)孔,此過程也可以使用有精確量程的移液排槍進(jìn)行。黑色的檢測板可以減少各測試樣品間的熒光干擾。
5、在96孔板微孔中,每孔加入10 uL的dsDNA標(biāo)樣或未知樣品,并用移液器輕輕混勻。
6、將微孔板室溫避光孵育5-10分鐘,為得到zui佳結(jié)果,孵育結(jié)束后,應(yīng)立即讀取檢測板。也可以在6小時(shí)內(nèi)讀取數(shù)據(jù),但結(jié)果的精確性會(huì)有輕微損失。
7、使用激發(fā)波長和發(fā)射波長在485 nm和530 nm處的酶標(biāo)儀測量熒光值。
8、制作一條標(biāo)準(zhǔn)曲線,計(jì)算檢測樣品的DNA濃度(見圖2)。
注:圖2標(biāo)準(zhǔn)曲線僅供參考,您可以根據(jù)實(shí)際測得的數(shù)據(jù)自制標(biāo)準(zhǔn)曲線,從而求算樣品的濃度。
圖1:使用Pikogreen High Sensitivity dsDNA 定量試劑盒檢測不同類型核酸得到的相對熒光強(qiáng)度
圖2:使用Pikogreen Hig Sensitivity dsDNA 定量試劑盒制作的calf thymus DNA標(biāo)準(zhǔn)曲線(Ex/Em 485/530),左上角插圖顯示了低濃度DNA樣本測定的曲線圖。
Pikogreen dsDNA定量試劑盒(超敏)(兼容Qubit 3.0)注意事項(xiàng)
1、對于要檢測的植物或動(dòng)物來源的DNA樣本,小牛胸腺DNA(Calf thymus DNA )常常作為制作DNA標(biāo)樣的參照物。因?yàn)镃alf thymus DNA具有雙鏈結(jié)構(gòu)、高度聚合,堿基分配均勻(AT含量58%,GC42%)。如果檢測樣品的熒光值超過了標(biāo)準(zhǔn)曲線,那么需要將樣品做進(jìn)一步稀釋處理。為了保持結(jié)果的一致性,務(wù)必使每孔上樣量均等,且不含有其他高濃度的污染物。
2、Pikogreen High Sensitivity dsDNA 定量試劑盒可以測量范圍在0.2-100 ng的dsDNA。對于一些不需要線性檢測的樣品,試劑盒檢測范圍可以擴(kuò)展至200 ng。如需檢測更低含量的樣品,您可以將DNA標(biāo)樣用1 TE緩沖液作進(jìn)一步的稀釋,濃度可以稀釋到0.02 ng/uL,然后按照常規(guī)程序每孔10 uL上樣。
3、對于不同種類的檢測儀器,您可以優(yōu)化儀器設(shè)置,以獲取zui佳線性度。一些可能會(huì)影響zui終線性度和相對熒光強(qiáng)度的因素有(1)激發(fā)和發(fā)射波長與帶寬;(2)截止型濾波器;(3)靈敏度設(shè)置;(4)移液的準(zhǔn)確性;(5)微孔板制造商。
4、附表1. 詳細(xì)列出了幾種常見的DNA污染物,如鹽、溶劑、洗滌劑和蛋白質(zhì)等。
附表1. 常見的DNA污染物對 Pikogreen High Sensitivity dsDNA 定量試劑盒的影響
復(fù)合物
初始濃度
終濃度(200uL)
結(jié)果
醋酸銨
100 mM
5 mM
Pass
醋酸鈉
600 mM
30 mM
Pass
氯化鈉
200 mM
10 mM
Pass
氯化鎂
25 mM
1.25 mM
Pass
苯酚
2 %
0.1 %
Pass
乙醇
10 %
0.5 %
Pass
chlorofrom
2 %
0.1 %
Pass
十二烷基硫酸鈉(SDS)
0.2 %
0.01 %
Pass
Triton X-100
0.2 %
0.01 %
Pass
牛血清白蛋白(BSA)
200 mg/mL
10 mg/mL
Pass*
dNTPs**
2 mM
100 uM
Pass
聚乙二醇
40 %
2 %
Pass
瓊脂糖
2 %
0.1 %
Pass
注:三份dsDNA平行樣品的標(biāo)準(zhǔn)曲線,分別在上述含有指定濃度污染物的條件下(初始濃度進(jìn)行檢測, Pass 指與沒有污染物的體系相比較,實(shí)驗(yàn)結(jié)果變化范圍 20%。所有樣品用Molecular DevicesGemini XS酶標(biāo)儀在485 nm處激發(fā),在530 nm處測熒光強(qiáng)度。 Pass * 指由此條件測得的標(biāo)準(zhǔn)曲線有少許變動(dòng)。 dNTPs** 指dATP, dCTP, dGTP, dTTP的混合物。