亚洲欧美日本韩国_久久久久亚洲AV片无码V_亚洲AV片不卡无码一_H漫全彩纯肉无码网站

 
 
當前位置: 首頁 » 新聞資訊 » 廠商 » 正文

脂肪肝m6A甲基化修飾的差異——中國生物器材網(wǎng)

分享到:
放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2019-08-16  來源:儀器信息網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):771
RNA甲基化研究持續(xù)升溫,高分文章不斷涌現(xiàn),m6A作為其中最耀眼的那顆星,受到眾多科研工作者的追捧。目前已有的研究表明m6A在細胞加速mRNA代謝和翻譯,以及在細胞分化、胚胎發(fā)育和壓力應答等過程中起重要作用。但深入的研究m6A作用機制需要耗費較多的時間和精力,那有沒有辦法在短期內快速發(fā)表m6A的研究文章呢?今天小編就為大家?guī)硪黄菩蚩蛻舭l(fā)表的關于高脂喂養(yǎng)的小鼠和正常小鼠肝臟中m6A甲基化差異表達的研究,教你如何快速發(fā)表m6A甲基化譜文章。
m6A甲基化修飾是一個動態(tài)可逆的過程,涉及到三類重要的甲基化酶:甲基化轉移酶(METTL14、METTL3、WTAP等),去甲基化酶(FTO、ALKBH5等),識別蛋白(YTHDF1-3、YTHDC1/2等)。其中FTO是一個肥胖易感基因,能夠促進脂肪的產(chǎn)生;體外敲除METTL 3或YTHDF2可減少脂肪的積累,這些研究結果暗示m6A修飾可能在脂質代謝中起關鍵作用。作者研究了高脂飲食(HFD)誘導的小鼠脂肪肝和正常小鼠肝臟中m6A甲基化修飾,發(fā)現(xiàn)兩者之間存在較大的差異,且差異m6A甲基化可能通過RNA結合蛋白作用于功能基因,調節(jié)脂肪肝的脂質代謝。
原文鏈接:Comprehensive analysis of differences of N6-methyladenosine RNA methylomes between high-fat-fed and normal mouse livers
發(fā)表期刊:Epigenomics
實驗方法:云序生物  m6A MeRIP seq
實驗材料:小鼠 肝臟組織
1.mRNAs中m6A甲基化修飾的概況
作者對正常組(CK)和高脂喂養(yǎng)8周后的小鼠(HFD)進行了兩個指標血糖和肝甘油三酯檢測,發(fā)現(xiàn)HFD組的均顯著高于CK組,表明高脂喂養(yǎng)確實會導致小鼠的脂肪肝(圖1A B)。隨后作者采用抗體富集法m6A MeRIP seq(云序提供此服務)對兩組小鼠的肝臟組織進行m6A甲基化測序,發(fā)現(xiàn)兩組中mRNA上共有1984個m6A甲基化修飾的峰,CK組中特有5534個m6A甲基化修飾的峰,HFD組中特有8238個m6A甲基化修飾的峰(圖1C);70%以上的被修飾的基因只有1個m6A峰(圖1D);并且這些修飾位點多數(shù)存在于CDS區(qū)(圖1E);在CK組中,甲基化富集度最高的是終止密碼子區(qū),在HFD中,甲基化富集度最高的是5 UTR區(qū)(圖1F)。
圖1 CK組和HFD組mRNAs中m6A甲基化修飾的概況 2.差異m6A修飾位點的分布
作者比較兩組甲基化修飾的RNA后,發(fā)現(xiàn)mRNA上有554個差異甲基化m6A位點(DMMS),LncRNA上有334個DMMS,并將這些DMMS都映射到了染色體上(圖2A);并將染色體的長度歸一化后,計算染色體所包含的DMMS的數(shù)量發(fā)現(xiàn)11染色體上m6A修飾密度最高(圖2B)。進一步分析顯示,mRNA內的大多數(shù)DMMS都在CDS內(圖2C)。此外,上調的甲基化位點在5 UTR區(qū)的變化倍數(shù)最高,下調的甲基化位點在CDS區(qū)的變化倍數(shù)最高(圖2D)。
圖2 差異m6A修飾位點的分布 3.差異甲基化mRNA的功能富集分析
為了研究m6A在HFD誘導的小鼠脂肪肝中的作用,將含有差異甲基化位點的基因進行GO富集和KEGG通路分析。在GO的BP分類中,差異上調的甲基化基因在脂肪酸代謝、細胞脂代謝、脂肪酸反應和TG代謝等脂質代謝相關過程中顯著富集(圖3A),差異下調的甲基化基因在代謝過程、肽代謝、翻譯等過程中高度富集(圖3B)。在KEGG中,差異上調的甲基化基因與脂質代謝相關的信號通路顯著相關(如PPAR信號通路、脂肪酸降解和脂肪酸代謝(圖3C),差異下調的甲基化基因則參與了核糖體過程、類固醇激素生物合成等信號通路(圖3D)。上述分析結果表明m6A甲基化修飾可能在飲食誘導的小鼠脂肪肝中起重要作用,主要通過脂代謝和翻譯途徑發(fā)揮作用。
圖3 差異甲基化位點的GO和KEGG分析 4.差異甲基化mRNAs的分子機制預測
了解m6A甲基化修飾能夠通過影響某些基因的甲基化程度,從而影響脂肪代謝,那么問題來了,甲基化是如何作用于這些基因的呢?
RNA結合蛋白(RNA Binding Protein)簡稱 RBP ,是一類伴隨RNA的調控代謝過程,與RNA結合的蛋白質的總稱,在mRNA成熟、轉運、定位和翻譯過程中發(fā)揮重要作用。前人研究發(fā)現(xiàn)RBP的結合區(qū)和甲基化修飾位點之間存在一定的聯(lián)系。為此,作者研究了差異m6A甲基化修飾的那些基因的潛在RBP,共發(fā)現(xiàn)25種RNA結合蛋白(圖4A)。針對這些RBP的結合區(qū)做motif分析發(fā)現(xiàn)這些序列高度富集在RRACH序列上,與m6A修飾位點的motif高度一致,根據(jù)RBP結合的m6A位點在總的差異甲基化位點中所占的百分比,繪制熱圖,表明TAF 15、Ago 2和Mbnl 3具有相似的分布模式(圖4A)。
然后進行GO富集分析,確定RBP基因的功能。在BP分類中,RBP基因主要富集在與RNA剪接、沉默、翻譯和穩(wěn)定相關的過程(圖4B)。GO分析結果提示差異甲基化基因的RBPs在基因表達中起著關鍵作用,m6A甲基化可能通過占據(jù)RBP的結合位點,影響mRNA的基因表達,從而調控脂質代謝。
圖4 RBPs與差異m6A甲基化位點的潛在結合分析 總結:
為探討高脂飲食(HFD)誘導小鼠脂肪肝中m6A甲基化修飾的變化。作者采用MeRIP-seq技術,鑒定HFD誘導的正常肝和脂肪肝m6A甲基化修飾的差異。發(fā)現(xiàn)與對照組相比,喂食HFD后,m6A甲基化修飾差異上調的基因主要在脂質代謝過程中富集,m6A甲基化修飾差異下調的基因主要在代謝和翻譯過程中富集。此外,許多可能與不同甲基化m6A位點結合的RNA結合蛋白主要在RNA剪接過程中被注釋,表明m6A甲基化差異可能通過RNA結合蛋白作用于功能基因,調節(jié)脂肪肝脂質代謝。本研究對小鼠脂肪肝中m6A甲基化的差異進行了研究,提示m6A甲基化與肝臟脂質代謝的調控密切相關,為今后改善脂肪肝代謝的研究提供了基礎。 云序生物m6A RNA甲基化測序技術服務:
云序生物提供m6A MeRIP測序,可通過m6A特異性抗體,抓取有甲基化修飾的片段進行測序,對m6A修飾進行高通量測序和peak峰定位。此外,云序生物針對m6A RNA甲基化開發(fā)了多款產(chǎn)品,可實現(xiàn)對mRNA、LncRNA、circRNA和pri-miRNA等多類RNA分子的m6A甲基化修飾水平的全面檢測。 云序優(yōu)勢
國內首發(fā)10分RNA甲基化文章平臺
率先實現(xiàn)超微量技術,低至500ng
全分子覆蓋(circRNA,lncRNA,mRNA等)
全物種覆蓋(動物、植物全覆蓋)
一站式服務(RNA抽提-建庫-測序-數(shù)據(jù)分析-機制實驗)
m6A MeRIP測序流程圖 云序生物RNA表觀修飾:
云序作為一家依托于高通量測序的表觀轉錄組學科研服務公司,長期致力于提供優(yōu)質前沿表觀研究測序產(chǎn)品,繼m6A、m5C、m1A之后,云序隆重推出多款RNA新修飾,不僅m7G測序,還包括m3C測序、ac4C RNA乙?;瘻y序、2 -O-甲基化測序產(chǎn)品,打造了全面的RNA修飾研究平臺。 云序生物,您身邊的測序專家! 相關產(chǎn)品:
Shanghai Cloud-seq Biotech Co., Ltd.
地址:上海市松江區(qū)莘磚公路 518 號 20 號樓 3 樓
電話:021-64878766
傳真:021-64878766
網(wǎng)址:www.cloud-seq.com.cn
郵箱:market@cloud-seq.com.cn
 
 
 
打賞
[ 新聞資訊搜索 ]  [ 加入收藏 ]  [ 告訴好友 ]  [ 打印本文 ]  [ 違規(guī)舉報 ]  [ 關閉窗口 ]
免責聲明:
本網(wǎng)站部分內容來源于合作媒體、企業(yè)機構、網(wǎng)友提供和互聯(lián)網(wǎng)的公開資料等,僅供參考。本網(wǎng)站對站內所有資訊的內容、觀點保持中立,不對內容的準確性、可靠性或完整性提供任何明示或暗示的保證。如果有侵權等問題,請及時聯(lián)系我們,我們將在收到通知后第一時間妥善處理該部分內容。
 

脂肪肝m6A甲基化修飾的差異——中國生物器材網(wǎng)二維碼

掃掃二維碼用手機關注本條新聞報道也可關注本站官方微信賬號:"xxxxx",每日獲得互聯(lián)網(wǎng)最前沿資訊,熱點產(chǎn)品深度分析!
 

 
0相關評論

 
成品人视频ww入口| 日韩日韩日韩日韩日韩| 国产午夜福利短视频| 色综合色狠狠天天综合色| 极品人妻被黑人中出种子| 无码午夜人妻一区二区三区不卡视频| 先锋中文字幕在线资源| 第一次处破女18分钟高清| 内射毛片内射国产夫妻| 女厕厕露p撒尿八个少妇| 国产三区在线成人av| 日本一道综合久久aⅴ免费| 中文字幕乱码人妻无码久久| 久久精品人妻一区二区三区| 人妻少妇精品视频无码专区| 亚洲精品tv久久久久久久久久| 国产又黄又硬又粗| 亚洲国产欧美在线看片一国产| a级毛片100部免费观看| 绝顶潮喷绝叫在线观看| 插鸡网站在线播放免费观看| 男女男精品免费视频网站 | 人妻精品久久无码区| 免费看男阳茎进女阳道动态图| 熟女精品视频一区二区三区| 疯狂三人交性欧美| 毛茸茸性xxxx毛茸茸毛茸茸| 天天爽夜夜爽人人爽一区二区| 丰满少妇被猛烈进av毛片| 台湾佬娱乐中文22vvvv| 久久精品无码av| 女人无遮挡裸交性做爰| 欧美亚洲国产精品久久高清| 岳好紧好湿夹太紧了好爽矜持| 377p日本欧洲亚洲大胆张筱雨| 国产麻豆剧果冻传媒一区| 亚洲人成网站在线播放2019| 非洲黑人性xxxx精品| 亚洲人成无码网站久久99热国产| 日产精品卡三卡在线| 亚洲老妇色熟女老太|