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斑馬魚(yú)的基因敲除定制(Cas9

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2019-08-05  來(lái)源:儀器信息網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):347
利用 CRISPR/Cas9 技術(shù),針對(duì)靶基因序列設(shè)計(jì) sgRNA, 指導(dǎo) Cas9 蛋白在特定基因位點(diǎn)引起 DNA 雙鏈斷裂,在非同源性末端接合修復(fù)斷裂 DNA 的過(guò)程中,靶基因堿基突變或缺失被引入到斑馬魚(yú)基因組中,最終導(dǎo)致靶基因無(wú)法正常轉(zhuǎn)錄翻譯,達(dá)到基因敲除的目的。目前我們利用 CRISPR/Cas9 技術(shù),提供 TU 品系的基因敲除斑馬魚(yú)制備,TU 系是最為普遍使用的標(biāo)準(zhǔn)純遺傳背景品系之一。同時(shí)也可根據(jù)委托方的需求,提供 AB 以及其它遺傳背景的基因敲除斑馬魚(yú)服務(wù)。 
分析目標(biāo)基因的基因組結(jié)構(gòu),確定目標(biāo)基因靶向位置 通過(guò)Sanger測(cè)序,確認(rèn)目標(biāo)基因靶向位置序列信息準(zhǔn)確 根據(jù)每個(gè)目標(biāo)基因的靶向突變位置,設(shè)計(jì)并體外合成4條不同的sgRNA 制備Cas9 mRNA或蛋白質(zhì) 鑒定所制備的4條sgRNA是否具有在斑馬魚(yú)胚胎內(nèi)引導(dǎo)Cas9切割目標(biāo)基因的活性 將有活性的sgRNA和Cas9 mRNA(或蛋白質(zhì))共同注射斑馬魚(yú)受精卵 待注射胚胎生長(zhǎng)至6 hpf后,隨機(jī)選取5枚胚胎,確認(rèn)Founder胚胎細(xì)胞攜帶目標(biāo)基因突變的等位基因 將經(jīng)注射的受精卵飼養(yǎng)至45-60日齡時(shí),通過(guò)對(duì)尾鰭的基因組鑒定確認(rèn)Founder(F0)體細(xì)胞攜帶目標(biāo)基因突變的等位基因 獲得F0的后代F1代 至45-60日齡時(shí),通過(guò)剪尾鰭的方法進(jìn)行基因型鑒定,篩選F1個(gè)體,獲得基因敲除突變體
提供可有效識(shí)別 基因的靶向突變位置基因組序列的sgRNA不少于1條 提供攜帶 基因靶向突變的雜合子(當(dāng)純合突變不致死時(shí),可能是兩個(gè)等位因均突變的純合突變子)斑馬魚(yú)(不小于1月齡) 3 尾(基因型可不相同)。
2.3上述突變體中,目標(biāo)基因的突變應(yīng)在外顯子所在區(qū)域,位于起始密碼子后,其突變類型為插入或缺失(Indel)突變,且應(yīng)是移碼突變,導(dǎo)致目標(biāo)基因編碼序列出現(xiàn)提前的終止密
碼子,預(yù)期編碼一個(gè)截短蛋白;或者,突變的位置由客戶指定,經(jīng)乙方認(rèn)定可行后,實(shí)施靶向改造,造成插入或缺失(Indel)突變。
2.4提供上述突變的目標(biāo)基因等位基因的基因型(附有測(cè)序報(bào)告);
2.5提供鑒定上述突變體的鑒定方法; 提供階段性項(xiàng)目進(jìn)展報(bào)告 提供上述基因靶向突變的斑馬魚(yú)突變體建立過(guò)程的技術(shù)服務(wù)項(xiàng)目總結(jié)報(bào)告。
 
關(guān)鍵詞: 基因 目標(biāo) 胚胎 靶向 尾鰭
 
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斑馬魚(yú)的基因敲除定制(Cas9二維碼

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