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Nucleic Acids Research:脂肪生成的表觀調控機制——中國生物器材網

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2019-06-14  來源:儀器信息網  作者:Mr liao  瀏覽次數:582

肥胖和2型糖尿病的全球發(fā)病率在過去的30年中顯著增加,已嚴重危害人們的生命健康。脂肪組織被認為與該類疾病相關,因此操縱脂肪細胞的分化和成熟有望用于臨床治療。大量研究已闡明轉錄和表觀遺傳(DNA和組蛋白修飾)在脂肪發(fā)生過程中的重要作用,但是對于轉錄后調控如何影響脂肪生成,尚不清楚。

近日,華中農業(yè)大學的研究人員在這一領域取得了新進展。華中農業(yè)大學動物科學技術學院的博士研究生宋彤星和楊陽為并列第一作者,彭健和蔣思文教授為共同通訊作者。他們在《Nucleic Acids Research》上發(fā)表了題為 Zfp217 mediates m6A mRNA methylation to orchestrate transcriptional and posttranscriptional regulation to promote adipogenic differentiation 的文章,首次發(fā)現了ZFP217直接激活m6A去甲基化酶FTO的表達,并結合m6A閱讀蛋白YTHDF2,促進FTO對m6A mRNA的結合,從而促進脂肪細胞的分化。

鋅指蛋白217(Zfp217)是眾所周知的致癌蛋白,在多種癌癥中上調,對胚胎干細胞的分化至關重要。值得注意的是,Zfp217將基因轉錄與新生RNA上的m6A修飾緊密關聯,表明Zfp217在協調表觀遺傳和表觀轉錄組網絡中起關鍵作用。于是,研究人員猜測Zfp217可能通過調節(jié)m6A修飾而加速脂肪生成。

Zfp217抑制導致m6A修飾的增加

為了探索Zfp217在成脂分化中的作用,研究人員首先利用siRNA開展了功能缺失實驗。Zfp217的敲低明顯阻斷了脂肪生成,表現為油紅O染色水平下降,以及關鍵成脂基因PPAR 、aP2、LPL和脂聯素的表達水平降低。此外,利用CRISPR-Cas9系統(tǒng)完全敲除Zfp217基因后,3T3L1細胞中的脂肪生成完全被破壞。此外,他們還委托賽業(yè)生物(Cyagen)制備了Zfp217敲除小鼠,發(fā)現Zfp217+/-小鼠胚胎成纖維細胞的脂肪生成減少。這些結果表明Zfp217對成脂分化有著重要的影響。

為了篩查Zfp217在3T3L1細胞中的功能,研究人員通過斑點印跡和液相色譜串聯質譜(LC-MS/MS)檢測了mRNA中的m6A修飾。與對照組相比,利用siRNA和CRISPR-Cas9系統(tǒng)處理后,3T3L1細胞中的m6A水平總體上增加(圖1)。與野生型細胞相比,Zfp217+/-小鼠胚胎成纖維細胞的m6A修飾也明顯增加。這些結果表明Zfp217對細胞m6A RNA甲基化至關重要。

圖1. Zfp217抑制導致3T3L1細胞中的m6A修飾增加

 

Zfp217直接激活FTO的轉錄

盡管Zfp217的失活影響了m6A修飾,但Zfp217本身并不是甲基轉移酶或去甲基化酶,那么Zfp217如何抑制m6A mRNA甲基化?于是,研究人員檢測了與m6A甲基化相關的關鍵蛋白的表達。有意思的是,Zfp217被敲低后,甲基轉移酶METTL3的表達增高,而去甲基化酶FTO的表達降低。進一步的研究表明,FTO的mRNA水平受到Zfp217過表達或敲低的調控。于是,他們想驗證Zfp217是否作為轉錄因子調控FTO的表達。

研究人員利用雙熒光素酶報告系統(tǒng)來驗證Zfp217增強了FTO的啟動子活性,而FTO啟動子上結合序列的缺失抑制了其活性,說明Zfp217對FTO的直接調控(圖2)。同時,FTO拯救了因缺乏Zfp217而造成的脂肪生成受阻,并增加了PPAR 、aP2、LPL和脂聯素的表達。這些結果表明,Zfp217作為轉錄因子與FTO基因的啟動子結合,以增強脂肪生成。

 

圖2. Zfp217激活了FTO的轉錄

 

Zfp217與YTHDF2發(fā)生相互作用

之前的報道稱,Zfp217通過與胚胎發(fā)育和腫瘤中的其他蛋白質相互作用而發(fā)揮其功能。為了進一步探索Zfp217促進脂肪生成的分子機制,研究人員又開展了免疫沉淀(Co-IP)實驗。他們在3T3L1細胞和HEK293T細胞中都發(fā)現了Zfp217和YTHDF2之間的特異性相互作用。

為了確認亞細胞相互作用,他們分離出細胞核和細胞質組分來測定Zfp217和YTHDF2表達。他們發(fā)現,這兩種蛋白質都分布在整個細胞中,不過Zfp217在細胞質中的表達比細胞核更多。此外,共聚焦顯微鏡分析也觀察到兩種蛋白質同時位于細胞核和細胞質中,表明YTHDF2可能在Zfp217依賴的脂肪生成中發(fā)揮特定功能。

以往的研究發(fā)現,YTHDF2在熱應激下可通過抑制FTO活性來維持m6A的水平。于是,研究人員進一步分析了YTHDF2和Zfp217與FTO之間的相互作用。正如預期,FTO和Zfp217的過表達都顯示出較低的m6A水平,且YTHDF2阻斷了FTO的去甲基化酶活性,而Zfp217作為調控因子,讓平衡傾向于去甲基化(圖3)。
 

圖3. Zfp217影響了YTHDF2和FTO之間的競爭

 

此外,他們通過m6A RNA pull-down實驗證實了FTO和YTHDF2在靶向m6A ssRNA上的直接競爭關系。顯然,不與RNA結合的Zfp217干擾YTHDF2的位置,讓FTO與RNA結合。后續(xù)的實驗也證明,Zfp217與YTHDF2發(fā)生相互作用,以維持FTO的m6A去甲基化活性。

總的來說,該研究證明ZFP217在轉錄(激活FTO)和轉錄后(影響mRNA m6A修飾)水平參與脂肪生成的重要作用,并發(fā)現創(chuàng)造性的提出了ZFP217影響m6A閱讀蛋白YTHDF2和擦除器FTO競爭性結合靶mRNA的作用模型,為深入了解m6A的動態(tài)調控過程提出了新的思路。

 

圖4. Zfp217在脂肪生成中調控m6A修飾的示意圖

這是國際上首次報道RNA表觀修飾調控脂肪細胞生成的分子機制,是對脂肪細胞生成調控機制的全新認識,對拓展相關研究領域具有重要意義。

 
 
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