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新型腫瘤標(biāo)志物篩選利器-----ctDNA（羥）甲基化測(cè)序
cfDNA（Cell free DNA）是人體組織排放到血液、尿液或腦脊液等循環(huán)體系中降解的DNA小片段，是一種新型的分子標(biāo)記物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指來(lái)源于腫瘤細(xì)胞的cfDNA，是液體活檢主流方向。
最新的報(bào)道表明：ctDNA（羥）甲基化不僅可以作為腫瘤分子標(biāo)志物，還可用于追溯腫瘤細(xì)胞的組織來(lái)源。在精準(zhǔn)醫(yī)療大趨勢(shì)下，ctDNA（羥）甲基化檢測(cè)既具有極高的科研價(jià)值，又具備推進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)療臨床實(shí)踐的巨大潛能，為實(shí)現(xiàn)腫瘤臨床治療的全病程管理提供強(qiáng)有力的支持。利用ctDNA（羥）甲基化測(cè)序，僅憑一管液體就可以進(jìn)行腫瘤診斷、療效評(píng)估、實(shí)時(shí)監(jiān)控、個(gè)體化用藥、預(yù)測(cè)復(fù)發(fā)等，是里程碑式的新型液體活檢技術(shù)。
云序生物率先推出ctDNA（羥）甲基化測(cè)序服務(wù)，最低僅需1ng ctDNA即可進(jìn)行測(cè)序?？蛻魞H需提供血漿、血清或體液樣本，云序生物為您提供從ctDNA提取、文庫(kù)制備、上機(jī)測(cè)序到數(shù)據(jù)分析整套服務(wù)流程。
圖1. ctDNA（羥）甲基化來(lái)源 最具臨床應(yīng)用前景的分子標(biāo)志物---ctDNA（羥）甲基化
圖2. ctDNA（羥）甲基化研究應(yīng)用范圍 1.癌癥早篩利器：ctDNA（羥）甲基化在癌癥早篩領(lǐng)域具有重大研究前景。 2.鑒定癌癥有效手段：ctDNA（羥）甲基化在癌癥、疾病和正常組間存在顯著差異。 3.助力藥物或其他手段治療效果評(píng)估：在治療過(guò)程中，ctDNA（羥）甲基化水平與癌細(xì)胞數(shù)量呈正比，可用于協(xié)助評(píng)估用藥療效、復(fù)發(fā)及治療后期轉(zhuǎn)移動(dòng)態(tài)的監(jiān)測(cè)。
高分文章利器-----ctDNA（羥）甲基化
圖3. 近年來(lái)已發(fā)表期刊（部分）
圖4. 高分期刊評(píng)語(yǔ)（ctDNA（羥）甲基化適用于分子標(biāo)志物） 案例解析
案例1：ctDNA甲基化可作為肝癌診斷和進(jìn)程的分子標(biāo)志物
原文：Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma
期刊：Nature Materials 影響因子：39
本篇文章由美國(guó)加州大學(xué)圣地亞哥分校教授張康與廣州中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院院長(zhǎng)徐瑞華團(tuán)隊(duì)一同合作完成，通過(guò)對(duì)比肝癌患者血漿、組織及健康人白細(xì)胞中ctDNA甲基化分布情況，發(fā)現(xiàn)肝癌患者體內(nèi)血漿和組織一致性很高。通過(guò)1,098位肝癌患者和835位健康者的ctDNA甲基化情況及病理信息為資源庫(kù)，建立了疾病預(yù)測(cè)分析模型，結(jié)果顯示該模型基因的特異性、敏感性與腫瘤狀態(tài)、診斷反應(yīng)和時(shí)期顯著相關(guān)（P＜0.001）。與此同時(shí)，作者還構(gòu)建了診斷結(jié)果預(yù)測(cè)模型，該模型的基因可用于預(yù)測(cè)疾病診斷和生存時(shí)期的分子標(biāo)志物（P＜0.001）。總的來(lái)說(shuō)，ctDNA甲基化作為分子標(biāo)志物，在肝癌診斷、患者生存和進(jìn)展過(guò)程中發(fā)揮著重大意義。 圖1. 在前期建模結(jié)果中找到10個(gè)差異甲基化基因，用于肝癌的早期診斷檢測(cè)，特異性高達(dá)85.7%以上
圖2. 聚類(lèi)圖顯示ctDNA甲基化可區(qū)分疾病和正常組
圖3. ctDNA甲基化應(yīng)用：區(qū)分疾病與正常組、成瘤與否、治療前后對(duì)比、手術(shù)后是否復(fù)發(fā)、癌癥的分期和進(jìn)一步確定傳統(tǒng)分子標(biāo)志物的準(zhǔn)確性 案例2：ctDNA羥甲基化可作為人類(lèi)癌癥診斷的分子標(biāo)志物
原文：5-Hydroxymethylcytosine signatures in circulating cell-free DNA as diagnostic biomarkers for human cancers
期刊：Cell Research 影響因子：15
本篇文章由復(fù)旦大學(xué)華山醫(yī)院的劉杰教授課題組與芝加哥大學(xué)何川教授課題組合作，檢測(cè)了不同癌癥樣本中ctDNA羥甲基化分布和水平。本文通過(guò)ctDNA羥甲基化檢測(cè)技術(shù)，在全基因組范圍內(nèi)，檢測(cè)癌癥與健康人中ctDNA羥甲基化的水平。檢測(cè)的癌癥類(lèi)型包括腸癌、胃癌、胰腺癌、肝癌、甲狀腺癌，檢測(cè)組織類(lèi)型包括癌癥及癌旁組織、血漿和白血球。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，5hmC主要分布在基因組的轉(zhuǎn)錄活性區(qū)，可能與開(kāi)放染色質(zhì)和允許組蛋白修飾相關(guān)。同時(shí)，5hmC對(duì)特定癌癥類(lèi)型高敏感，如腸癌和胃癌。總的來(lái)說(shuō)，ctDNA羥甲基化檢測(cè)為日后僅通過(guò)血漿樣本進(jìn)行無(wú)創(chuàng)診斷奠定了良好的基礎(chǔ)。 圖1. 不同類(lèi)型疾病，ctDNA羥甲基化都可用于分子標(biāo)志物研究
圖2. ctDNA羥甲基化可區(qū)分組織類(lèi)型
圖3. 在腸癌和健康組中，單個(gè)基因羥甲基化水平的一致性很高
圖4. 腸癌的不同分期中，ctDNA羥甲基化水平不同 圖5. 胃癌及腸癌的ctDNA羥甲基化檢出率很高 技術(shù)優(yōu)勢(shì)
一站式服務(wù)：客戶只需提供樣本，云序生物為您完成從ctDNA提取、文庫(kù)制備、上機(jī)測(cè)序到數(shù)據(jù)分析整套服務(wù)流程。
特異性富集ctDNA片段：云序生物具有豐富樣本處理經(jīng)驗(yàn)，采用最新ctDNA捕獲試劑盒，富集效率高。
嚴(yán)格質(zhì)控流程：云序生物質(zhì)控流程嚴(yán)格，層層把關(guān)，為客戶提供高準(zhǔn)確度的結(jié)果。
專(zhuān)業(yè)化生物信息分析：云序生物強(qiáng)大的生物信息團(tuán)隊(duì)，可以滿足客戶個(gè)性化數(shù)據(jù)分析要求。
樣本要求
1）樣品類(lèi)型：血清、血漿、體液等。其他樣本類(lèi)型請(qǐng)?jiān)斣儭?br> 2）樣品量：
血清或血漿：
體液：請(qǐng)?jiān)斣儭?br> 3）樣品保存：
血清、血漿、體液樣品，可用液氮速凍后-80℃保存，樣品保存期間避免反復(fù)凍融。
4）樣品運(yùn)輸：樣品置于1.5 mL管中，封口膜封好，干冰運(yùn)輸。 云序相關(guān)產(chǎn)品推薦:
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圖1. ctDNA（羥）甲基化來(lái)源 最具臨床應(yīng)用前景的分子標(biāo)志物---ctDNA（羥）甲基化
圖2. ctDNA（羥）甲基化研究應(yīng)用范圍 1.癌癥早篩利器：ctDNA（羥）甲基化在癌癥早篩領(lǐng)域具有重大研究前景。 2.鑒定癌癥有效手段：ctDNA（羥）甲基化在癌癥、疾病和正常組間存在顯著差異。 3.助力藥物或其他手段治療效果評(píng)估：在治療過(guò)程中，ctDNA（羥）甲基化水平與癌細(xì)胞數(shù)量呈正比，可用于協(xié)助評(píng)估用藥療效、復(fù)發(fā)及治療后期轉(zhuǎn)移動(dòng)態(tài)的監(jiān)測(cè)。
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案例1：ctDNA甲基化可作為肝癌診斷和進(jìn)程的分子標(biāo)志物
原文：Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma
期刊：Nature Materials 影響因子：39
本篇文章由美國(guó)加州大學(xué)圣地亞哥分校教授張康與廣州中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院院長(zhǎng)徐瑞華團(tuán)隊(duì)一同合作完成，通過(guò)對(duì)比肝癌患者血漿、組織及健康人白細(xì)胞中ctDNA甲基化分布情況，發(fā)現(xiàn)肝癌患者體內(nèi)血漿和組織一致性很高。通過(guò)1,098位肝癌患者和835位健康者的ctDNA甲基化情況及病理信息為資源庫(kù)，建立了疾病預(yù)測(cè)分析模型，結(jié)果顯示該模型基因的特異性、敏感性與腫瘤狀態(tài)、診斷反應(yīng)和時(shí)期顯著相關(guān)（P＜0.001）。與此同時(shí)，作者還構(gòu)建了診斷結(jié)果預(yù)測(cè)模型，該模型的基因可用于預(yù)測(cè)疾病診斷和生存時(shí)期的分子標(biāo)志物（P＜0.001）。總的來(lái)說(shuō)，ctDNA甲基化作為分子標(biāo)志物，在肝癌診斷、患者生存和進(jìn)展過(guò)程中發(fā)揮著重大意義。 圖1. 在前期建模結(jié)果中找到10個(gè)差異甲基化基因，用于肝癌的早期診斷檢測(cè)，特異性高達(dá)85.7%以上
圖2. 聚類(lèi)圖顯示ctDNA甲基化可區(qū)分疾病和正常組
圖3. ctDNA甲基化應(yīng)用：區(qū)分疾病與正常組、成瘤與否、治療前后對(duì)比、手術(shù)后是否復(fù)發(fā)、癌癥的分期和進(jìn)一步確定傳統(tǒng)分子標(biāo)志物的準(zhǔn)確性 案例2：ctDNA羥甲基化可作為人類(lèi)癌癥診斷的分子標(biāo)志物
原文：5-Hydroxymethylcytosine signatures in circulating cell-free DNA as diagnostic biomarkers for human cancers
期刊：Cell Research 影響因子：15
本篇文章由復(fù)旦大學(xué)華山醫(yī)院的劉杰教授課題組與芝加哥大學(xué)何川教授課題組合作，檢測(cè)了不同癌癥樣本中ctDNA羥甲基化分布和水平。本文通過(guò)ctDNA羥甲基化檢測(cè)技術(shù)，在全基因組范圍內(nèi)，檢測(cè)癌癥與健康人中ctDNA羥甲基化的水平。檢測(cè)的癌癥類(lèi)型包括腸癌、胃癌、胰腺癌、肝癌、甲狀腺癌，檢測(cè)組織類(lèi)型包括癌癥及癌旁組織、血漿和白血球。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，5hmC主要分布在基因組的轉(zhuǎn)錄活性區(qū)，可能與開(kāi)放染色質(zhì)和允許組蛋白修飾相關(guān)。同時(shí)，5hmC對(duì)特定癌癥類(lèi)型高敏感，如腸癌和胃癌。總的來(lái)說(shuō)，ctDNA羥甲基化檢測(cè)為日后僅通過(guò)血漿樣本進(jìn)行無(wú)創(chuàng)診斷奠定了良好的基礎(chǔ)。 圖1. 不同類(lèi)型疾病，ctDNA羥甲基化都可用于分子標(biāo)志物研究
圖2. ctDNA羥甲基化可區(qū)分組織類(lèi)型
圖3. 在腸癌和健康組中，單個(gè)基因羥甲基化水平的一致性很高
圖4. 腸癌的不同分期中，ctDNA羥甲基化水平不同 圖5. 胃癌及腸癌的ctDNA羥甲基化檢出率很高 技術(shù)優(yōu)勢(shì)
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專(zhuān)業(yè)化生物信息分析：云序生物強(qiáng)大的生物信息團(tuán)隊(duì)，可以滿足客戶個(gè)性化數(shù)據(jù)分析要求。
樣本要求
1）樣品類(lèi)型：血清、血漿、體液等。其他樣本類(lèi)型請(qǐng)?jiān)斣儭?br> 2）樣品量：
血清或血漿：
體液：請(qǐng)?jiān)斣儭?br> 3）樣品保存：
血清、血漿、體液樣品，可用液氮速凍后-80℃保存，樣品保存期間避免反復(fù)凍融。
4）樣品運(yùn)輸：樣品置于1.5 mL管中，封口膜封好，干冰運(yùn)輸。 云序相關(guān)產(chǎn)品推薦:
