更新時(shí)間:2019-06-14 16:02:33417
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TruSeq Stranded mRNA文庫(kù)制備(48樣本)測(cè)序
先前稱為TruSeq Stranded mRNA文庫(kù)制備試劑盒(目錄號(hào)RS-122-2101,RS-122-2102和RS-122-2103)的產(chǎn)物現(xiàn)稱為TruSeq Stranded mRNA。產(chǎn)品配置已更改。在新配置中,庫(kù)準(zhǔn)備和索引適配器可以單獨(dú)購(gòu)買。
產(chǎn)品名稱:TruSeq Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)
(附推廣:RNA相關(guān)產(chǎn)品,如有需求,請(qǐng)?jiān)谕莆闹胁樵?;更多產(chǎn)品,歡迎咨詢)
產(chǎn)品貨號(hào):20020594(ssv21106)
產(chǎn)品規(guī)格:
分析時(shí)間 ~10.5小時(shí)
動(dòng)手時(shí)間 ~4.5小時(shí)
輸入數(shù)量 0.1 - 1 ug總RNA或10 - 100 ng以前分離的mRNA(來(lái)自具有polyA尾的物種)
內(nèi)容規(guī)格 用鏈信息捕獲編碼轉(zhuǎn)錄組
行動(dòng)機(jī)制 Oligo-dT珠子捕獲polyA尾巴
復(fù) 1-96
描述 通過(guò)精確的鏈信息為研究人員提供清晰,全面的編碼轉(zhuǎn)錄組視圖。
專業(yè)樣品類型 不兼容FFPE
物種詳情 使用來(lái)自任何具有polyA尾巴的物種的高質(zhì)量RNA
系統(tǒng)兼容性 Genome Analyzer IIx,HiSeq 1000,HiSeq 1500,HiSeq 2000,HiSeq 2500,HiSeq 3000,HiSeq 4000,MiSeq,NextSeq 500,NextSeq 550,NovaSeq 6000
變體類 基因融合,新型轉(zhuǎn)錄本,單核苷酸多態(tài)性(SNPs),轉(zhuǎn)錄變體
物種類別 哺乳動(dòng)物,大鼠,人類,牛,老鼠
核酸類型 RNA
技術(shù) 測(cè)序
方法 mRNA測(cè)序
線條特異性 擱淺
產(chǎn)品名稱:TruSeq Stranded mRNA文庫(kù)制備(48樣本)測(cè)序 產(chǎn)品貨號(hào):20020594(ssv21106)
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產(chǎn)品介紹:TruSeq Stranded mRNA為編碼轉(zhuǎn)錄組分析提供了簡(jiǎn)化,經(jīng)濟(jì)高效且可擴(kuò)展的解決方案。它與各種樣品兼容。
鋼絞線方向檢測(cè)
獲得mRNA鏈方向的精確測(cè)量,用于檢測(cè)反義轉(zhuǎn)錄,增強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄物注釋和增加的比對(duì)效率。高覆蓋度均勻性增強(qiáng)了諸如替代轉(zhuǎn)錄物,基因融合和等位基因特異性表達(dá)等特征的發(fā)現(xiàn)。
成本效益
鏈狀信息識(shí)別來(lái)自給定RNA轉(zhuǎn)錄物的2條DNA鏈中的哪一條。該信息提供了對(duì)轉(zhuǎn)錄物注釋的增強(qiáng)的置信度,特別是對(duì)于非人類樣品。鑒定鏈來(lái)源增加了比對(duì)的讀數(shù)百分比,降低了每個(gè)樣品的測(cè)序成本。
可擴(kuò)展
該工作流程可以對(duì)標(biāo)準(zhǔn)樣品和低質(zhì)量樣品進(jìn)行可靠的詢問(wèn),并且工作流程與各種研究設(shè)計(jì)兼容。
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文庫(kù)制備
品牌 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 20020594 TruSeq Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)文庫(kù)制備
illumina品牌 20020595 TruSeq Stranded mRNA Library Prep (96 Samples)文庫(kù)制備
引物接頭
品牌 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 20020492 TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)引物接頭
illumina品牌 20020493 TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)引物接頭
illumina品牌 20019792 TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)引物接頭
illumina品牌 20020591 IDT for Illumina-TruSeq RNA UD Indexes (24 Indexes, 96 Samples)引物接頭
illumina品牌 20022371 IDT for Illumina-TruSeq RNA UD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)引物接頭
配件產(chǎn)品
品牌 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 20024144 Illumina Free Adapter Blocking Reagent (12 reactions)配件產(chǎn)品
illumina品牌 20024145 Illumina Free Adapter Blocking Reagent (48 reactions)配件產(chǎn)品
文庫(kù)制備試劑盒
品牌 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 RS-122-2101 TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit Set A (48 samples, 12 indexes)文庫(kù)制備試劑盒
illumina品牌 RS-122-2102 TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit Set B (48 samples, 12 indexes)文庫(kù)制備試劑盒
illumina品牌 RS-122-2103 TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit High Throughput (96 samples, 96 indexes)文庫(kù)制備試劑盒
Illumina二代測(cè)序技術(shù),邊合成邊測(cè)序(SBS),是全球廣泛采用的新一代測(cè)序(NGS)技術(shù),負(fù)責(zé)產(chǎn)生世界上90%以上的測(cè)序數(shù)據(jù)。
Illumina的二代測(cè)序技術(shù)稱為邊合成邊測(cè)序(Sequencing-by-Synthesis,簡(jiǎn)稱SBS)。SBS主要包括堿基延伸、熒光激發(fā)及信號(hào)收集、剪切等3個(gè)步驟。這3個(gè)步驟可以重復(fù),循環(huán)進(jìn)行。每循環(huán)一次測(cè)定一個(gè)堿基。想測(cè)定多少個(gè)堿基(即讀長(zhǎng)),就循環(huán)多少次。測(cè)序循環(huán)次數(shù)可以在軟件里設(shè)定。到底測(cè)序多長(zhǎng)合適,要根據(jù)項(xiàng)目性質(zhì)和需求來(lái)決定。大多數(shù)情況下,SR實(shí)驗(yàn)(單端測(cè)序)測(cè)定1x50個(gè)堿基,PE實(shí)驗(yàn)(雙端測(cè)序)測(cè)定2x150個(gè)堿基。
1 堿基延伸
Illumina測(cè)序試劑里所使用的dNTP極具特色,它們同時(shí)具有兩個(gè)修飾基團(tuán):一個(gè)熒光基團(tuán),一個(gè)可逆終止基團(tuán)。A、G、C、T 4種堿基分別標(biāo)記4種不同的熒光基團(tuán),它們?cè)诓煌ㄩL(zhǎng)的激光激發(fā)下,能夠發(fā)射不同波長(zhǎng)(即顏色)的熒光。熒光顏色與堿基種類一一對(duì)應(yīng),因此根據(jù)激發(fā)光的波長(zhǎng)可以識(shí)別堿基。4種堿基的終止基團(tuán)是一樣的。由于終止基團(tuán)的存在,所有dNTP每次都只能延伸1個(gè)堿基,無(wú)論給予多長(zhǎng)的反應(yīng)時(shí)間。又由于該終止基團(tuán)是可逆的,在熒光信號(hào)收集完畢之后,可以用剪切劑切除該終止基團(tuán),使堿基恢復(fù)自然的可延伸狀態(tài),這時(shí)即可繼續(xù)進(jìn)行下一輪循環(huán),再測(cè)定一個(gè)堿基。
可逆終止基團(tuán)技術(shù)是Illumina二代測(cè)序的一大特色。它與橋式PCR技術(shù)一起,構(gòu)成了Illumina二代測(cè)序的兩大支柱,為穩(wěn)定獲得高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)打下了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
2 信號(hào)采集
HiSeq系列測(cè)序儀具有紅綠兩根激光管,兩個(gè)濾色片。它們兩兩組合,可以形成4種不同的激發(fā)波長(zhǎng),正好分別用于激發(fā)A、G、C、T 4種堿基。
Cluster上所標(biāo)記的熒光基團(tuán)在激光激發(fā)下產(chǎn)生的信號(hào),可以用相機(jī)拍攝或者掃描的方式收集信號(hào)。掃描技術(shù)速度比較快,被X10系列采用。由于FC面積比較大,而且上表面和下表面要分別拍照,所以拍照過(guò)程相當(dāng)耗時(shí)。對(duì)于經(jīng)典的HiSeq 2000來(lái)說(shuō),一次測(cè)序循環(huán)所產(chǎn)生的熒光信號(hào),需要大約40分鐘的時(shí)間才能拍照收集完畢,時(shí)間比測(cè)序反應(yīng)本身還要長(zhǎng)。
3 剪切
熒光信號(hào)收集完畢后,關(guān)閉激光,用剪切劑去除測(cè)序引物的延伸產(chǎn)物上的堿基所標(biāo)記的熒光基團(tuán)和終止基團(tuán)。兩個(gè)修飾基團(tuán)均被切除,一方面消去干擾熒光,一方面使鏈末端的堿基回復(fù)到自然的可延伸狀態(tài),為下一輪測(cè)序做好準(zhǔn)備。
再重復(fù)合成、激發(fā)、收集等步驟,即可進(jìn)行第二個(gè)堿基的測(cè)序。
測(cè)序循環(huán)可以重復(fù)多次。理論上可以一直重復(fù),直到信噪比降低得無(wú)法有效識(shí)別堿基信號(hào)為止。由于熒光基團(tuán)的發(fā)光效率持續(xù)不斷在衰減,Taq酶的活性也在持續(xù)不斷地衰減,所以實(shí)際上測(cè)序循環(huán)次數(shù)是有限的,最大重復(fù)次數(shù)與sbs試劑的配方有關(guān)。測(cè)序的循環(huán)次數(shù)可以在軟件設(shè)置過(guò)程中人為指定,這個(gè)重復(fù)次數(shù)就是每個(gè)測(cè)序片段的讀長(zhǎng)。目前,Illumina平臺(tái)的讀長(zhǎng)有2x100 bp,2x125 bp,2x150 bp,2x300 bp等多種,其中2x150 bp用得最廣泛。
單端測(cè)序:?jiǎn)味藴y(cè)序(Single-read)首先將DNA樣本進(jìn)行片段化處理形成200-500bp的片段,引物序列連接到DNA片段的一端,然后末端加上接頭,將片段固定在flow cell上生成DNA簇,上機(jī)測(cè)序單端讀取序列。
雙端測(cè)序:雙端測(cè)序(Paired-end)方法是指在構(gòu)建待測(cè)DNA文庫(kù)時(shí)在兩端的接頭上都加上測(cè)序引物結(jié)合位點(diǎn),在第一輪測(cè)序完成后,去除第一輪測(cè)序的模板鏈,用對(duì)讀測(cè)序模塊(Paired-End Module)引導(dǎo)互補(bǔ)鏈在原位置再生和擴(kuò)增,以達(dá)到第二輪測(cè)序所用的模板量,進(jìn)行第二輪互補(bǔ)鏈的合成測(cè)序。
基因測(cè)序是一種新型基因檢測(cè)技術(shù),能夠從血液或唾液中分析測(cè)定基因全序列,預(yù)測(cè)罹患多種疾病的可能性,個(gè)體的行為特征及行為合理?;驕y(cè)序技術(shù)能鎖定個(gè)人病變基因,提前預(yù)防和治療。
基因測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究演變到臨床使用,可以說(shuō)基因測(cè)序技術(shù),是下一個(gè)改變世界的技術(shù) 。
基因測(cè)序只是基因檢測(cè)的方法之一,其又叫基因譜測(cè)序,是國(guó)際上公認(rèn)的一種基因檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)。
基因測(cè)序廣為人知的還有針對(duì)唐氏綜合征篩查的無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)。只需要采集孕婦的外周血,通過(guò)對(duì)血液中游離DNA(包括胎兒游離DNA)進(jìn)行測(cè)序,并將測(cè)序結(jié)果進(jìn)行生物學(xué)分析,從而得出胎兒是否患有染色體數(shù)目異常的疾病,包括常見(jiàn)的21-三體綜合征(唐氏綜合征)、18-三體綜合征(愛(ài)德華氏綜合征)和13-三體綜合征(Patau綜合征)。
附推廣:illumina品牌 RNA相關(guān)產(chǎn)品:
品牌 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 RS-200-1001 TruSeq RNA EPH Reagent Tube
illumina品牌 RS-303-1002 TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A
illumina品牌 RS-303-1003 TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B
illumina品牌 RS-304-1002 TruSight RNA Fusion Panel Set A (48 samples)
illumina品牌 RS-304-1003 TruSight RNA Fusion Panel Set B (48 samples)
illumina品牌 RT-101-1001 TruSeq Targeted RNA Custom Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-102-1001 TruSeq Targeted RNA Custom Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-201-1001 TruSeq Targeted RNA Neurodegeneration Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1002 TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1004 TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1005 TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1006 TruSeq Targeted RNA Cytochrome p450 Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1007 TruSeq Targeted RNA p53 Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1008 TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1009 TruSeq Targeted RNA Cardiotoxicity Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1010 TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-202-1001 TruSeq Targeted RNA Neurodegeneration Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1002 TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1004 TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1005 TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1006 TruSeq Targeted RNA Cytochrome p450 Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1007 TruSeq Targeted RNA p53 Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1008 TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1009 TruSeq Targeted RNA Cardiotoxicity Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1010 TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-801-1001 TruSeq Targeted RNA Supplemental Content Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-802-1001 TruSeq Targeted RNA Supplemental Content Kit (96 samples)
illumina品牌 RZE1224 Ribo-Zero? rRNA Removal Regents (Epidemiology) 24 Reactions
illumina品牌 RZH110424 Ribo-Zero? rRNARemoval Kit (H/M/R) 24rxns
illumina品牌 RZHM11106 Ribo-ZeroTM Gold rRNA Removal Reagents (Human/Mouse/Rat)
illumina品牌 RZMB12324 Ribo-Zero? rRNA Removal Reagents (Bacteria) 24 Reactions
illumina品牌 RZNB1056 Ribo-Zero rRNA-Removal Reagents (Gram-Negative Bacteria) 6 Rxns
illumina品牌 RZPL11016 Ribo-Zero rRNA Removal Reagents (Plant Leaf) 6 Rxns
illumina品牌 RZSR11036 Ribo-Zero rRNA Removal Reagents (Plant Seed/Root) 6 Rxns
illumina品牌 T4RL2DML-X T4 RNA Ligase 2, Deltion Mutant-Bulk
illumina品牌 T7R100UML-X T7 RNA Polymerase (100 U/ul)-Bulk
illumina品牌 T7R1KUML-X T7 RNA Polymerase-Bulk; 1,000 U/ul
illumina品牌 T7R50UML-X T7 RNA Polymerase (50 U/ul) - Bulk
illumina品牌 TAB1R80524 TargetAmp 1-Round Biotin-aRNA Amplification Kit 105 24 Rxns
產(chǎn)品名稱:TruSeq Stranded mRNA文庫(kù)制備(48樣本)測(cè)序 產(chǎn)品貨號(hào):20020594(ssv21106)
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