氨基酸既有酸性又有堿性,意味著它既包含酸性基團(羧酸),又包含堿性基團(伯胺)。
但這些基團通過肽鍵與殘基縮合。
多個氨基酸通過肽鍵連接形成肽鏈。
蛋白質/多肽的特征由氨基酸側鏈決定。
本文包含詳細描述和功能概述。
包括氨基酸的名稱、三字母縮寫和單字母符號。
類型:疏水性
功能:側鏈由疏水性甲基組成。與其它疏水性氨基酸一樣,丙氨酸協(xié)助形成并維持蛋白質的三級結構。類型:堿性
功能:精氨酸側鏈有三個緊密結合的氮原子,是一種堿性極強的氨基酸,pH高達12.5。
精氨酸與天冬氨酸或谷氨酸形成靜電復合物(鹽橋),強化蛋白質的三級結構。
它還與附著在蛋白質的酸性基團相互作用,例如核酸的磷酸基團。
類型:弱極性
功能:天冬酰胺是脫酰胺的主要位置,也是甘氨酸(低聚糖)的結合點。
功能:天冬氨酸的pH為4,與堿性氨基酸相互作用形成靜電復合物(鹽橋)。
天冬氨酸還是金屬離子等帶正電荷基團的結合位點,其功能的發(fā)揮在多種蛋白質中很重要。
功能:半胱氨酸在蛋白質的三級結構中具有重要作用,其與其它半胱氨酸側鏈發(fā)生反應并在多肽鏈的不同部分形成共價鍵(二硫鍵)。
功能:谷氨酸的pH稍高于4,與堿性氨基酸相互作用形成靜電復合物(鹽橋)。
谷氨酸還是金屬離子等帶正電荷基團的結合位點,其功能的發(fā)揮在多種蛋白質中很重要。
類型:中性
功能:甘氨酸非常小,側鏈僅有一個氫,它作為中性氨基酸在肽鏈中延伸。
類型:堿性
功能:組氨酸側鏈為弱堿性,pH在6~7之間。組氨酸能夠與酸結合,但取決于環(huán)境pH。
類型:疏水性
功能:與其它疏水性氨基酸一樣,異亮氨酸殘基協(xié)助形成并維持蛋白質的三級結構。
類型:疏水性
功能:與其它疏水性氨基酸一樣,亮氨酸協(xié)助形成并維持蛋白質的三級結構。
功能:賴氨酸側鏈是伯胺類,pH為~10.5。
賴氨酸與天冬氨酸或谷氨酸形成靜電復合物(鹽橋),強化蛋白質的三級結構。
它還與附著在蛋白質的酸性基團相互作用,例如核酸的磷酸基團。
功能:甲硫氨酸是最可能被氧化的氨基酸。它是發(fā)生氧化作用的指示劑。甲硫氨酸氧化還可能影響生物活性。
類型:疏水性、芳香性
功能:與其它疏水性氨基酸一樣,苯丙氨酸協(xié)助形成并維持蛋白質的三級結構。
由于具有芳香性,苯丙氨酸還是紫外光吸收的有效檢測目標。
類型:弱疏水性
功能:脯氨酸是一種獨特的氨基酸,其疏水側鏈與氨基酸末端連接,在肽鏈中產(chǎn)生張力,使肽鏈彎曲。
該結構特征協(xié)助形成蛋白質的三級結構。
類型:極性(含羥基)
功能:絲氨酸通過氫鍵與其它氨基酸殘基或部分蛋白質結合。還能通過氫鍵與其它蛋白質或基團結合。
絲氨酸還是細胞蛋白質磷酸化的位點。
功能:蘇氨酸通過氫鍵與其它氨基酸殘基或部分蛋白質結合。還能通過氫鍵與其它蛋白質或基團結合。
蘇氨酸還是細胞蛋白質磷酸化的位點。
功能:酪氨酸通過氫鍵與其它氨基酸殘基或部分蛋白質結合。還能通過氫鍵與其它蛋白質或基團結合。
酪氨酸還是細胞蛋白質磷酸化的位點。酪氨酸具有芳香性,提供紫外吸收位點。
類型:疏水性、芳香性
功能:色氨酸具備多環(huán)結構,能夠通過氫鍵延長。由于具備芳香性,色氨酸提供紫外光吸收位點。
色氨酸還能發(fā)出微弱的天然熒光。
功能:纈氨酸側鏈是一個疏水性異丙基。
與其它疏水性氨基酸一樣,纈氨酸協(xié)助形成并維持蛋白質的三級結構。
各個氨基酸的豐度
疏水性氨基酸在蛋白質三級結構的形成中起到關鍵作用,通常位于蛋白質的核心區(qū)。
它們約占蛋白質中氨基酸的50%。
極性氨基酸具有很多重要的結構性或功能性作用,豐度一般較高。
豐度最低的氨基酸包括甲硫氨酸、組氨酸、半胱氨酸及色氨酸。