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高內(nèi)涵——自動化智能化的上皮細(xì)胞管腔結(jié)構(gòu)分析方案——中國生物器材網(wǎng)

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2019-06-24  來源:儀器信息網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):160
MDCK細(xì)胞在生長的過程中會發(fā)生細(xì)胞極化的過程,單層細(xì)胞放射狀圍繞中心腔隙排列,形成特定三維結(jié)構(gòu),一些極化機(jī)制也首先在MDCK細(xì)胞模型中得到了印證,因此它是一個很好的研究上皮細(xì)胞極化和管腔結(jié)構(gòu)形成的簡化系統(tǒng),目前已廣泛應(yīng)用于相關(guān)領(lǐng)域的研究。  

圖1:MDCK細(xì)胞管腔結(jié)構(gòu)形成示意圖   然而由于生長方式的特殊性,同一個視野中的不同管腔結(jié)構(gòu)有可能位于不同的層面上,因此在以往的實(shí)驗(yàn)中想要對這樣的樣本進(jìn)行高通量成像是一個很大的挑戰(zhàn),往往需要手動對每一個管腔結(jié)構(gòu)進(jìn)行單獨(dú)拍攝,并在后期做圖像分析,而使用高內(nèi)涵成像分析技術(shù)則將這一繁復(fù)的操作過程變得自動化和智能化。   Step 1.智能預(yù)掃   使用高內(nèi)涵的智能預(yù)掃功能,可以先在低倍(5×)下對整孔進(jìn)行全局掃描,拍攝的同時軟件根據(jù)算法確定視野中每個空腔結(jié)構(gòu)的定位和范圍,剔除不含目的結(jié)構(gòu)視野。  

圖2:Optically section in Z → Max. project medial planes   Step2.精細(xì)層掃   然后再自動轉(zhuǎn)換至高倍(20×或63×),分別對含有空腔結(jié)構(gòu)的視野進(jìn)行高分辨率的精細(xì)層掃,以確保位于不同層面的空腔結(jié)構(gòu)都能夠獲取到圖像。  

圖3:Detect polarity orientation → Calculate lumen number   Step3.統(tǒng)計(jì)分析   最后使用高內(nèi)涵的分析功能模塊對細(xì)胞的極性變化和形成的管腔數(shù)量直接進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。  

圖4:Phenotype binning    

圖5:細(xì)胞極化和管腔數(shù)量分析示意圖   MDCK細(xì)胞團(tuán)培養(yǎng)24-72h后進(jìn)行染色,對不同Z軸層面(共8層,每層間隔2μm)成像后采用最大投影模式進(jìn)行顯示和分析,應(yīng)用機(jī)器自學(xué)習(xí)模塊對細(xì)胞極化進(jìn)行自動檢測,并在此基礎(chǔ)上計(jì)算形成的內(nèi)腔數(shù)量。   由此可以看出高內(nèi)涵可以很好的解決上皮細(xì)胞3D培養(yǎng)中不規(guī)則分散樣本的定位成像問題,簡化了成像流程,為樣本中特殊結(jié)構(gòu)的自動化成像和分析提供了高效的解決方案。   點(diǎn)擊鏈接了解更多高內(nèi)涵儀器相關(guān)資料:https://y6n.cn/uSQLG     1. Roman-Fernandez, et al. Complex polarity: building multicellular tissues through apical membrane traffic. Traffic 17, 1244–1261(2016). 2. O'Brien, et al. Opinion: building epithelial architecture: insights from three-dimensional culture models. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 3, 531–537 (2002). 3. Rodriguez-Boulan, et al. Organization and execution of the epithelial polarity programme. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 15, 225–242(2014). 4. álvaro Román-Fernández, et al. The phospholipid PI(3,4)P2 is an apical identity determinant. Nat Commun. 9: 5041(2018).   關(guān)于珀金埃爾默:   珀金埃爾默致力于為創(chuàng)建更健康的世界而持續(xù)創(chuàng)新。我們?yōu)樵\斷、生命科學(xué)、食品及應(yīng)用市場推出獨(dú)特的解決方案,助力科學(xué)家、研究人員和臨床醫(yī)生解決最棘手的科學(xué)和醫(yī)療難題。憑借深厚的市場了解和技術(shù)專長,我們助力客戶更早地獲得更準(zhǔn)確的洞見。在全球,我們擁有12500名專業(yè)技術(shù)人員,服務(wù)于150多個國家,時刻專注于幫助客戶打造更健康的家庭,改善人類生活質(zhì)量。2018年,珀金埃爾默年?duì)I收達(dá)到約28億美元,為標(biāo)準(zhǔn)普爾500指數(shù)中的一員,紐交所上市代號1-877-PKI-NYSE。了解更多有關(guān)珀金埃爾默的信息,請?jiān)L問www.perkinelmer.com.cn
 
 
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