Agripheno 高通量基因分型檢測(cè)平臺(tái)
Agripheno 高通量基因分型檢測(cè)平臺(tái)包括高通量Oktopure DNA提取儀、Nexar 模塊化內(nèi)聯(lián)液體處理與分析系統(tǒng)、Soellex 高通量PCR水浴熱循環(huán)系統(tǒng)和Araya 內(nèi)聯(lián)熒光檢測(cè)系統(tǒng)。

Oktopure DNA提取儀采用磁珠的方法提取DNA，通量達(dá)到800個(gè)樣本/3小時(shí)。同時(shí)，適用于多種樣本類(lèi)型的DNA提取，包括植物葉片、種子，毛發(fā)、血方卡、精液、口拭子、唾液、組織等。提取的DNA適用于多種下游應(yīng)用，如基因分型、一代測(cè)序、二代測(cè)序等。

Oktopure DNA提取儀
 

Nexar高通量吸取樣品DNA和引物、mix至384孔卷帶并封膜。Soellex對(duì)封膜完成的卷帶進(jìn)行PCR水浴熱循環(huán)，每次最多可達(dá)230,000個(gè)樣本。Araya對(duì)水浴完成的卷帶掃描分析，28秒掃描一張卷帶。

Nexar 模塊化內(nèi)聯(lián)液體處理與分析系統(tǒng)

Soellex 高通量PCR水浴熱循環(huán)系統(tǒng)

Araya 內(nèi)聯(lián)熒光檢測(cè)系統(tǒng)

Agripheno 基因分型采用KASP（KompetitiveAllele Specific PCR）原理，對(duì)目標(biāo)SNPs和InDels進(jìn)行精準(zhǔn)的雙等位基因分型。反應(yīng)體系僅1.6 l，具有高通量、低成本，準(zhǔn)確率和檢出率接近100%的明顯優(yōu)勢(shì)。

服務(wù)流程

客戶(hù)需提供

每個(gè)位點(diǎn)至少10個(gè)陽(yáng)性對(duì)照。 

服務(wù)周期

 引物測(cè)試完成后，每批樣品一周內(nèi)出結(jié)果。

服務(wù)特點(diǎn)

高通量、低成本、快速準(zhǔn)確。

應(yīng)用案例

牛毛基因分型

項(xiàng)目背景：牛奶里的蛋白有兩種，酪蛋白和乳清蛋白。酪蛋白中的 酪蛋白分為A1和A2型。人在消化蛋白的時(shí)候，消化酶會(huì)在A1 酪蛋白67號(hào)位置一刀切，產(chǎn)生一種7個(gè)氨基酸的肽鏈（BCM-7），而無(wú)法切A2蛋白。BCM-7會(huì)導(dǎo)致許多人無(wú)法吸收牛奶中的營(yíng)養(yǎng)成分，通常表現(xiàn)為喝奶后出現(xiàn)不同程度的脹氣、腹痛、腹瀉等胃腸不適現(xiàn)象。而A2型牛奶更易吸收。A1, A2的區(qū)別是由奶牛的基因不同造成的，不同基因的奶牛會(huì)生產(chǎn)出含有不同蛋白質(zhì)類(lèi)型的牛奶。所以，需要檢測(cè)奶牛的基因型用于奶牛育種。

項(xiàng)目目的：檢測(cè)不同奶牛的SNP基因型（決定牛奶A1A2類(lèi)型的位點(diǎn)）。

實(shí)驗(yàn)過(guò)程：

分型結(jié)果：

每個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)代表一個(gè)獨(dú)立的DNA樣本的熒光信號(hào)，相同基因型的樣本會(huì)發(fā)出相似水平的熒光，因此富集在一起。