在現(xiàn)代生物學(xué)、醫(yī)學(xué)及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、藥物學(xué)等研究中,隨著功能基因組研究的深入,生物大小分子的生物學(xué)功能研究占據(jù)著非常重要的地位 ,分子相互作用分析儀已成為生命科學(xué)領(lǐng)域研究不可缺少的一項重要工具,其中最經(jīng)典當(dāng)屬GE的Biacore的SPR技術(shù),近年來市場上開發(fā)出了很多新的品牌,至于孰強(qiáng)孰弱很難辯解, 唯有事實勝于雄辯,接下來給大家展示一下市面上比較主流的OpenSPR、Biacore和ForteBio 對同一組蛋白與抗體的檢測結(jié)果:
實驗內(nèi)容
1. 利用OpenSPR 、Biacore 和Octet 對生物素化CD16a和IgG的結(jié)合動力學(xué)的特性進(jìn)行了對比;
2. OpenSPR 、Biacore 和Octet 測量的KD值分別為74.7 nM、48.7 nM和226 nM;
3. 本研究證實OpenSPR與其他用于分析結(jié)合動力學(xué)和親和力的商業(yè)儀器具有等效性;
OpenSPR 是一個功能強(qiáng)大的儀器,可對各種不同的分子相互作用提供深入的無標(biāo)記的結(jié)合動力學(xué)檢測和分析。為證明OpenSPR 的強(qiáng)大功能和準(zhǔn)確性,我們和Biacore 3000及Octet RED96檢測數(shù)據(jù)進(jìn)行比較分析。Biacore 和Octet 系統(tǒng)通常用于分析結(jié)合動力學(xué),但成本高達(dá)數(shù)十萬美元,因此許多需要這些數(shù)據(jù)的研究人員無法使用它們。為了證明OpenSPR 能夠以較低的成本獲得與Biacore 和Octet 相當(dāng)?shù)慕Y(jié)果,我們用這三款儀器在相似的條件下分析了Fc-FcR相互作用。
與行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)Biacore 或Octet 相比,OpenSPR 的成本是多少?
OpenSPR是一種臺式SPR解決方案,它給研究人員提供了在自己的實驗室中完成深入的無標(biāo)記結(jié)合動力學(xué)檢測。與制藥行業(yè)的標(biāo)準(zhǔn)SPR或BLI解決方案相比,Biacore SPR和Octet BLI儀器的成本高達(dá)數(shù)十萬美元,而OpenSPR則需要他們差不多一半的價格,因此只需一小部分成本便可獲得與Biacore 和Octet 相同的數(shù)據(jù),并且儀器出結(jié)果速度快,操作簡單, 研究人員能夠以比Biacore 和Octet 系統(tǒng)更快速度進(jìn)行研究和發(fā)布研究成果。
比較研究:OpenSPR 、Biacore 和Octet 對Fc-FcR的相互作用分析
研究中,我們用OpenSPR 、Biacore 3000和Octet RED96檢測了Fc-FcR相互作用結(jié)合動力學(xué)。Biacore 和Octet 實驗由CRO訓(xùn)練有素的技術(shù)人員操作,OpenSPR實驗由Nicoya科學(xué)家進(jìn)行。本研究的目的是驗證OpenSPR與其他用于分析結(jié)合動力學(xué)和親和力的商業(yè)儀器的等效性。采用動力學(xué)分析方法分析了Fc-FcR相互作用的kon、koff和KD,具體結(jié)果如下(注:如果您想了解更多關(guān)于本比較中使用的材料、協(xié)議和設(shè)備,您可以查看我們的詳細(xì)技術(shù)說明):
結(jié)果
用OpenSPR 、Biacore 和Octet 儀器檢測的Fc-FcR相互作用結(jié)果分別見圖1、圖2、圖3和表1。各實驗數(shù)據(jù)采用1:1結(jié)合模型擬合 。OpenSPR 、Biacore 和Octet 測定的KD值分別為74.7 nM、48.7 nM和226 nM。OpenSPR和Biacore 3000之間的計算KD值非常接近,而Octet 報告的值相差約5倍。由擬合得到的動力學(xué)常數(shù)如表1所示。三款儀器的解離速率都相似,但是Octet 的on-rates的差異超過了一個數(shù)量級。OpenSPR 和Biacore 擬合質(zhì)量相當(dāng),但Octet 數(shù)據(jù)偏差較大。
受儀器本身的特點及操作的限制,即使在同一臺儀器上進(jìn)行重復(fù)實驗,也經(jīng)常會看到測量到的親和力和動力學(xué)值的變化。Biacore 和OpenSPR 實驗值的接近證明了這些用于生物分子相互作用分析儀器的可比性。觀察到的微小差異可能是由于在精確的實驗條件和使用的材料上的微小差異造成的。Octet數(shù)據(jù)的較大差異可能是由于使用了較高的固定水平、擬合差異或BLI使用的dip和read技術(shù)的基本差異。
結(jié)論
綜上所述,OpenSPR 和Biacore 儀器對同一組實驗獲得相似的動力學(xué)和親和力值,有力的支持了可使用OpenSPR 準(zhǔn)確且經(jīng)濟(jì)進(jìn)行分子間結(jié)合相互作用的檢測和研究。