把埃博拉病毒基因組測序監(jiān)測系統(tǒng)裝進行李箱實現(xiàn)實時監(jiān)測并不是夢。英國伯明翰大學Nicholas Loman團隊開發(fā)了一個基因組監(jiān)測系統(tǒng),可以用標準的航空行李運送到疾病檢測現(xiàn)場,并在樣本收集24小時內(nèi)得出檢測結果。近日發(fā)表于《自然》的一項研究介紹了在西非幾內(nèi)亞最近的埃博拉疫情中,成功使用該系統(tǒng)進行的實時監(jiān)測。
西非埃博拉病毒新瑪可拉(Makona)毒株已導致超過 11000人死亡,該病毒平均每個基因組中有16~27個遺傳變異?;蚪M測序可以用來追蹤這種變化,且日益受到醫(yī)護工作者的歡迎,因為只要測序結果分析得足夠快,就可以給他們提供信息并采取病毒控制措施。然而,由于當?shù)厝鄙贉y序能力,且遠距離運輸樣本測序有難度,西非埃博拉疫情期間采取基因組監(jiān)控十分零散。
Loman團隊開發(fā)的基因組監(jiān)測系統(tǒng)使用一個重量不足100克的DNA測序裝置,既可以用標準航空行李運送,也可以插入筆記本電腦的USB接口。研究團隊使用該系統(tǒng)測序并且分析了2015年3~10月收集的142例埃博拉病毒樣本,并可在24小時內(nèi)得到分析結果,測序過程需要的時間尚不到1小時。研究者認為,這顯示出在資源缺乏的情況下進行實時基因組監(jiān)控是可行的。