色譜儀作為復(fù)雜物質(zhì)的分離工具,在日?;衔锏姆蛛x分析中發(fā)揮了巨大的作用,多數(shù)色譜儀屬于一維色譜,適合于含幾十至幾百個(gè)物質(zhì)的樣品分析。隨著現(xiàn)代科技的進(jìn)步,傳統(tǒng)的一維色譜分離方式已經(jīng)不能滿足人們對(duì)諸如天然產(chǎn)物、中藥藥物和蛋白質(zhì)組等的常規(guī)分離,迫切需要更高效的分離方式來(lái)完成復(fù)雜樣品精細(xì)分離的需要。因此,能夠提供更大峰容量和更高分辨率的多維色譜技術(shù)日益受到人們的關(guān)注。相對(duì)于一維色譜分離而言,多維色譜分離具有更高的峰容量。從本質(zhì)上說(shuō),多維色譜就是簡(jiǎn)單的一維色譜加復(fù)雜的閥切換技術(shù)。
目前,發(fā)展速度較快的多維色譜技術(shù)包括:全二維氣相色譜、多維高效液相色譜、高效液相—毛細(xì)管電泳多維色譜、高效液相—?dú)庀喽嗑S色譜和多維超臨界流體色譜等。近年來(lái),國(guó)內(nèi)外有些儀器公司陸續(xù)推出了一些多維色譜儀,但主要是二維色譜儀。例如島津、沃特世、SCIEX、安捷倫和賽默飛等,其中賽默飛和SCIEX推出的二維液相色譜儀主要應(yīng)用于蛋白質(zhì)組的分析。安捷倫和沃特世推出的二維液相色譜儀,其使用主要集中在藥物小分子的篩選。在已商品化的全二維氣相色譜中,LECO 全二維氣相色譜結(jié)合chromaTOF 軟件,一次可解析大于100000個(gè)峰,降低了研究領(lǐng)域的譜峰解析難度。同時(shí),國(guó)內(nèi)色譜專家在陣列多維色譜系統(tǒng)的設(shè)計(jì)和應(yīng)用上也有了杰出的研究成果。
近期,儀器信息網(wǎng)編輯就多維色譜目前發(fā)展?fàn)顩r、技術(shù)優(yōu)勢(shì)及未來(lái)產(chǎn)業(yè)化前景等內(nèi)容與國(guó)內(nèi)較早開(kāi)始研究多維色譜技術(shù)的復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系張祥民教授進(jìn)行了深入的交流。
多維色譜破解蛋白組學(xué)研究密碼
多維色譜技術(shù)包括二維色譜、三維色譜等高維色譜,近年來(lái)其應(yīng)用越來(lái)越廣泛。張祥民介紹,多維色譜不是簡(jiǎn)單的將每個(gè)柱子接起來(lái)。多維色譜指的是第一維分離出來(lái)數(shù)十到上百個(gè)餾分后,第二維相當(dāng)于把第一維做出來(lái)的每個(gè)餾分再重新做一遍,以此類推。例如汽油,一維色譜可以分出來(lái)三、四百個(gè)組分,兩維色譜其組分可以達(dá)數(shù)千,有學(xué)者曾用三維色譜去分,其組分可達(dá)六千多個(gè)。起初,張祥民教授團(tuán)隊(duì)提出用多維色譜技術(shù)來(lái)做中藥成分分析。由于中藥成分較為復(fù)雜,其中活性成分較難確定。通過(guò)多維色譜和高效毛細(xì)管電泳的結(jié)合,可以將中藥里上千個(gè)餾分分離出來(lái),這樣就可以很好的鑒別不同中藥里組分的活性和差異。復(fù)旦大學(xué)是最早建立多維色譜儀器系統(tǒng)并作為新技術(shù)手段用于解決實(shí)際問(wèn)題的單位之一,這主要得益于復(fù)旦大學(xué)良好的儀器研發(fā)基礎(chǔ)。
20世紀(jì)90年代,作為功能基因組學(xué)的重要支柱——蛋白質(zhì)組學(xué)的出現(xiàn),使得多維色譜的研究成為新的研究的熱點(diǎn)。蛋白質(zhì)組傳統(tǒng)的研究方法是采用雙向凝膠電泳分析。在雙相凝膠電泳分析中,一維用來(lái)跑等電聚焦,另一維用來(lái)跑分子量,兩維組合起來(lái)就可以將蛋白點(diǎn)分離出來(lái)。蛋白質(zhì)組剛出來(lái)時(shí)幾乎都在用這個(gè)方法做。雙相凝膠電泳雖然可以分離出來(lái)幾千個(gè)蛋白組分,但其工作量較大,難以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化。張祥民談到,起初其復(fù)旦大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)使用雙向電泳凝膠技術(shù)鑒定人肝中的蛋白質(zhì),團(tuán)隊(duì)三十幾個(gè)人需要花費(fèi)一兩個(gè)月才能鑒定兩千多個(gè)蛋白出來(lái),過(guò)程中耗費(fèi)了大量的人力和物力?,F(xiàn)在采用多維色譜技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)組進(jìn)行分離鑒定一個(gè)人僅需要幾個(gè)小時(shí)可鑒定5000-8000個(gè)蛋白,而且花費(fèi)僅為數(shù)千元。多維色譜技術(shù)的突破迅速推動(dòng)了生物醫(yī)學(xué)難題的解決,例如重大疾病和各種癌癥中的重大技術(shù)瓶頸問(wèn)題。通過(guò)采用多維色譜技術(shù)可以尋找到一些關(guān)鍵蛋白質(zhì)分子、疾病標(biāo)志物和藥靶蛋白,從而實(shí)現(xiàn)臨床上的疾病診斷和新的治療藥物的發(fā)現(xiàn)。
目前,多維液相色譜技術(shù)已廣泛的運(yùn)用到由小分子到大分子的分離分析中,其商品化的色譜儀器日益完善。同時(shí),研制我國(guó)自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的關(guān)鍵設(shè)備,開(kāi)發(fā)相應(yīng)的分離分析方法已成為當(dāng)下值得關(guān)注的焦點(diǎn)之一,也是提高我國(guó)科技能力的一個(gè)重要方面。現(xiàn)階段,盡管新技術(shù)新方法不斷涌現(xiàn),但是還不能完全滿足實(shí)際應(yīng)用的需要,尤其是缺少蛋白質(zhì)組學(xué)中核心技術(shù)設(shè)備和應(yīng)用于臨床疾病研究的創(chuàng)新技術(shù)方法。然而,隨著多維色譜分離技術(shù)的提高,分離方法不斷進(jìn)步,具有高通量高分離能力的多維色譜必將在蛋白質(zhì)組學(xué)等領(lǐng)域發(fā)揮更大的作用。
國(guó)內(nèi)多維色譜研究的開(kāi)創(chuàng)者
張祥民于1986年進(jìn)入中科院大連化學(xué)物理研究所工作,師從盧佩章院士和張玉奎院士。1994年張祥民進(jìn)入復(fù)旦大學(xué),從事博士后研究工作,后留復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系工作至今。目前,張祥民為復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系和復(fù)旦生物醫(yī)學(xué)研究院雙聘教授。還歷任中國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)理事、中國(guó)化學(xué)會(huì)色譜專業(yè)委員會(huì)委員、中國(guó)色譜學(xué)會(huì)常務(wù)理事、中國(guó)分析儀器學(xué)會(huì)常務(wù)理事、中國(guó)蛋白質(zhì)組學(xué)會(huì)理事、上海市分析測(cè)試協(xié)會(huì)副理事長(zhǎng), 并擔(dān)任Proteomics, Anal Bioanal Chem (ABC)和《色譜》雜志編委等。
張祥民課題組是國(guó)內(nèi)最早開(kāi)始研究多維色譜技術(shù)的團(tuán)隊(duì)之一,其多項(xiàng)有關(guān)多維色譜技術(shù)的論文發(fā)表在國(guó)內(nèi)外高水平的期刊雜志上。目前,張祥民課題組主要依托于復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系、生物醫(yī)學(xué)研究院和教育部創(chuàng)新科學(xué)儀器工程研究中心,課題組實(shí)驗(yàn)室共有三十余名科研人員從事多維色譜技術(shù)的研究。迄今為止,張祥民課題組累計(jì)發(fā)表SCI論文230多篇,申請(qǐng)發(fā)明專利50多項(xiàng),獲得2項(xiàng)教育部自然科學(xué)獎(jiǎng)。
復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系和復(fù)旦生物醫(yī)學(xué)研究院雙聘教授張祥民
從原理上對(duì)傳統(tǒng)技術(shù)發(fā)起挑戰(zhàn)
目前,國(guó)內(nèi)分析儀器企業(yè)與國(guó)外公司相比體量還比較小,主要提供的是中低端儀器和量大面廣的產(chǎn)品。因此,國(guó)內(nèi)分析儀器生產(chǎn)企業(yè)對(duì)新型的儀器研發(fā)投入熱情很高,但也存在心有余力不足的局面。上海市科委從“十五”到“十二五“一直對(duì)分析儀器行業(yè)有持續(xù)的資金投入,張祥民教授課題組參與承擔(dān)了一系列儀器攻關(guān)項(xiàng)目研究,與企業(yè)開(kāi)展產(chǎn)學(xué)研聯(lián)合開(kāi)發(fā),先后與上海精科、舜宇恒平、上海天美等儀器公司合作,研發(fā)了十多種新型分析儀器,取得了一批創(chuàng)新技術(shù)成果。近年來(lái)國(guó)家開(kāi)始逐步加大對(duì)國(guó)內(nèi)分析儀器研發(fā)的支持力度,特別是“十二五“期間一些國(guó)家重大科學(xué)儀器開(kāi)發(fā)專項(xiàng)資金的投入力度很大,一改研發(fā)資金不足的處境,這些資金的投入已經(jīng)產(chǎn)出了大批先進(jìn)的儀器和制造技術(shù),相信國(guó)內(nèi)分析儀器未來(lái)在儀器研發(fā)和創(chuàng)新上會(huì)有很大的發(fā)展和突破。張祥民談到,“我們起初研發(fā)色譜儀器的想法很簡(jiǎn)單,主要是基于前沿研究課題需要和一些生產(chǎn)實(shí)際過(guò)程中的急需。因?yàn)樯唐穬x器不能滿足要求,在沒(méi)有充足的購(gòu)置經(jīng)費(fèi)時(shí),創(chuàng)新便成為必要的選項(xiàng)。然而,創(chuàng)新色譜儀器的研制也不是想象的那么復(fù)雜,設(shè)計(jì)原理新、技術(shù)方案簡(jiǎn)單、成本低是前提,于是就根據(jù)需要自己搭建一套?!?p> 發(fā)明的熱膨脹泵就是典型的案例之一。色譜泵是色譜儀中運(yùn)動(dòng)部件最多,機(jī)械磨損最嚴(yán)重、較容易出故障的設(shè)備。色譜泵作為色譜儀的核心部件,其性能的好壞直接影響整個(gè)儀器和分離的可靠性。張祥民課題組研發(fā)的全新色譜泵——微流高壓梯度熱膨脹泵,采用一種全新的原理,其樣機(jī)已成功應(yīng)用于高效毛細(xì)管液相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用儀器中,并得到安捷倫等國(guó)際企業(yè)研發(fā)機(jī)構(gòu)的關(guān)注。由于液體具有熱脹冷縮的特點(diǎn),當(dāng)溫度升高時(shí),毫升級(jí)密閉加熱腔內(nèi)液體體積就會(huì)有納升到微升級(jí)的微小膨脹,從而溢出密閉加熱腔,實(shí)現(xiàn)流量輸出。熱膨脹泵是以密閉腔體內(nèi)液體受熱體積膨脹為驅(qū)動(dòng)力,從而實(shí)現(xiàn)流體定向輸出。張祥民談到,熱膨脹泵的特別之處在于:從原理上還沒(méi)有相關(guān)的商品化儀器。根據(jù)得到的理論方程,熱膨脹泵只要精密控制好其溫度和升溫方式就可以保證過(guò)程中流量的恒流輸出。熱膨脹泵最大的優(yōu)勢(shì)是整機(jī)中幾乎沒(méi)有機(jī)械運(yùn)動(dòng)的部件,運(yùn)行中聽(tīng)不到任何噪聲,但其輸出的壓力卻可以很高,可達(dá)到100 MPa。同時(shí),熱膨脹泵可以很好的避免傳統(tǒng)泵中活塞桿、單向閥和密封環(huán)等部件在系統(tǒng)運(yùn)行過(guò)程中損耗產(chǎn)生的費(fèi)用,其成本比傳統(tǒng)色譜儀低3~5倍。
“陣列”與“多維”的完美結(jié)合
陣列多維色譜儀研制的想法源于實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的需要,是為實(shí)驗(yàn)而服務(wù)的。陣列多維色譜儀中的“陣列”代表著多通道和同時(shí)分離。2003年復(fù)旦大學(xué)蛋白質(zhì)組研究團(tuán)隊(duì)購(gòu)買了一臺(tái)最快的TOF-TOF串聯(lián)飛行時(shí)間質(zhì)譜儀,其激光打譜的頻率可以達(dá)到每秒兩百?gòu)垐D,傳統(tǒng)的多維色譜分離速度明顯跟不上該儀器對(duì)蛋白質(zhì)的鑒定需求。張祥民談到,傳統(tǒng)多維色譜遇到的最大問(wèn)題是分析樣品速度較慢,盡管目前已有超高壓液相色譜,但總體來(lái)說(shuō)分離速度還是受到限制。例如,從第一維色譜中分離出100個(gè)組分,如果每個(gè)組分分離需要1小時(shí),那么第二維分離將達(dá)到100小時(shí),時(shí)間太長(zhǎng)。如果將多維色譜后一維做成陣列式,那么儀器運(yùn)行過(guò)程就可以平行進(jìn)行,從而使得效率成倍增加?;诖?,張祥民課題組研制了一臺(tái)18通道的陣列多維色譜儀,其分離速度提高18倍,可以與飛行時(shí)間質(zhì)譜儀很好的進(jìn)行匹配,大大縮短了實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的分析時(shí)間。
圖1. 陣列式多維液相色譜分離系統(tǒng)工作原理圖。詳見(jiàn)Anal. Chem. 2016, 88,2440-2445和《分析化學(xué)》 2015, 43: 1472-1478。(1) HPLC梯度泵;;(2)六通閥;(3)第一維分離柱;(4)紫外檢測(cè)器;(5) 10通道順序切換閥;(6)三通;(7)第二維陣列預(yù)柱;(8)8通道分流器;(9)第二維陣列分離柱;(10)96孔板。
目前,陣列多維色譜儀技術(shù)瓶頸問(wèn)題已經(jīng)得到解決。其中的關(guān)鍵技術(shù)已經(jīng)在團(tuán)隊(duì)承擔(dān)的國(guó)家973項(xiàng)目和國(guó)家863專項(xiàng)的實(shí)施過(guò)程中得到全面的發(fā)展、完善和實(shí)際應(yīng)用。以剛剛完成開(kāi)發(fā)工作的國(guó)際最先進(jìn)的陣列式多維液相色譜儀器為例,張祥民教授的團(tuán)隊(duì)利用該儀器在人血漿高豐度蛋白去除方面取得了新的技術(shù)突破。這項(xiàng)成果于近日已發(fā)表在《Analytical Chemistry》上。
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圖2. 陣列多維液相色譜儀器系統(tǒng)。下圖為陣列色譜系統(tǒng)照片,組件依次為第一維高效液相色譜泵,第二維高效液相色譜泵、陣列多維切換系統(tǒng)、陣列色譜柱組件,陣列餾分收集儀和系統(tǒng)自動(dòng)化控制系統(tǒng)。上部分左邊為陣列色譜捕集柱、分析柱及其連接流路,右邊為陣列餾分收集系統(tǒng)結(jié)構(gòu)圖。
對(duì)于人血漿樣品的蛋白組分析,一個(gè)重大挑戰(zhàn)是大量高豐度蛋白存在掩蓋了人們最感興趣的低豐度蛋白的信號(hào)。為此,必須使用免疫親和柱來(lái)處理血漿樣品,利用抗體來(lái)捕獲血漿中的高豐度蛋白,并將它們?nèi)コ簟5?,?shí)驗(yàn)過(guò)程發(fā)現(xiàn),去除高豐度蛋白的同時(shí)大量附著的低豐度的蛋白也一同被除掉。而且,目前這類商品化親和柱最多只能去除20個(gè)高豐度蛋白質(zhì)。為了解決這些問(wèn)題,張祥民教授的團(tuán)隊(duì)研究開(kāi)發(fā)了這臺(tái)陣列式的多維色譜儀器,第一維采用陰離子交換色譜(SAX),第二維采用8支反相液相色譜(RPLC)柱和8支蛋白捕集柱,開(kāi)展了多循環(huán)并行分離。血漿高豐度蛋白的去除時(shí)間,由以往的一個(gè)星期縮短到四個(gè)小時(shí),鑒定蛋白的濃度范圍達(dá)9個(gè)數(shù)量級(jí),一次可去除84個(gè)高豐度蛋白。與免疫親和柱的方法相比較,獲得蛋白質(zhì)鑒定數(shù)量有大幅提高。在實(shí)際樣品分析中,可鑒定出1332到1955個(gè)蛋白,包括一些豐度極低的膜體趨化因子、雄激素受體和肌苷脫氫酶等含量低至0.01 ng/mL的蛋白質(zhì)。已經(jīng)能夠滿足臨床常見(jiàn)的疾病標(biāo)志物甲胎蛋白(AFP)等標(biāo)志分子檢測(cè)需要。
陣列多維色譜儀市場(chǎng)還需培育,其應(yīng)用前景廣闊
在產(chǎn)業(yè)化過(guò)程中,陣列多維色譜儀也遇到的不少問(wèn)題主要是市場(chǎng)的培育。由于陣列多維色譜技術(shù)比較新穎,因此前期需要市場(chǎng)培育和宣傳,投入資金較多。此外,陣列多維色譜不像傳統(tǒng)二維色譜可在線與質(zhì)譜儀連接,它需要和高通量質(zhì)譜聯(lián)用匹配。但是,隨著分析樣品越來(lái)越復(fù)雜,高通量的陣列多維色譜儀將迎來(lái)快速發(fā)展階段。張祥民談到,例如多維色譜技術(shù),出現(xiàn)好多年一直沒(méi)有多少人去使用,近些年隨著生命科學(xué)發(fā)展,需要解決的問(wèn)題越來(lái)越復(fù)雜,特別是各種組學(xué)研究如蛋白組、代謝組等復(fù)雜體系的分離問(wèn)題解決不了,因此多維色譜技術(shù)被派上大用場(chǎng)。陣列多維色譜也是這樣,它的普及尚需要一個(gè)過(guò)程,但最后肯定會(huì)商品化,同時(shí)被廣大用戶所廣泛使用。
???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????采訪編輯:郭曉東