雙方共同與圣保羅州立大學(xué)完成了Nellore?;蚪M的高質(zhì)量組裝
圣地亞哥與以色列耐斯茨奧納 — 2017年1月12日 — 新一代測序技術(shù)的全球領(lǐng)先公司Illumina(納斯達(dá)克股票代碼:ILMN)與基因組裝和分析的全球領(lǐng)先企業(yè)NRGene,宣布合作開發(fā)牛群分子育種工具。作為合作計(jì)劃的第一步,雙方也同時(shí)宣布已經(jīng)與巴西圣保羅州立大學(xué)的研究人員共同完成了Nellore?;蚪M的高質(zhì)量組裝。
雙方將會(huì)共同對(duì)更多不同品種的牛群進(jìn)行測序和組裝,以便更快了解各個(gè)牛種群的遺傳變異。此次合作將有助于開發(fā)用于?;蚪M選擇和其他基因組技術(shù)的商業(yè)工具,從而加快開展育種項(xiàng)目,增進(jìn)全球食物(肉類和乳制品)的產(chǎn)量。
“我們期待與NRGene進(jìn)行下一階段的戰(zhàn)略合作,通過更多的測序研究加速推進(jìn)全球的牛群育種,最終將改良的基因組選擇工具商業(yè)化。”Illumina應(yīng)用基因組學(xué)副總裁兼總經(jīng)理Rob
Brainin說?!拔覀儗?duì)牛基因組的認(rèn)識(shí)正在不斷增加,將會(huì)在全球持續(xù)支持大量的育種項(xiàng)目,在幫助提高產(chǎn)量、改善消費(fèi)者行為的同時(shí),滿足全球?qū)Π踩?、營養(yǎng)、健康的蛋白質(zhì)產(chǎn)品的需求?!?br/>
Nellore(bos
indicus)是熱帶地區(qū)作為食物生產(chǎn)的主要瘤牛品種。此次基因組測序和組裝使用了Illumina的新一代測序數(shù)據(jù)和NRGene的云端DeNovoMAGIC?
3.0組裝軟件組合。隨著牛群基因組數(shù)據(jù)的不斷增加,將會(huì)使用NRGene的PanMAGIC?來比較多個(gè)完整獨(dú)立樣本的基因組序列,從而分析這些基因組的多樣性。這些信息將用于設(shè)計(jì)更高效的基因分析工具以支持牛群育種項(xiàng)目。
“Illumina和NRGene的技術(shù)讓我們?cè)诙潭虄蓚€(gè)月內(nèi)就精確組裝了Nellore牛的一個(gè)雜合子基因組,”圣保羅州立大學(xué)教授Jose
Fernando
Garcia說?!拔覀兿嘈胚@個(gè)參考基因組會(huì)幫助巴西牛群育種人員極大地提高本地牛的產(chǎn)量,更重要的是將會(huì)為Nellore牛的繁殖和肉質(zhì)提供重要的信息,為全球的產(chǎn)量增值?!?br/>
NRGene和Illumina的技術(shù)組合已經(jīng)在其他農(nóng)業(yè)計(jì)劃中得到應(yīng)用,來解碼某些最重要的基因組,這些基因組包括六倍體小麥、四倍體雜合子芒果、八倍體雜合子草莓,以及十幾種新型玉米、黃豆、棉花和加拿大低酸油菜籽的基因組。
“通過我們不斷開的發(fā)基因分型和育種工具,此類?;虻慕M裝將進(jìn)一步揭示了牛群的多樣性,”NRGene CEO Gil Ronen說?!拔覀兗夹g(shù)的終極價(jià)值在于將來能夠分析并加速作物、牲畜和水產(chǎn)等各個(gè)農(nóng)業(yè)品種的育種?!?br/>
關(guān)于Illumina
Illumina公司通過解碼基因組而改善人類健康。我們注重創(chuàng)新,這使我們成為DNA測序和芯片技術(shù)的全球領(lǐng)導(dǎo)者,并為科研、臨床和應(yīng)用市場的客戶提供服務(wù)。我們的產(chǎn)品應(yīng)用分布在生命科學(xué)、腫瘤學(xué)、生殖保健、農(nóng)業(yè)及其他新興市場領(lǐng)域。
關(guān)于NRGene
NRGene是一家基因組大數(shù)據(jù)公司,開發(fā)尖端的軟件與算法,分析復(fù)雜與多樣的作物、動(dòng)物與水產(chǎn),支持最高端的先進(jìn)育種項(xiàng)目。NRGene的工具已經(jīng)在世界一些領(lǐng)先的種子公司以及學(xué)術(shù)界最具有影響力的研究團(tuán)隊(duì)中得到應(yīng)用。