2021年7月15日星期四(北京時間:11:00PM),德國萊布尼茨植物遺傳與作物研究所(IPK)的Stefan Heckmann教授和Yun-Jae Ahn博士將在線分享:基于naica?六色微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)無需全基因組擴(kuò)增 (WGA),高通量絕對定量檢測大麥單花粉核減數(shù)分裂重組率”的研究。
本次網(wǎng)絡(luò)研討會將討論關(guān)于開發(fā)單個花粉核基因分型,實現(xiàn)數(shù)字PCR高通量絕對定量檢測四個特定染色體間隔內(nèi)的減數(shù)分裂重組率。
主題:naica?六色微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)高通量絕對定量檢測大麥單花粉中核減數(shù)分裂重組率
日期:2021年7月15日(周四)
時間:北京時間11:00PM
內(nèi)容簡介:
植物育種利用減數(shù)分裂重組產(chǎn)生的新等位基因組合。在受精前直接測量配子中的減數(shù)分裂重組率,從單個個體中篩選出大量的樣本,無需隔離種群分子標(biāo)記分析,無需費時的細(xì)胞學(xué)觀察的交叉互換(Cross Over)檢測。目前由于花粉核DNA含量有限(~5 pg/單倍體細(xì)胞核),大麥花粉單核基因分型方案需要先進(jìn)行全基因組擴(kuò)增(WGA),再進(jìn)行PCR分型或單細(xì)胞測序,從而限制了分析樣本的數(shù)量。
德國萊布尼茨植物遺傳與作物研究所(IPK)科學(xué)家,基于Stilla??Technologies 公司的naica?六色微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng),開發(fā)了一種單花粉核基因分型檢測方法,在不進(jìn)行WGA的情況下,以高通量測定四個特定染色體間隔內(nèi)(兩個著絲粒和兩個遠(yuǎn)端)的減數(shù)分裂重組率。通過對花粉核的熱穩(wěn)定性限制性酶消化提高了基因分型檢測的效率,完成了42,000多個花粉核進(jìn)行了基因分型。雜交花粉核中測得的減數(shù)分裂重組率與隔離種群測得的重組率一致?;趎aica?六色微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng),通過多重分析可在兩個染色體間隔同時檢測,進(jìn)一步提高了樣本通量。
該系統(tǒng)同時兼容基于多種不同核大小和DNA數(shù)量的農(nóng)作物細(xì)胞核,證明基于naica?六色微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)的單核基因分型檢測方法具有廣泛適用性。
該成果“High-throughput measuring of meiotic recombination rates in barley pollen nuclei using Crystal Digital PCR?”已發(fā)表于The Plant Journal ( IF 6.417 ) PubDate : 2021-05-05 ,DOI: 10.1111/tpj.15305
主講人:Evi Lianidou博士(雅典大學(xué)分析化學(xué)和臨床化學(xué))
德國萊布尼茨植物遺傳與作物研究所(IPK),隸屬于德國萊布尼茨科學(xué)聯(lián)合會,坐落于德國Gatersleben,研究定位以作物為主要對象,研究野生和栽培植物的遺傳多樣性,并利用這些材料,開展具有原創(chuàng)性的科學(xué)發(fā)現(xiàn)和技術(shù)創(chuàng)新,并實現(xiàn)農(nóng)作物的分子改良。經(jīng)過長達(dá)70多年的收集,保存了151,000多份不同作物的種質(zhì)資源,是歐洲最大的種質(zhì)資源收集與保藏中心,為IPK和世界相關(guān)研究人員研究作物基因和基因組演變、發(fā)展和表達(dá)規(guī)律提供了獨一無二的研究材料。
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