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非雙性戀核磁共振在生物技術(shù)清晰酶數(shù)據(jù)分析之中的應(yīng)用領(lǐng)域

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2021-07-12  來源:儀器網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):42
核心提示:何為非變性質(zhì)譜?就是選用溫和的溶液體系及質(zhì)譜條件,使蛋白保持在非變性狀態(tài)下被分析。聽到這,有些小伙伴可能會一頭霧水:師兄師姐教我處理蛋白質(zhì)樣品的時候,第一步就是要變性啊,怎么現(xiàn)在又不要變性了?  在通常的蛋白質(zhì)相關(guān)分析中,為了破壞蛋白質(zhì)

  何為非變性質(zhì)譜?就是選用溫和的溶液體系及質(zhì)譜條件,使蛋白保持在非變性狀態(tài)下被分析。聽到這,有些小伙伴可能會一頭霧水:師兄師姐教我處理蛋白質(zhì)樣品的時候,第一步就是要變性啊,怎么現(xiàn)在又不要變性了?

  在通常的蛋白質(zhì)相關(guān)分析中,為了破壞蛋白質(zhì)的三維立體空間結(jié)構(gòu),便于酶解等操作,會通過加熱或是加入高濃度的變性試劑(如尿素、鹽酸胍等),使蛋白質(zhì)變性;另外,對于常用的分離手段——反相色譜來講,其流動相的酸性pH條件與高有機(jī)相同樣也會使蛋白質(zhì)變性。當(dāng)需要對蛋白質(zhì)中的非共價結(jié)合進(jìn)行研究時,為了避免非共價結(jié)合被強(qiáng)烈的變性條件所破壞,則需在非變性的液相-色譜條件下(通常為50mM醋酸銨,pH=7的中性體系)進(jìn)行研究;另外,對于組成較為復(fù)雜的蛋白樣品,在非變性條件下分析時,由于體系中質(zhì)子數(shù)減少,所以蛋白電荷態(tài)數(shù)目也會相應(yīng)減少,電荷態(tài)之間的相互重疊度也會下降,進(jìn)而減少復(fù)雜組分之間的相互影響,從而能夠得到復(fù)雜蛋白樣品中每個組分的分子量信息(圖1)。

 圖1 同一樣品分別于變性及非變性條件下進(jìn)行分子量測定的原始譜圖

  目前,非變性質(zhì)譜技術(shù)主要應(yīng)用在兩個方面:一是生物制藥領(lǐng)域,通過打開單克隆抗體鏈間二硫鍵后在Cys位點(diǎn)上偶聯(lián)小分子藥物(Cys-ADC)的完整分子量分析,此類藥物的鏈間僅靠非共價力結(jié)合,故變性條件下各條鏈會分離,無法測得其完整狀態(tài)的分子量;另一應(yīng)用方向為研究蛋白質(zhì)多聚體,非變性條件下不僅可以保持各個亞基間的非共價相互作用,同時由于中性條件更接近生理狀態(tài),得到的結(jié)果更具意義。

  現(xiàn)在,非變性質(zhì)譜與氫氘交換、X-ray衍射、核磁共振、冷凍電鏡和cross-linking等技術(shù)聯(lián)合使用、互為補(bǔ)充,已經(jīng)越來越多的被應(yīng)用在結(jié)構(gòu)生物學(xué)、生物醫(yī)藥等領(lǐng)域的研究中。本期文章將會重點(diǎn)介紹非變性質(zhì)譜在治療性生物醫(yī)藥制品完整分子量測定中的研究,下期文章將會側(cè)重介紹非變性質(zhì)譜用于蛋白復(fù)合物的研究進(jìn)展。

Orbitrap超高分辨質(zhì)譜:非變性質(zhì)譜研究的理想平臺

  古人云:工欲善其事,必先利其器。要想研究做得好,趁手工具不可少!針對于非變性質(zhì)譜研究中的需求,我們在Orbitrap質(zhì)譜平臺上對相關(guān)參數(shù)進(jìn)行了優(yōu)化,包括離子源區(qū)脫溶劑能量、質(zhì)量范圍的擴(kuò)展以及高質(zhì)荷比離子傳輸效率的優(yōu)化等,使Orbitrap在固有的高分辨率、高質(zhì)量精度及高靈敏度基礎(chǔ)上,在非變性質(zhì)譜領(lǐng)域也能有出色表現(xiàn)。

  圖2 Orbitrap質(zhì)譜平臺用于非變性質(zhì)譜分析

  上文中提到,在生物制藥領(lǐng)域中,會通過分子工程設(shè)計,在單克隆抗體的特定氨基酸上通過化學(xué)反應(yīng),偶聯(lián)上小分子治療藥物,通過單克隆抗體的靶向識別功能將小分子藥物精確帶至病變細(xì)胞處并釋放,達(dá)到精確給藥、減少毒副作用的目的,這類藥物被稱作抗體藥物偶聯(lián)物(Antibody Drug Conjugates,ADCs)。在這類藥物中,通過將單抗鏈間二硫鍵打開從而在Cys位點(diǎn)上偶聯(lián)藥物的Cys-ADC,由于其鏈間僅靠非共價力結(jié)合,故需在非變性質(zhì)譜條件下才能對其完整分子量進(jìn)行測定(圖3)。

  圖3 Cys-ADC結(jié)構(gòu)示意圖

  圖4展示了使用非變性質(zhì)譜平臺對Cys-ADC進(jìn)行完整分子量測量的結(jié)果。由圖中不難發(fā)現(xiàn),使用體積排阻色譜(SEC),可以將單克隆抗體與其他雜質(zhì)分離開,而Orbitrap質(zhì)譜平臺能夠得到基線分離、信噪比高的原始譜圖。經(jīng)數(shù)據(jù)處理軟件解卷積處理后,可見偶聯(lián)了0/2/4/6/8個小分子藥物的簇峰分布,符合Cys-ADC的典型分布特征;解卷積后計算所得該ADC的藥物/抗體比值(Drug to Antibody Ratio, DAR),與之前報道過的DAR值相符。

  圖4 使用非變性質(zhì)譜平臺對Cys-ADC進(jìn)行完整分子量測量。

  (上),原始色譜/質(zhì)譜圖;(下),解卷積后譜圖。

  作為對照,在變性條件下也對同一個樣品進(jìn)行了分子量測定(圖5),發(fā)現(xiàn)鏈間的非共價結(jié)合在強(qiáng)烈的變性條件下均被破壞,只能觀察到部分ADC的分子量信息。該實驗進(jìn)一步說明了在非變性條件下對Cys-ADC進(jìn)行分子量測定的必要性。

  圖5 變性質(zhì)譜條件下對Cys-ADC進(jìn)行分子量測量。

  (上),原始色譜/質(zhì)譜圖;(下),解卷積后譜圖。

  對于常見的另外一種ADC——Lys-linked ADC,雖然其小分子藥物與單克隆抗體是通過共價鍵相結(jié)合,但偶聯(lián)上小分子藥物后,ADC的復(fù)雜度大大增加,此時若在非變性條件下進(jìn)行分子量測定,可以減少信號之間的干擾,得到更加準(zhǔn)確的測量結(jié)果(圖6)。

  ▲非變性條件可減少復(fù)雜組分間信號重疊

  ▲非變性條件下Lys-ADC完整分子量測量結(jié)果

  圖6 使用非變性質(zhì)譜平臺對Lys-ADC進(jìn)行完整分子量測量。

  小結(jié)

  本期我們對非變性質(zhì)譜技術(shù)的原理、適用范圍進(jìn)行了介紹,并以Cys-ADC與Lys-ADC樣品的完整分子量測量為例展示了該方法的應(yīng)用,不知道小伙伴們有沒有對非變性質(zhì)譜技術(shù)有個初步的了解呢?下期我們將會介紹該技術(shù)在蛋白復(fù)合物研究中的應(yīng)用,各位看官走過路過不要錯過,我們下期見!

  參考文獻(xiàn)

  [1] Dabaene et al., Anal Chem. 2014, Nov 4;86 (21):10674-83.

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關(guān)鍵詞: 變性 分子 質(zhì)譜 條件 ADC
 
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