11月9日,中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所丁建平研究組的研究成果,以Structural Basis for Ragulator Functioning as a Scaffold in Membrane-anchoring of Rag GTPases and mTORC1為題,在線發(fā)表在Nature Communication上,該工作揭示了Ragulator五元復(fù)合物的組裝機(jī)制,以及Ragulator復(fù)合物調(diào)控mTORC1信號通路的分子機(jī)制。
真核細(xì)胞中mTORC1是高度保守的蛋白激酶復(fù)合物,通過感受和整合外界信息,如生長因子、能量狀態(tài)和營養(yǎng)水平等,調(diào)控細(xì)胞生長發(fā)育和細(xì)胞自噬等重要生命過程。mTORC1信號通路的功能失調(diào)會引起多種疾病,包括肥胖癥、II型糖尿病和腫瘤等。營養(yǎng)物質(zhì)如氨基酸是mTORC1的重要激活因子。研究發(fā)現(xiàn),氨基酸介導(dǎo)的mTORC1信號通路的激活在溶酶體上進(jìn)行,由一系列蛋白質(zhì)復(fù)合物參與這一復(fù)雜過程的調(diào)控,其中Ragulator五元復(fù)合物作為該信號通路的核心骨架,調(diào)控Rag小G蛋白和mTORC1在溶酶體上的定位,但Ragulator復(fù)合物如何組裝并招募下游蛋白的作用機(jī)制尚不清晰。
丁建平研究組長期從事mTORC1信號通路調(diào)控的分子機(jī)制研究,先后測定了mTORC1信號通路中一些重要調(diào)控蛋白包括Rheb、TCTP、S6K和Ego3的結(jié)構(gòu),揭示了它們在mTORC1信號通路中發(fā)揮生物學(xué)功能的分子基礎(chǔ),完成了酵母TORC1信號通路中Ego1-Ego2-Ego3三元復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)測定和功能分析,以及mTORC1信號通路上游人源精氨酸感應(yīng)蛋白CASTOR1-arginine復(fù)合物的結(jié)構(gòu)測定和對底物的識別機(jī)制。在此基礎(chǔ)上,丁建平研究組對mTORC1信號通路開展了進(jìn)一步研究,測定了Ragulator五元復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)Ragulator復(fù)合物中包含MP1-p14和HBXIP-C7orf59兩個(gè)亞復(fù)合物,并由p18亞基介導(dǎo)兩個(gè)亞復(fù)合物的結(jié)合、組裝成五元復(fù)合物。通過結(jié)構(gòu)分析和功能實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)Ragulator復(fù)合物作為骨架蛋白發(fā)揮功能,通過p18的N端結(jié)構(gòu)域和MP1-p14復(fù)合物兩個(gè)結(jié)合位點(diǎn)與Rag小G蛋白的Roadblock結(jié)構(gòu)域結(jié)合,并在氨基酸等信號因子的激活下進(jìn)一步招募mTORC1定位在溶酶體上。結(jié)構(gòu)分析和體外活性測定否定了早期認(rèn)為的Ragulator具有針對Rag小G蛋白的GEF活性,并預(yù)測存在尚未鑒定的GEF蛋白與Ragulator復(fù)合物結(jié)合,共同激活下游Rag小G蛋白。研究發(fā)現(xiàn),mTORC1信號通路的抑制因子C17orf59,通過競爭性結(jié)合Rag小G蛋白在MP1-p14復(fù)合物上的結(jié)合位點(diǎn),抑制Rag小G蛋白在溶酶體上的定位,從而抑制下游mTORC1活性。通過結(jié)構(gòu)比較發(fā)現(xiàn),人源Ragulator復(fù)合物和酵母Ego1-Ego2-Ego3復(fù)合物在結(jié)構(gòu)上非常相似,表明這兩個(gè)復(fù)合物在mTORC1/TORC1信號通路中發(fā)揮相似的功能。這些研究結(jié)果進(jìn)一步闡釋了氨基酸等營養(yǎng)物質(zhì)對mTORC1信號通路的調(diào)控機(jī)制,并為mTORC1功能異常相關(guān)疾病研究和基于mTORC1信號通路的藥物設(shè)計(jì)提供了重要信息。
研究工作得到國家自然科學(xué)基金委、中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)和中科院青年創(chuàng)新促進(jìn)會的支持。
a.Ragulator復(fù)合物招募Rag小G蛋白和mTORC1復(fù)合物在溶酶體上定位的工作模型;b.人源Ragulator復(fù)合物和酵母Ego1-Ego2-Ego3復(fù)合物結(jié)構(gòu)上非常相似,表明這兩個(gè)復(fù)合物在mTORC1/TORC1信號通路中發(fā)揮相似的功能。