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可用高速計算機來分析分子的電子密度的三維圖形

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2019-03-12  來源:儀器信息網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):874

可用高速計算機來分析分子的電子密度的三維圖形

利用這些以及類似的技術(shù),或單獨使用,或結(jié)合使用,就可以測出
很多蛋白質(zhì)的分子量及其大致的形狀。然而這種形狀只不過是近似的,
用這些技術(shù)并不能得到所有的原子空間分布的真正指征。只有x射線衍
射分析可以測定出詳細結(jié)構(gòu)。X射線被電子所散射,其散射程度與分子
中任何點電子密度成正比。

為了能測定x射線散射并避免相鄰分子的散射干擾,分子必須是在
空間排列的。結(jié)晶體就是分子的有序排列,所以用這種技術(shù)測定蛋白質(zhì)
結(jié)構(gòu)的先決條件就是要使蛋白質(zhì)結(jié)晶。這件事常常并不是容易的,要長
成大小和結(jié)構(gòu)都滿意的結(jié)晶,可能要花好幾年的時間。通常蛋白質(zhì)的金
屬衍生物都是結(jié)晶化的,因為金屬是很好的x射線散射中心,它將為其
他可能與電子密度有關(guān)的分子提供一個參考點。從x射線被蛋白質(zhì)晶體
的散射而得到的衍射照像的詳細情況,可用高速電子計算機來分析,用
這種方法,建立起了一種分子的電子密度的三維圖形??梢詼y得0.2毫
微米的蛋白質(zhì)分辨率。肽鍵各原子之間相距大約就是這個距離。蛋白質(zhì)
鏈上相鄰部分的原子互相可接近到約0.3毫微米。這就給出了在這種分
辨率下可以得到的結(jié)構(gòu)細節(jié)的指征。遺憾的是,這種技術(shù)是既費錢又費
工,而且也很難得到滿意的結(jié)晶,所以目前只限于在相當(dāng)少數(shù)幾種蛋白
質(zhì)中應(yīng)用。

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