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鄭國(guó)隆制作團(tuán)隊(duì)不間斷刊出:較高散布肝細(xì)胞組學(xué)數(shù)據(jù)分析新進(jìn)展

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2021-06-17  來(lái)源:儀器網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):84
核心提示:脂質(zhì)組學(xué)在生命科學(xué)研究中占據(jù)非常重要的地位。但是,全面的脂質(zhì)分析受到脂質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性、性質(zhì)復(fù)雜性的挑戰(zhàn)。常用的基于質(zhì)譜技術(shù)的脂質(zhì)組學(xué)分析方法包括直接進(jìn)樣(“鳥槍法”)、色譜-質(zhì)譜聯(lián)用、基質(zhì)輔助激光解離質(zhì)譜成像等,而超高效液相色譜-高分辨質(zhì)

  脂質(zhì)組學(xué)在生命科學(xué)研究中占據(jù)非常重要的地位。但是,全面的脂質(zhì)分析受到脂質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性、性質(zhì)復(fù)雜性的挑戰(zhàn)。常用的基于質(zhì)譜技術(shù)的脂質(zhì)組學(xué)分析方法包括直接進(jìn)樣(“鳥槍法”)、色譜-質(zhì)譜聯(lián)用、基質(zhì)輔助激光解離質(zhì)譜成像等,而超高效液相色譜-高分辨質(zhì)譜(UHPLC-HRMS)非靶向分析和UHPLC -三重四極桿質(zhì)譜靶向分析是最常用的分析平臺(tái)之一,存在著各自鮮明的優(yōu)缺點(diǎn)。

  近日,中科院大連化物所的許國(guó)旺研究員團(tuán)隊(duì)在基于UHPLC-HRMS聯(lián)用技術(shù)分析脂質(zhì)代謝物方面取得了新進(jìn)展,研究結(jié)果發(fā)表在 Analytical Chemistry 雜志 (2018 Jun 8. doi: 10.1021/acs.analchem.8b01331.)。

  該課題組結(jié)合非靶向和靶向方法的優(yōu)勢(shì),建立了一種具有高檢測(cè)覆蓋度的擬靶向脂質(zhì)組學(xué)分析方法,涵蓋19個(gè)脂類,3377個(gè)脂質(zhì)離子對(duì),覆蓋7000多種脂質(zhì)分子結(jié)構(gòu)。

  該課題組首先使用UHPLC-HRMS聯(lián)用技術(shù)在全掃(Full Scan)和數(shù)據(jù)依賴采集(DDA)模式下對(duì)不同來(lái)源的生物樣品(細(xì)胞、組織、血漿)進(jìn)行分析,根據(jù)獲得的保留時(shí)間、精確分子量以及二級(jí)碎片信息對(duì)脂質(zhì)分子進(jìn)行歸屬。沒有二級(jí)碎片的脂質(zhì)分子通過與已知脂質(zhì)或自建數(shù)據(jù)庫(kù)中的保留時(shí)間和精確分子量進(jìn)行比對(duì),靶向提取脂質(zhì)信息,以獲得盡可能大的脂質(zhì)覆蓋度。

  對(duì)于理論存在但是未被檢測(cè)到的脂質(zhì)分子(文中稱擴(kuò)展脂質(zhì)),通過保留時(shí)間與已知脂質(zhì)的?;湹奶紨?shù)或酰基鏈的雙鍵數(shù)之間的關(guān)系對(duì)保留時(shí)間進(jìn)行預(yù)測(cè)。根據(jù)脂質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)特征以及質(zhì)譜行為,建立包含已知脂質(zhì)和擴(kuò)展脂質(zhì)的離子對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)。

  最后,將所有的脂質(zhì)離子對(duì)應(yīng)用到動(dòng)態(tài)多反應(yīng)監(jiān)測(cè)中,建立基于液相色譜-質(zhì)譜的高覆蓋擬靶向脂質(zhì)組學(xué)分析方法。該方法具有良好的線性、重復(fù)性,更低的檢測(cè)線,更高的覆蓋度,更好的數(shù)據(jù)質(zhì)量,尤其適合大規(guī)模脂質(zhì)組學(xué)分析。

  該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、國(guó)家重點(diǎn)研究發(fā)展計(jì)劃以及大連化物所創(chuàng)新基金的資助。

  該論文作者:

  Qiuhui Xuan, Chunxiu Hu, Di Yu, Lichao Wang, Yang Zhou, Xinjie Zhao, Qi Li, Xiaoli Hou, and Guowang Xu.

  鏈接:

    標(biāo)題:

  Development of a High Coverage Pseudotargeted Lipidomics

  Method Based on Ultra-High Performance Liquid Chromatography?

  Mass Spectrometry

  出處:

  Anal. Chem., May 29, 2018, DOI: 10.1021/acs.analchem.8b01331

 
 
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