Agilent的生物芯片（系統(tǒng)）和別的公司的生物芯片（系統(tǒng)）一樣，同樣由：掃描儀、生物芯片、分析軟件，三部分組成。

Agilent的芯片掃描儀，叫SureScan DX。SureScan DX已經(jīng)取得了歐洲的CE認(rèn)證，和中國(guó)的CFDA認(rèn)證，可以應(yīng)用于臨床。

Agilent（目前）生產(chǎn)的芯片，可以根據(jù)點(diǎn)陣密度的不同，分成密度較低的HD芯片、和高密度的G3芯片。

Agilent公司除了提供：CGH芯片、和表達(dá)譜芯片之外，還提供：microRNA芯片、甲基化芯片、ChIP芯片、基因合成用的Oligo Library Synthesis芯片。

HD芯片，一張芯片上最多可以有24萬(wàn)4千個(gè)點(diǎn),高密度的G3芯片，一張芯片上最多可以有1百萬(wàn)個(gè)點(diǎn)。

而一張芯片上，又可以根據(jù)點(diǎn)陣的分區(qū)的情況，區(qū)分成：1個(gè)區(qū)的、2個(gè)區(qū)的、4個(gè)區(qū)的、和8個(gè)區(qū)的。分的區(qū)越多，則一張芯片上，可以同時(shí)檢測(cè)的樣本數(shù)就越多。但是分區(qū)越多，每個(gè)樣本可以檢測(cè)的數(shù)據(jù)點(diǎn)就越少。

Affymetrix 公司是著名的生物芯片公司。它的芯片當(dāng)中包含了：RNA表達(dá)量分析（表達(dá)譜芯片）、SNP檢測(cè)（基因分型）、拷貝數(shù)變異（Copy Number Variation，CNV）、small RNA、甲基化等多種芯片。

首先，我們介紹一下 Affymetrix 的（生物芯片的）儀器，目前在售的儀器，主要有4個(gè)機(jī)型，從小到大，分別是：

1.???GeneAtlas

2.???GeneChipScanner 3000 7G（簡(jiǎn)稱：7G）

3.???GeneChipSystem 3000 DX2（簡(jiǎn)稱：DX2）

4.???GeneTitan

GeneAtlas 是一個(gè)小型系統(tǒng)，它主要可以掃描4張芯片一組的小芯片條。它的特點(diǎn)是：經(jīng)濟(jì)、易用。

GeneChip Scanner 3000 7G（7G）和GeneChipSystem 3000 DX2（DX2）。是一款機(jī)器的2個(gè)版本，其中，“7G”版是科研型版本、 “DX2”是臨床版本。其中，DX2已經(jīng)取得了美國(guó)FDA和中國(guó)CFDA的認(rèn)證。

GeneTitan 是新機(jī)型，它的通量更大，自動(dòng)化程度更高。平均到每個(gè)樣本的檢測(cè)成本更低。

GeneTitan在生物樣本庫(kù)項(xiàng)目（BioBank）當(dāng)中，應(yīng)用很多介紹完儀器，接下來(lái)，我們來(lái)介紹Affymetrix 芯片的制造過(guò)程。

在高通量SNP檢測(cè)的市場(chǎng)上，Illumina的生物芯片有著巨大優(yōu)勢(shì)。新近很火的美國(guó)“23 and ME公司”，就是用的Illumina的Human Omni Express生物芯片來(lái)做SNP檢測(cè)的。

Illumina的SNP生物芯片的優(yōu)勢(shì)在于：

第1，它的檢測(cè)通量很大，一次可以檢測(cè)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)個(gè)SNP位點(diǎn)

第2，它的檢測(cè)準(zhǔn)確性很高，它的準(zhǔn)確性可以達(dá)到99.9%以上

第3，它的檢測(cè)的費(fèi)用相對(duì)低廉，大約一個(gè)90萬(wàn)位點(diǎn)的芯片（每個(gè)樣本的）檢測(cè)費(fèi)用在一、兩千人民幣

Illumina的生物芯片系統(tǒng)，主要是由：芯片、掃描儀、和分析軟件組成。

目前它主要的掃描儀有HiScan和iScan兩款。另外，NextSeq 550型（測(cè)序儀）也可以掃描部分類型的芯片。