產(chǎn)品及特點
扎伊爾埃博拉病毒(Zaire Ebola Virus,ZEBO)是一種RNA病毒,是一種能引起人類和其他靈長類動物產(chǎn)生埃博拉出血熱的烈性傳染病病毒,其引起的埃博拉出血熱是當今世界上致命的病毒性出血熱,感染者癥狀與同為纖維病毒科的馬爾堡病毒極為相似,包括惡心、嘔吐、腹瀉、膚色改變、全身酸痛、體內(nèi)出血、體外出血、發(fā)燒等。死亡率在50%至90%之間,致死原因主要為中風(fēng)、心肌梗塞、低血容量休克或多發(fā)性器官衰竭,因此快速準確鑒定對該病的預(yù)防和檢疫有著重要作用。本產(chǎn)品基于PCR原理開發(fā)。它具有下列特點: 一站式,用于不需要單獨準備每種成分,包括引物和對照。根據(jù)扎伊爾埃博拉病毒的保守基因序列設(shè)計的引物,具有良好的特異性?;谌玖戏╭RT-PCR檢測,靈敏度比常規(guī)RT-PCR高10-100倍,可以達到至少1000拷貝/反應(yīng)。使用一管式qRT-PCR技術(shù),RT和PCR兩步在一個試管內(nèi)完成,不需要中間轉(zhuǎn)移樣品,降低了操作誤差和可能的污染。本產(chǎn)品足夠50次30 L體系的RT-PCR,只能用于科研,不能用于臨床。
規(guī)格及成分
成 份
編號
十孔盒包裝
2 qRT-PCR 緩沖液
190101a
500 L(棕色管)
10 qRT-PCR酶混合液
190101b
100 L(紅蓋)
ROX染料I
190101c
50 L(棕色管)
ROX染料II
190101d
50 L(棕色管)
熒光PCR模板稀釋液
180701
1mL(亮黃蓋)
扎伊爾埃博拉病毒RT-PCR引物混合液
14-30050yw
100 L(白蓋)
扎伊爾埃博拉病毒RT-PCR陽性對照
(1 10E8拷貝/ L)
14-30050pc
50 L(黃蓋)
天凈沙核酸釋放劑試用裝
61202
20次(1mL,綠蓋)
使用手冊
14-30050sc
1份
運輸及保存
低溫運輸,-20℃保存,保存期限為12個月。陽性對照需要因易污染其他成分需要單獨放置。本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供RNA段作為陽性對照。
自備試劑
樣品RNA
使用方法
一、稀釋陽性對照(以10E2-10E7這6個10倍稀釋度為例。由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原。標記6個離心管,分別為7,6,5,4,3,2。用帶芯槍頭分別加入45 L 熒光PCR模板稀釋液,用帶芯槍頭,下同)。在7號管中加入5 L 1 10E8拷貝/ L 的陽性對照(本試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得1 10E7拷貝/ L的陽性對照。放冰上待用。換槍頭,在6號管中加入5 L 1 10E7拷貝/ L 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1 10E6拷貝/ L的陽性對照。放冰上待用。換槍頭,在5號管中加入5 L 1 10E6拷貝/ L 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1 10E5拷貝/ L的陽性對照。放冰上待用。重復(fù)上面的操作直到得到6個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。
二、樣品RNA的制備如果有N個樣品,必須設(shè)置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照),一個是NC(樣品制備陰性對照)??梢杂?0 L上步制備的陽性對照梯度稀釋液中的第4號(濃度為1 10E4拷貝/ L,10 L相當于1萬拷貝)再加上一定量的水作為制備的陽性對照(加水后其總體積跟樣品一樣,樣品體積多少取決于所用試劑盒的要求)??梢杂盟鳛橹苽涞年幮詫φ铡S米赃x方法純化N+2個樣品的RNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒RNA提取試劑盒兼容。本試劑盒免費贈送20次免RNA提取的天凈沙核酸釋放劑試用裝
三、設(shè)置RT-PCR反應(yīng)(20 L體系,在樣品制備室進行)如果做定量分析并且只做1次重復(fù),則標記N+9個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照,6個用于標準曲線。如果做定性分析,并且只做1次重復(fù),則標記N+4個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(用水做模板),1個用于PCR陽性對照(用第4號陽性對照稀釋液做模板)。下面只描述定量分析的步驟,定性分析只是把6個標曲反應(yīng)縮減成1個,其余不變。在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對照,陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子后后加):
成分
N+2個制備所得樣品
RT-PCR陰性對照
RT-PCR陽性
對照(2-7管)
2 qRT-PCR 緩沖液
10 L
10 L
各10 L
口蹄疫病毒RT-PCR
引物混合物
2 L
2 L
各2 L
50 ROX (見注)
0.4 L
0.4 L
各0.4 L
樣品制備所得RNA模板(來于第8步)
5.6 L
不加
不加
稀釋所得6個陽性對照(來于第6步)
不加
不加
各5.6 L(2號樣到2號管,3號樣到3號管 )
10 qRT-PCR
酶混合液
2 L
2 L
2 L
注:需使用ROX染料I的機型:ABI Prism7000、7300、7700、7900HT、Step-One、Step-One Plus。
需使用ROX染料II的機型::ABI Prism 7500、7500Fast、MJ Research的Chromo4、Opticon(II)Corbett Rotor Gene 3000。
不需要使用ROX的機型:Thermal Cycle Dice Real Time System, LightCycler、Smart Cycler System、Agilent Mx3000P、RotorGene 3000、RotorGene 6000。上機后按下面參數(shù)進行RT-PCR(參數(shù)可能會因儀器不同而需優(yōu)化)。
過程
溫度
時間
RT(逆轉(zhuǎn)錄)
50℃
15-30分鐘
預(yù)變性
94℃
2分鐘
RT - PCR反應(yīng)
(30個循環(huán))
95℃
15 秒
60℃
15 秒(采集FAM通道的熒光信號)
72℃
15 秒
按儀器預(yù)設(shè)程序進行溶解曲線分析數(shù)據(jù)處理如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的Ct值從標準曲線上推算出樣品RNA濃度的log值,再推算出其濃度。如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct值應(yīng)該小于或等于30。對待測樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。
關(guān)聯(lián)產(chǎn)品
扎伊爾埃博拉病毒可視化RT-LAMP檢測試劑盒