科技前沿人類病原菌及其引發(fā)的疾病嚴(yán)重威脅公眾健康,亟需發(fā)展高靈敏性、高特異性的診斷工具。監(jiān)測人類病原菌并追溯其污染來源對人類健康具有重要意義。目前對人類病原菌的監(jiān)測主要有兩個挑戰(zhàn),一是多個病原菌豐度的同時定量,對微生物污染水平、健康風(fēng)險的綜合評估具有必要性;二是微生物污染來源的鑒定,對環(huán)境管理者減緩或控制環(huán)境污染的相關(guān)舉措至關(guān)重要。
中國科學(xué)院城市環(huán)境研究所發(fā)展一種高靈敏度(80%)和高特異性(99%)的高通量熒光定量芯片,可同時對23種人類病原菌的68個標(biāo)記基因和10種糞源宿主的23個標(biāo)記基因進(jìn)行定量。研究團(tuán)隊基于該芯片對廈門13個海濱浴場的水體進(jìn)行病原菌檢測和污染溯源,并結(jié)合nanopore三代長片段測序技術(shù)對水體潛在病原菌進(jìn)行檢測。該研究發(fā)展的針對微生物污染監(jiān)測和溯源的高通量定量芯片將為病原菌相關(guān)的健康評估提供數(shù)據(jù),為人類健康發(fā)展的環(huán)境管理措施提供科學(xué)依據(jù)。
相關(guān)研究成果以High-throughput diagnosis of human pathogens and fecal contamination in marine recreational water為題發(fā)表在Environmental Research上,城市環(huán)境所蘇建強(qiáng)研究組博士安新麗為論文第一作者。該研究得到國家重點研發(fā)計劃的支持。
基于HT-qPCR分析的糞便污染溯源的標(biāo)記基因靈敏性和特異性驗證
中國科學(xué)院城市環(huán)境研究所發(fā)展一種高靈敏度(80%)和高特異性(99%)的高通量熒光定量芯片,可同時對23種人類病原菌的68個標(biāo)記基因和10種糞源宿主的23個標(biāo)記基因進(jìn)行定量。研究團(tuán)隊基于該芯片對廈門13個海濱浴場的水體進(jìn)行病原菌檢測和污染溯源,并結(jié)合nanopore三代長片段測序技術(shù)對水體潛在病原菌進(jìn)行檢測。該研究發(fā)展的針對微生物污染監(jiān)測和溯源的高通量定量芯片將為病原菌相關(guān)的健康評估提供數(shù)據(jù),為人類健康發(fā)展的環(huán)境管理措施提供科學(xué)依據(jù)。
相關(guān)研究成果以High-throughput diagnosis of human pathogens and fecal contamination in marine recreational water為題發(fā)表在Environmental Research上,城市環(huán)境所蘇建強(qiáng)研究組博士安新麗為論文第一作者。該研究得到國家重點研發(fā)計劃的支持。
基于HT-qPCR分析的糞便污染溯源的標(biāo)記基因靈敏性和特異性驗證