Trace Genomics公司稱已獲400萬(wàn)美元的種子投資,將開(kāi)始啟動(dòng)第一項(xiàng)檢測(cè)服務(wù)。其內(nèi)容為對(duì)12種會(huì)導(dǎo)致萵苣、草莓等作物生病的土源性病原體進(jìn)行檢測(cè)分析。
Trace Genomics介紹
Trace Genomics公司是一家專門針對(duì)土壤微生物檢測(cè)的公司,其最初的目標(biāo)是服務(wù)加利福利亞州中央谷的種植者,但后面發(fā)現(xiàn)這些檢測(cè)也能為更多的人所用。除了種植者,一些與種植者的工作相關(guān)的跨國(guó)企業(yè)集團(tuán),比如可口可樂(lè),對(duì)公司的檢測(cè)服務(wù)也非常感興趣。
Trace Genomics公司使用Illumina公司的NGS技術(shù),不過(guò)它真正的優(yōu)勢(shì)在于其在分子生物學(xué),樣本準(zhǔn)備,定量以及生物信息學(xué)方面獲得的專利技術(shù),這些專利技術(shù)使得他們不僅僅是一個(gè)測(cè)序外包服務(wù)公司。
公司總部位于舊金山,目前有8名全職員工,但它正迅速成長(zhǎng)。
檢測(cè)項(xiàng)目介紹
第一批開(kāi)展的檢測(cè)包含12種病原體,這些病原體會(huì)導(dǎo)致萵苣和草莓患上疾病。目前該檢測(cè)售價(jià)199美元,需要2到3周出檢測(cè)結(jié)果。
目前,大部分的土壤檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室都是依賴基于培養(yǎng)法及PCR法去檢測(cè)病原體。但是這要求必須成功培養(yǎng)這些病原體,但是很多病原體是無(wú)法成功培養(yǎng)的。而使用NGS的優(yōu)勢(shì)在于可以發(fā)現(xiàn)未知病原體以及同時(shí)檢測(cè)多種病原體。
然而,土壤是一個(gè)非常富挑戰(zhàn)性的檢測(cè)物質(zhì),它含有太多的化學(xué)物質(zhì)會(huì)抑制測(cè)序反應(yīng)。因此,分離細(xì)胞以及基因組物質(zhì)提取的技術(shù)顯得非常重要。關(guān)于該技術(shù),公司稱,正在與相關(guān)學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)合作驗(yàn)證,驗(yàn)證后會(huì)將成果發(fā)表。
雖然目前提供給客戶的數(shù)據(jù)只針對(duì)這12種病原體。但是公司的目標(biāo)是全球范圍內(nèi)價(jià)值40億美元的農(nóng)作物檢測(cè)市場(chǎng)。測(cè)序除了針對(duì)一些已知的物種,其還具有廣泛性的特征。公司對(duì)細(xì)菌的檢測(cè)也不局限在那些病原菌上,同時(shí)那些對(duì)植物生長(zhǎng)有益的菌株也在檢測(cè)范圍內(nèi)。公司一直致力發(fā)展期分子生物學(xué)技術(shù),為有益微生物的檢測(cè)提供行之有效的方法。