1月20日,管軼教授在接受財(cái)新網(wǎng)的采訪后,遭到大量責(zé)罵和攻擊。但他和團(tuán)隊(duì)一直在汕頭大學(xué)和香港大學(xué)聯(lián)合病毒研究所中緊張工作,對(duì)新冠病毒及其引發(fā)的疾病進(jìn)行系統(tǒng)研究,幫助當(dāng)?shù)蒯t(yī)院篩查、檢測(cè),優(yōu)化檢測(cè)試劑盒與治療方案,并參與對(duì)病毒的進(jìn)化與溯源的研究。
剛剛,管軼教授和廣西醫(yī)科大學(xué)胡艷玲教授作為共同通訊作者在預(yù)印本網(wǎng)站bioRxiv 發(fā)表題為:Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China 的最新研究論文。
研究團(tuán)隊(duì)對(duì)廣西和廣東反走私行動(dòng)中查獲的多個(gè)穿山甲樣本進(jìn)行檢測(cè),并在穿山甲樣本中發(fā)現(xiàn)了冠狀病毒,屬于此次新冠病毒的兩個(gè)亞型,其中一個(gè)受體結(jié)合域與新冠病毒密切相關(guān)。
此次發(fā)現(xiàn)穿山甲冠狀病毒的多個(gè)譜系及其與新冠病毒的相似性表明,穿山甲應(yīng)被視為此次新型冠狀病毒的可能中間宿主,再次強(qiáng)調(diào)應(yīng)禁止在菜市場(chǎng)等交易穿山甲等野生動(dòng)物。
這是繼2月6日,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)宣布發(fā)現(xiàn)穿山甲為新型冠狀病毒潛在中間宿主后的又一力證。
管軼團(tuán)隊(duì)收集了2017年8月至2018年1月期間廣西海關(guān)在反走私行動(dòng)中查獲的18個(gè)冷凍穿山甲的(肺,腸,血液)等43個(gè)組織樣品。
令人驚訝的是,高通量測(cè)序顯示在43個(gè)樣本中的六個(gè)(兩個(gè)肺,兩個(gè)腸,一個(gè)肺腸混合物,一個(gè)血液)存在冠狀病毒。
接下來,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)2018年5月至7月之間收集的另一批穿山甲樣品進(jìn)行了進(jìn)一步的qPCR檢測(cè)。發(fā)現(xiàn)12只穿山甲的19個(gè)樣本(九個(gè)腸組織,十個(gè)肺組織)中,三個(gè)肺組織樣本呈冠狀病毒陽性。
然后,管軼團(tuán)隊(duì)聯(lián)系了廣州海關(guān)技術(shù)中心,中心重新檢測(cè)了他們?cè)谌路莸姆醋咚叫袆?dòng)中查獲的五份存檔的穿山甲樣品,這些樣本中同樣發(fā)現(xiàn)了冠狀病毒。
這些在穿山甲中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒的基因組,與新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)基因組相似率在85.5%—92.4%,并在系統(tǒng)進(jìn)化樹中代表了新冠病毒的兩個(gè)亞型,其中之一(GD/P1L和GD/P2S)與新冠病毒密切相關(guān)。
新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)屬于 冠狀病毒屬的Sarbecovirus亞屬,先前已經(jīng)注意到,Sarbecovirus亞屬的冠狀病毒成員經(jīng)歷了廣泛的基因重組。
管軼團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步進(jìn)行了重組分析,分析結(jié)果顯示,蝠冠狀病毒ZC45和ZCS21包含多個(gè)SARS-CoV相關(guān)譜系(基因組區(qū)域2、5、7)和新冠病毒相關(guān)譜系(包括此次穿山甲中發(fā)現(xiàn)的病毒譜系)的基因組片段 (區(qū)域1、3、4、6、8)。
然而,更值得注意的是在穿山甲冠狀病毒、蝙蝠冠狀病毒RaTG13和新冠病毒之間觀察到了推測(cè)的重組信號(hào),特別是新冠病毒與廣東穿山甲冠狀病毒的受體結(jié)合域的氨基酸序列相似性高達(dá)97.4%。但蝙蝠冠狀病毒RaTG與新冠病毒的受體結(jié)合域的氨基酸相似度僅為89.2%。
但系統(tǒng)發(fā)育分析表明,廣東穿山甲冠狀病毒并非新冠病毒的最接近親緣關(guān)系。因此,研究團(tuán)隊(duì)推測(cè),廣東穿山甲冠狀病毒與新冠病毒之間的氨基酸相似性可能是由于趨同進(jìn)化而不是重組引起的。
迄今為止,穿山甲是除蝙蝠以外唯一被新冠病毒相關(guān)冠狀病毒感染的哺乳動(dòng)物。
在這項(xiàng)研究中,管軼團(tuán)隊(duì)在穿山甲中發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)冠狀病毒譜系,且它們都與新冠病毒(SARS-CoV-2)相關(guān)。這表明穿山甲極可能是這些冠狀病毒的長期宿主。
以上內(nèi)容來源:BioWorld
新冠病毒來源及宿主研究進(jìn)程一覽
1月22日,國家疾控中心主任、中國科學(xué)院院士高福在國務(wù)院召開的首場(chǎng)武漢疫情新聞發(fā)布會(huì)上表示,目前來看,新型冠狀病毒的來源是武漢一家海鮮市場(chǎng)非法銷售的野生動(dòng)物。
2020年1月21日,中國科學(xué)院上海巴斯德研究所郝沛研究員、軍事醫(yī)學(xué)研究院國家應(yīng)急防控藥物工程技術(shù)研究中心鐘武研究員和中科院分子植物卓越中心合成生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室李軒研究員合作,研究發(fā)現(xiàn)武漢冠狀病毒和SARS/類SARS冠狀病毒的共同祖先都是和HKU9-1類似的病毒。并推測(cè)和SARS一樣,武漢冠狀病毒的自然宿主也可能是蝙蝠,在從蝙蝠到人的傳染過程中很可能存在未知的中間宿主媒介。
2020年1月22日,北京大學(xué)、廣西中醫(yī)藥大學(xué)、寧波大學(xué)及武漢生物工程學(xué)院聯(lián)合攻關(guān),該研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)蛇是最有可能造成當(dāng)前武漢新型冠狀病毒(2019-nCoV)感染的野生動(dòng)物。
然而,僅僅一天之后的2020年1月23日,發(fā)現(xiàn)SARS病毒來源于中華菊頭蝠的中科院武漢病毒所石正麗團(tuán)隊(duì)認(rèn)為蝙蝠才是最有可能的攜帶武漢新型冠狀病毒(2019-nCoV)的野生動(dòng)物。
石正麗團(tuán)隊(duì)成員,中間為石正麗教授
1月24日,北京大學(xué)工學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系教授朱懷球團(tuán)隊(duì)最新研究預(yù)測(cè)表明,蝙蝠和水貂可能是新型冠狀病毒的兩個(gè)潛在宿主,蝙蝠是它的最主要來源,中間宿主可能是水貂。
2月6日,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)宣布發(fā)現(xiàn)穿山甲為新型冠狀病毒潛在中間宿主。