國家生物信息中心(CNCB)/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心(NGDC)首批自主收錄的5株2019新型冠狀病毒基因組序列實(shí)現(xiàn)與美國NCBI核酸數(shù)據(jù)庫GenBank數(shù)據(jù)同步與共享。
CNCB/NGDC建立的2019新型冠狀病毒信息庫(2019nCoVR)已匯交并整合全球范圍內(nèi)產(chǎn)出的82株病毒的87條非冗余基因組序列信息,是目前收錄2019新型冠狀病毒基因組數(shù)目最多的數(shù)據(jù)庫。
為了進(jìn)一步擴(kuò)大2019-nCoV基因組序列應(yīng)用范圍,CNCB/NGDC與國際生物信息數(shù)據(jù)庫建立了數(shù)據(jù)同步共享機(jī)制,第一批自主收錄的5個(gè)2019-nCoV全基因組序列(序列編號為GWHABKF00000000-GWHABKJ00000000)已經(jīng)在NCBI發(fā)布。通過共享機(jī)制,國內(nèi)研究人員只需將數(shù)據(jù)遞交一次,即可實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)在CNBC/NGDC和NCBI同時(shí)發(fā)布。
據(jù)悉,從2020年1月以來,陸續(xù)有30余株2019新型冠狀病毒的基因組序列被國內(nèi)外科學(xué)家破譯,絕大部分?jǐn)?shù)據(jù)都遞交到由德國建立的全球流感序列數(shù)據(jù)庫(GISAID)系統(tǒng)。而2020年1月22日,我國搭建的新型冠狀病毒信息庫正式上線。國家生物信息中心/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心一直致力于構(gòu)建國家級組學(xué)數(shù)據(jù)存儲與共享公共平臺,力爭第一時(shí)間為國內(nèi)乃至全球科學(xué)家提供基因組數(shù)據(jù)的存管用服務(wù)。此次疫情爆發(fā)后,新型冠狀病毒信息庫上線,保持該病毒基因組數(shù)據(jù)發(fā)布動態(tài),持續(xù)為國內(nèi)外科研人員提供方便快捷的數(shù)據(jù)檢索及下載資源。