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新冠病毒核酸檢測(cè)假陰性/假陽(yáng)性問(wèn)題探索及解決方案

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2020-02-10  來(lái)源:儀器信息網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):550
核心提示:在此次新型冠狀病毒疫情中,作為最終確診的關(guān)鍵性技術(shù),核酸檢測(cè)發(fā)揮了及其重要的作用。但是近期關(guān)于核酸檢測(cè)準(zhǔn)確性問(wèn)題的討論甚囂塵上,如何提高檢測(cè)的準(zhǔn)確性,如何減少假陰性/假陽(yáng)性成為困擾檢測(cè)工作者的重要難題。從目前已有的資料來(lái)看,很多方面得到了討論,如:冠狀病毒感染人體后,病變主要發(fā)生肺部,即下呼吸道,上呼吸道咽部病毒含量低,通過(guò)咽拭子檢測(cè)常常出現(xiàn)陰性,再加上其他一些因素,比如:采樣不規(guī)范,運(yùn)輸和存儲(chǔ)等造成病毒RNA降解,核酸檢測(cè)試劑盒的快速審批入市,質(zhì)量參差不齊等等,這些環(huán)節(jié)都可能導(dǎo)致假陰性的發(fā)生。同時(shí)各環(huán)節(jié)

在此次新型冠狀病毒疫情中,作為最終確診的關(guān)鍵性技術(shù),核酸檢測(cè)發(fā)揮了及其重要的作用。但是近期關(guān)于核酸檢測(cè)準(zhǔn)確性問(wèn)題的討論甚囂塵上,如何提高檢測(cè)的準(zhǔn)確性,如何減少假陰性/假陽(yáng)性成為困擾檢測(cè)工作者的重要難題。

從目前已有的資料來(lái)看,很多方面得到了討論,如:冠狀病毒感染人體后,病變主要發(fā)生肺部,即下呼吸道,上呼吸道咽部病毒含量低,通過(guò)咽拭子檢測(cè)常常出現(xiàn)陰性,再加上其他一些因素,比如:采樣不規(guī)范,運(yùn)輸和存儲(chǔ)等造成病毒RNA降解,核酸檢測(cè)試劑盒的快速審批入市,質(zhì)量參差不齊等等,這些環(huán)節(jié)都可能導(dǎo)致假陰性的發(fā)生。同時(shí)各環(huán)節(jié)操作的不規(guī)范,還容易出現(xiàn)假陽(yáng)性的發(fā)生。

而從核酸提取質(zhì)量,熒光定量PCR各品牌,各型號(hào)的對(duì)核酸檢測(cè)試劑的適應(yīng)性的討論就不多見(jiàn)了,本文就病毒核酸提取、qPCR檢測(cè)、體系加樣等環(huán)節(jié),在耶拿公司產(chǎn)品的基礎(chǔ)上提出了一系列解決方案, 供大家參考。

一、核酸提?。?/p>

作為核酸檢測(cè)的起始步驟,病毒核酸能否被高效安全的從樣本中提取出來(lái),將會(huì)成為整個(gè)核酸檢測(cè)至關(guān)重要的一步。在多數(shù)核酸提取的過(guò)程中,操作者將面臨如下幾類問(wèn)題:

1、咽拭子、血清、血漿等上樣量不足,現(xiàn)在普遍是200 L的上樣體積,病毒獲得不足,產(chǎn)生假陰性結(jié)果;

2、病毒富集效率低、裂解不充分,導(dǎo)致核酸產(chǎn)物收率較低而引起的假陰性結(jié)果;

3、提取產(chǎn)物富含高濃度鹽分、有機(jī)物等PCR抑制劑殘留,對(duì)后續(xù)定量PCR檢測(cè)產(chǎn)生抑制產(chǎn)生假陰性結(jié)果;

4、提取過(guò)程中過(guò)度的剪切力將本來(lái)含量不高的病毒核酸破環(huán),病毒核酸完整度差,無(wú)法作為后續(xù)熒光定量PCR模板而導(dǎo)致的假陰性結(jié)果;

5、手工提取過(guò)程復(fù)雜,步驟繁多增加交叉污染概率而導(dǎo)致的假陽(yáng)性結(jié)果;

6、常規(guī)磁棒法全自動(dòng)核酸提取儀因磁棒磁力下降導(dǎo)致磁珠殘留,進(jìn)而導(dǎo)致交叉污染出現(xiàn)假陽(yáng)性/假陰性結(jié)果。

解決方案

德國(guó)耶拿公司InnuPure C16 touch全自動(dòng)核酸提取儀,Cybio-Felix全能型工作站將人們從繁瑣的核酸提取純化過(guò)程中解放出來(lái),大大提高了工作效率和產(chǎn)物質(zhì)量。您只需要加入樣本,選擇相應(yīng)的提取程序,按下“開(kāi)始”即可輕松獲得純凈的核酸。


l 耶拿公司的C16 Touch核酸提取儀,最大上樣體積可到600 L,加大上樣量可以獲得更多核酸,降低假陰性的產(chǎn)生

l 產(chǎn)物無(wú)磁珠殘留,有效防止交叉污染,降低假陽(yáng)性;提取結(jié)果重復(fù)性、均一性更好

其配套的針對(duì)病毒提取的相關(guān)試劑擁有如下兩項(xiàng)專利:

◆ Dual Chemistry Technology

2005年耶拿公司發(fā)明了專利性的核酸提取技術(shù)DC-Technology(雙緩沖液技術(shù)),采用獨(dú)特的裂解緩沖液和新型的結(jié)合緩沖液,無(wú)需使用高鹽結(jié)合,提高核酸提取得率,以及更為完整的核酸片段,降低假陰性可能。

◆ Smart Extraction技術(shù)—新一代核酸提取技術(shù)

  2016年耶拿公司又發(fā)明了專利性的新一代提取技術(shù)Smart Extraction,該技術(shù)打破常規(guī)核酸提取需要借助介質(zhì)吸附核酸的傳統(tǒng),提取過(guò)程無(wú)需酚/氯仿、無(wú)需離子交換、無(wú)需離心柱、無(wú)需硅膠膜、無(wú)需磁珠,僅需tip上下吹打即可完成。提取得到的核酸得率高、完整度高,純度好,降低假陰性的可能性。

二、熒光定量PCR檢測(cè):

當(dāng)檢測(cè)工作者收獲了高質(zhì)量、低雜質(zhì)的樣本核酸后,熒光定量PCR過(guò)程中的檢測(cè)靈敏度、特異性、重復(fù)可靠性就成為了獲取高質(zhì)量檢測(cè)結(jié)果最至關(guān)重要的因素了。

1、基于儀器老化、設(shè)計(jì)缺陷等原因?qū)е碌臒晒舛縋CR儀溫度控制的準(zhǔn)確性、均一性不高,結(jié)果擴(kuò)增效率較低或者批次內(nèi)和批次間的重復(fù)性不佳,導(dǎo)致假陰性結(jié)果;

2、不同型號(hào)儀器采用不同的激發(fā)光源對(duì)結(jié)果會(huì)有一定影響,某些光源使用一定時(shí)間沒(méi)有更換,對(duì)付近期的高強(qiáng)度檢測(cè)工作會(huì)進(jìn)一步降低儀器的靈敏度,導(dǎo)致假陰性結(jié)果;

3、各類熒光定量PCR所采用的檢測(cè)器靈敏度是存在差異的,導(dǎo)致假陰性結(jié)果。

基于以上問(wèn)題

德國(guó)耶拿公司qTOWER3系列熒光定量PCR儀,以其卓越的溫控系統(tǒng)帶來(lái)快速穩(wěn)定的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,先進(jìn)的光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)帶來(lái)高靈敏度的檢測(cè)。

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l 鍍金純銀樣品槽,采用熱傳遞性非常好的銀質(zhì)材料,快速的升降溫速率能夠加快實(shí)驗(yàn)速度,縮短實(shí)驗(yàn)時(shí)間,提高實(shí)驗(yàn)效率。準(zhǔn)確的溫度控制帶來(lái)優(yōu)異的溫度均一性,進(jìn)而帶來(lái)各樣品間以及各批次間穩(wěn)定的定量PCR擴(kuò)增結(jié)果。

l 采用藍(lán)色、綠色、紅色、白色四個(gè)高強(qiáng)度長(zhǎng)壽命LED固態(tài)光源,確保在整個(gè)光譜檢測(cè)范圍內(nèi)都有很強(qiáng)的激發(fā)光強(qiáng),有利于較弱信號(hào)的采集,從而提高實(shí)驗(yàn)檢測(cè)靈敏度,減少假陰性可能。LED光源壽命長(zhǎng),免維護(hù),節(jié)約后續(xù)的使用成本。

l 采用定量PCR儀上最新一代的通道式光電倍增管(CPM)檢測(cè)器,有效降低背景噪音信號(hào),檢測(cè)靈敏度比CCD或PMT(普通光電倍增管)高,提高檢測(cè)靈敏度,減少假陰性可能。

三、液體處理過(guò)程:

近期,各類關(guān)于檢測(cè)工作繁重,人員壓力大,復(fù)檢次數(shù)眾多等,相繼被各類媒體爭(zhēng)相報(bào)道。由此可見(jiàn),面對(duì)如此重大的疫情,檢測(cè)人員所面對(duì)的工作壓力是非常巨大的。

1、在復(fù)雜的檢測(cè)工作中試劑、樣本的錯(cuò)加、漏加都成為假陰性、假陽(yáng)性產(chǎn)生的主要來(lái)源之一;

2、液體處理中的交叉污染也成為了檢測(cè)假陽(yáng)性結(jié)果的主要原因。

在如今的新時(shí)代,各類全自動(dòng)液體處理工作站已經(jīng)在全球各個(gè)生命科學(xué)、疾病藥物診斷研發(fā)、政府機(jī)構(gòu)的高通量檢測(cè)領(lǐng)域中得到廣泛的使用。德國(guó)耶拿公司建議除了前面提到的核酸提取步驟可以采用全自動(dòng)液體處理工作站高效的完成之外,PCR的體系構(gòu)建等工作也可以采用類似的方法來(lái)解決。

德國(guó)耶拿公司Cybio-Felix全能型液體處理工作站,可自動(dòng)完成定量PCR反應(yīng)中涉及到的各類預(yù)混液、引物、模板、去離子水 等的加樣,代替手工快速、準(zhǔn)確、高效地進(jìn)行定量PCR反應(yīng)體系的構(gòu)建,適用于各類PCR體系及成品試劑盒的液體處理。

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1、超高的移液準(zhǔn)確性:確保在小體積量程下實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確地加入模板內(nèi)并且準(zhǔn)確地分裝反應(yīng)體系,有效的減少因加樣產(chǎn)生的假陰性結(jié)果;

2、PCR體系構(gòu)建快速高效,提高檢測(cè)效率,讓更多的疑似患者能夠盡快明確:可在半小時(shí)內(nèi)實(shí)現(xiàn)整版PCR體系構(gòu)建;若采用整板的預(yù)混Mix,則完成速度更快;

3、有效避免交叉污染:儀器運(yùn)行時(shí)完全封閉,避免環(huán)境污染;采用帶濾芯的tip,避免移液頭污染;UV燈滅菌,避免批間污染。且PCR體系構(gòu)建速度較快能減少模板中DNA的揮發(fā),減少系統(tǒng)內(nèi)核酸氣溶膠的濃度大幅減少假陽(yáng)性的發(fā)生概率;

4、提供可放置入于生物安全柜中的型號(hào),避免各類污染,保護(hù)實(shí)驗(yàn)人員安全。

核酸檢測(cè)結(jié)果是否可信,并不能一概而論,如果檢測(cè)儀器、試劑盒都沒(méi)有問(wèn)題,且每個(gè)實(shí)驗(yàn)環(huán)節(jié)都控制的很好,那么結(jié)果就非常可信,反之則無(wú)法判斷。

讓我們齊心協(xié)力,用我們自己的專業(yè)知識(shí)來(lái)共同對(duì)抗疫情。

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