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破武漢封城之局:精準(zhǔn)qPCR檢測+基因測序復(fù)核+抗體水平評估

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2020-02-05  來源:儀器信息網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):950
核心提示:2020舊歷庚子年春節(jié),將注定被銘刻在人類抗疫的史冊上。占全球人口五分之一的中國迎來自己一年一度最盛大的節(jié)日——春節(jié)。數(shù)億人將返鄉(xiāng)、數(shù)億人將外出旅行,他們的足跡將遍及祖國大江南北每個鄉(xiāng)村和世界各大名勝秀地。然而新型冠狀病毒的陰影在佳節(jié)前開始蔓延,并因春節(jié)到來防控難度被指數(shù)級放大。新冠病毒的防控從一開始就受到了我國政府及世衛(wèi)組織的高度重視。1月20日,中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席習(xí)近平作出重要指示,強(qiáng)調(diào)要把人民群眾生命安全和身體健康放在第一位,堅決遏制疫情蔓延勢頭。面對疫情,華大積極參與病原研究,

2020舊歷庚子年春節(jié),將注定被銘刻在人類抗疫的史冊上。占全球人口五分之一的中國迎來自己一年一度最盛大的節(jié)日——春節(jié)。數(shù)億人將返鄉(xiāng)、數(shù)億人將外出旅行,他們的足跡將遍及祖國大江南北每個鄉(xiāng)村和世界各大名勝秀地。然而新型冠狀病毒的陰影在佳節(jié)前開始蔓延,并因春節(jié)到來防控難度被指數(shù)級放大。新冠病毒的防控從一開始就受到了我國政府及世衛(wèi)組織的高度重視。

1月20日,中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席習(xí)近平作出重要指示,強(qiáng)調(diào)要把人民群眾生命安全和身體健康放在第一位,堅決遏制疫情蔓延勢頭。

面對疫情,華大積極參與病原研究,第一時間予以技術(shù)支持,并攜手多國及地區(qū)開展病原合作,進(jìn)行病毒快速檢測、鑒定及病毒變異監(jiān)測。在最早一批提交至全球共享流感病毒數(shù)據(jù)庫GISAID發(fā)布的13例新型冠狀病毒基因組序列數(shù)據(jù)中,有5例數(shù)據(jù)來自華大智造高通量測序儀——MGISEQ-2000,這為研究分析武漢新型冠狀病毒的進(jìn)化來源、致病病理機(jī)制提供了第一手資料。

一、研發(fā)先行,資質(zhì)開路,華大為抗擊疫情提供完整檢測解決方案

2020年1月初,華大基因下屬子公司緊急組織科研及生產(chǎn)力量,開始了相關(guān)試劑盒的研制工作。在通過嚴(yán)格的試劑盒生產(chǎn)工藝和質(zhì)量控制等環(huán)節(jié)確保穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性后,于1月14日官方宣布完成2019新型冠狀病毒核酸檢測試劑盒(RT-PCR熒光探針法)成品的全部研制工作。該新型冠狀病毒核酸檢測試劑盒可以用于疑似患者的快速識別、鑒定,協(xié)助疾控部門和醫(yī)療機(jī)構(gòu)采取及時有效的防控措施。

1 MGISEQ-2000.png

在此期間MGISEQ-2000再次發(fā)揮了其全面靈活、質(zhì)量穩(wěn)定、測序速度快等優(yōu)勢?;贛GISEQ-2000高通量測序儀進(jìn)行高敏PMseq-RNA檢測,對于部分病毒含量較低的樣本,可以作為核酸檢測試劑盒(RT-PCR熒光探針法)的補(bǔ)充,能夠提高陽性檢出率,避免漏檢;對于疑似感染、多重感染或繼發(fā)感染病原樣本,可以提供更多可能感染的病原信息,確定病原的完整基因組,來源和變異情況,提供致病病理機(jī)制有效依據(jù),輔助臨床更加有效的診療。

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目前華大基因已在提供新型冠狀病毒第三方檢測服務(wù)。以華大集團(tuán)旗下華大智造生產(chǎn)的系列測序儀為核心構(gòu)成的世界領(lǐng)先高通量測序平臺,堅如磐石的支撐著大疫當(dāng)前病毒檢測的質(zhì)量與數(shù)量需求。 

華大基因新型冠狀病毒檢測試劑盒和華大智造DNBSEQ-T7測序系統(tǒng)獲得國藥監(jiān)局應(yīng)急審批

冠狀病毒以其不穩(wěn)定、高變異性著稱,因此在用RT-PCR試劑盒篩查的同時,也需用超級測序儀對病毒進(jìn)行可能的變異監(jiān)控。

此次華大基因有兩款試劑盒通過國藥監(jiān)局應(yīng)急審批。其中新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒(熒光PCR法),基于RT-PCR技術(shù)可實現(xiàn)3個小時內(nèi)快速檢測;另一款新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒(聯(lián)合探針錨定聚合測序法)則是基于宏基因組測序的檢測試劑盒,能夠鑒別診斷包括新冠狀病毒在內(nèi)的其他冠狀病毒和呼吸道病原的感染,實現(xiàn)病毒序列快速檢測。獲批試劑盒將會發(fā)往各地醫(yī)院、疾控中心和出入境檢驗檢疫局,用于測定疑似患者的樣本中是否有新型冠狀病毒。

和兩款試劑盒及分析軟件一同獲批的DNBSEQ-T7測序系統(tǒng),是目前全世界日通量最高的測序儀,它能在5小時內(nèi)完成SE50測序,每次運(yùn)行樣本檢測通量達(dá)到50-200樣本,每個樣本可獲得平均100 M以上數(shù)據(jù)產(chǎn)出;最快可在20小時內(nèi)對128個病例實現(xiàn)從樣本到下機(jī)報告的輸出,且每個樣本經(jīng)高通量測序獲得的總Reads數(shù)超過100 M reads,能有效提高病原微生物的檢測靈敏度,在確保高準(zhǔn)確度檢測外,能提供進(jìn)一步病毒演變分析數(shù)據(jù)支持。

為此,華大基因緊急運(yùn)送2臺華大智造超高通量測序儀DNBSEQ-T7支援武漢。作為超高通量測序儀,T7搭載自動化樣本制備系統(tǒng),有望解決檢測瓶頸,進(jìn)一步提升送檢樣本的檢測效率,對武漢疫情的科學(xué)臨床防控提供強(qiáng)有力的技術(shù)支撐。

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精準(zhǔn)的qRT-PCR檢測,配合必要的基因測序復(fù)核,為抗擊疫情提供新型冠狀病毒檢測整體解決方案

截止目前,華大已探索出針對新型冠狀病毒檢測行之有效的整體解決方案:精準(zhǔn)的qRT-PCR檢測,配合必要的基因測序復(fù)核及抗體水平的評估是“紓臨床診斷之困,解社會恐慌之壓、破武漢封城之局”的最佳組合。

使用快速檢測試劑盒(新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒—熒光PCR法)3個小時左右快速檢測出具報告。針對陰性疑似樣本使用基于宏基因組測序的新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒(聯(lián)合探針錨定聚合測序法)進(jìn)行補(bǔ)充復(fù)核,同時鑒別診斷包括新冠狀病毒在內(nèi)的其他冠狀病毒和呼吸道病原的感染。使用抗體檢測可以了解人群中有多少人曾經(jīng)感染過新冠病毒,篩查出無癥狀感染者。

因此結(jié)合RT-PCR和宏基因組檢測,可更快、更全面覆蓋2019-nCoV病毒檢測,并監(jiān)測新型冠狀病毒在傳播過程中可能會發(fā)生的變異,進(jìn)一步結(jié)合抗體檢測進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查。這對新冠的徹底防控以及類似病毒流行病學(xué)的研究與防控,具有重要意義。

二、主動出擊,極致交付,捐贈馳援送愛心

疫情攻堅,需要多方力量共同努力,目前華大主動出擊和各地疾控中心緊密合作,依托高通量測序系統(tǒng)MGISEQ-2000和T7,快速對各地疑似患者進(jìn)行宏基因組測序分析,憑借數(shù)據(jù)質(zhì)量準(zhǔn)確穩(wěn)定和通量靈活等特點(diǎn),在多地為新冠狀病毒疫情的科學(xué)臨床防控提供有力的平臺支撐。在疫情發(fā)生期間,物流運(yùn)輸和技術(shù)支持不間斷提供服務(wù),確保各地檢測第一時間順利開展,在最短時間產(chǎn)出高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)。戰(zhàn)勝疫情,共克時艱。

全力保障試劑盒生產(chǎn)和供應(yīng),極致交付,為疫情一線提供最快響應(yīng)

春節(jié)期間,華大已快速成立了應(yīng)急指揮部,安排人員專職負(fù)責(zé)生產(chǎn)、質(zhì)量、儲運(yùn)方面的監(jiān)控和應(yīng)急值守,開足馬力、全力以赴保障檢測試劑盒的生產(chǎn)和供應(yīng),以盡快讓武漢及全國的疑似病例都能在第一時間使用試劑盒,并在到樣后3小時左右出檢測結(jié)果,有效防控疫情蔓延。華大武漢、深圳、天津等各地團(tuán)隊均已隨時待命,為疫情一線防控提供最快響應(yīng)。

據(jù)悉,華大目前已向包括武漢地區(qū)在內(nèi)的全國各地共投放試劑盒約5萬人份。

同時,華大分別宣布向武漢、湖北各捐贈1萬人份新型冠狀病毒檢測試劑盒,以馳援當(dāng)?shù)匦鹿诜窝追揽?。眼見疫情防控形勢?yán)峻,又于1月29日宣布聯(lián)合各界愛心機(jī)構(gòu)和人士追加捐贈10萬份新型冠狀病毒檢測試劑盒。

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在全力滿足國內(nèi)檢測需求的同時,面向國際華大還與文萊衛(wèi)生部、泰國公共衛(wèi)生部、尼日利亞國家醫(yī)學(xué)研究中心(NIMR)、南非國家衛(wèi)生實驗局國家傳染病研究所(NICD)、中國香港和臺灣地區(qū)的相關(guān)機(jī)構(gòu),達(dá)成“新型冠狀病毒試劑盒”的供應(yīng)和其他病原監(jiān)測方面的合作。 

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三、服務(wù)升級,想一線之所想,急抗疫之所急

疫情前線臨床普遍反應(yīng),目前各地滿足篩查條件和篩查能力的檢測實驗室數(shù)量有限,已有的實驗室滿負(fù)荷工作,無法滿足短時間內(nèi)對所有疑似病患進(jìn)行病毒篩查與確診。然而病毒篩查是此次防控疫情的核心,早一分鐘確診,病患就能早一步得到精準(zhǔn)的治療,就能更早康復(fù)。這既是高瞻遠(yuǎn)矚的國家戰(zhàn)略需要,也是普惠健康的民生工程,更是疫情當(dāng)前急需解決的實際問題。

華大集團(tuán)、萬科集團(tuán)、松禾資本30日對外宣布,將以湖北省為重點(diǎn)地區(qū),在全國范圍內(nèi)緊急征集大約20家PCR醫(yī)學(xué)實驗室,通過猛犸基金會對于具備一定條件的醫(yī)學(xué)實驗室,提供資金和專業(yè)支持,使其快速提升檢測能力,以應(yīng)對不斷增加的檢測需求,預(yù)計捐贈投入近千萬元。

同時,針對抗疫一線檢驗人員對病原微生物檢測臨床應(yīng)用實驗室操作的培訓(xùn)需求,華大已調(diào)集專家緊急制作培訓(xùn)視頻,免費(fèi)上線面向公眾開放。

華大已做好充分準(zhǔn)備,將一如既往利用基因科技的力量,助力國家疫情防控,維護(hù)全球衛(wèi)生安全。疫情攻堅,需要多方力量共同努力,愿更多有志之士攜手共進(jìn),戰(zhàn)勝疫情,共克時艱。

供稿:華大基因股份有限公司醫(yī)療器械部

基因測序儀專場

“抗擊新冠疫情 儀器人在行動”專題

 
 
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