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用于疑似患者、變異檢測(cè) 華大智造高中低通量測(cè)序儀奔赴前線

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2020-01-31  來源:儀器信息網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):829
核心提示:新冠肺炎疫情牽動(dòng)著每一個(gè)人的心。全力做好肺炎疫情防控工作,是華大智造和社會(huì)各界的共同目標(biāo)。面對(duì)這場(chǎng)沒有硝煙的戰(zhàn)爭(zhēng),華大智造DNBSEQ系列高通量基因測(cè)序儀被用于基因組序列組裝,疑似患者檢測(cè),變異檢測(cè)等肺炎防控關(guān)鍵時(shí)刻。MGISEQ-2000成為最早發(fā)布新型冠狀病毒基因組測(cè)序儀之一MGISEQ-2000作為中高通量測(cè)序儀,在臨床和科研上都廣泛使用,在全國(guó)各地本地化數(shù)據(jù)測(cè)序、助力分析新冠病毒基因組序列等發(fā)揮了重要作用。MGISEQ-200012月30日,在最早一批提交至全球共享流感病毒數(shù)據(jù)庫GISAID發(fā)布的

新冠肺炎疫情牽動(dòng)著每一個(gè)人的心。全力做好肺炎疫情防控工作,是華大智造和社會(huì)各界的共同目標(biāo)。面對(duì)這場(chǎng)沒有硝煙的戰(zhàn)爭(zhēng),華大智造DNBSEQ系列高通量基因測(cè)序儀被用于基因組序列組裝,疑似患者檢測(cè),變異檢測(cè)等肺炎防控關(guān)鍵時(shí)刻。

MGISEQ-2000成為最早發(fā)布新型冠狀病毒基因組測(cè)序儀之一

MGISEQ-2000作為中高通量測(cè)序儀,在臨床和科研上都廣泛使用,在全國(guó)各地本地化數(shù)據(jù)測(cè)序、助力分析新冠病毒基因組序列等發(fā)揮了重要作用。

1 MGISEQ-2000.jpg

MGISEQ-2000

12月30日,在最早一批提交至全球共享流感病毒數(shù)據(jù)庫GISAID發(fā)布的13例新型冠狀病毒基因組序列數(shù)據(jù)中,有5例數(shù)據(jù)來自華大智造高通量測(cè)序儀——MGISEQ-2000,這為研究分析武漢新型冠狀病毒的進(jìn)化來源、致病病理機(jī)制提供了第一手資料。

2 基于MGISEQ-2000技術(shù)平臺(tái)提交的序列數(shù)據(jù).jpg

基于MGISEQ-2000技術(shù)平臺(tái)提交的序列數(shù)據(jù)

1月23日,MGISEQ-2000在北京緊急檢測(cè)任務(wù)中發(fā)揮了至關(guān)重要的作用,接到任務(wù)后,快速進(jìn)行建庫、上機(jī),在1月25日凌晨3點(diǎn)成功下機(jī)。同一時(shí)間,在全球共享流感病毒數(shù)據(jù)庫GISAID數(shù)據(jù)庫中,已公開發(fā)布的新型冠狀病毒基因組序列已增加至26例【1】。

3 新型冠狀病毒2019-nCoV基因組結(jié)構(gòu)示意圖.jpg

新型冠狀病毒2019-nCoV基因組結(jié)構(gòu)示意圖

(來源:Nextstrain)

1月25日,在深圳某醫(yī)院MGISEQ-2000配合臨床診療過程需要,參與溯源分析和研究。

1月27日,位于北京的MGISEQ-2000再次發(fā)揮了其全面靈活、質(zhì)量穩(wěn)定、測(cè)序速度快等優(yōu)勢(shì)。作為核酸檢測(cè)試劑盒(PCR方法)的補(bǔ)充,對(duì)于部分病毒含量較低的樣本,基于MGISEQ-2000高通量測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序,可以提高陽性檢出率,避免漏檢和錯(cuò)檢;對(duì)于疑似感染、多重感染或繼發(fā)感染病原樣本,而基于DNBSEQ高通量測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序,可以進(jìn)行并發(fā)檢測(cè),提供更多可能感染的病原信息。

華大智造高通量測(cè)序儀MGISEQ-2000在路上.jpg

4 華大智造高通量測(cè)序儀MGISEQ-2000在路上.jpg

華大智造高通量測(cè)序儀MGISEQ-2000在路上

超高通量測(cè)序儀DNBSEQ-T7成為規(guī)模化檢測(cè)重器

年末歲初,武漢,在中國(guó)科學(xué)院微生物研究所、山東第一醫(yī)科大學(xué)和華大基因的通力合作下,來自華大智造的DNBSEQ-T7出色完成基因組測(cè)序任務(wù),快速完成該新型冠狀病毒組測(cè)序?!?】

5 基于DNBSEQ-T7的4個(gè)樣本組裝文件.jpg

基于DNBSEQ-T7的4個(gè)樣本組裝文件

1月21日,緊急新增的DNBSEQ-T7測(cè)序儀連夜部署,最快可在20小時(shí)內(nèi)對(duì)128個(gè)病例實(shí)現(xiàn)從樣本到下機(jī)報(bào)告的輸出,且每個(gè)樣本經(jīng)高通量測(cè)序獲得的總Reads數(shù)超過100 Million reads,能有效提高病原微生物的檢測(cè)靈敏度。

6 領(lǐng)域應(yīng)用專家在DNBSEQ-T7前進(jìn)行上機(jī)操作.jpg

領(lǐng)域應(yīng)用專家在DNBSEQ-T7前進(jìn)行上機(jī)操作

除此之外,1月22日,位于上海、廣州等地的DNBSEQ高通量測(cè)序儀——MGISEQ-200也完成數(shù)據(jù)更新,更新后的數(shù)據(jù)庫包含引新型冠狀病毒序列。

華大智造成立應(yīng)急專項(xiàng)小組,開通技術(shù)支持專線

為了更好支持各地區(qū)測(cè)序儀的運(yùn)作,華大智造成立應(yīng)急專項(xiàng)小組、開通應(yīng)急技術(shù)支持專線,24小時(shí)待命,共同助力疫情防控。在全國(guó)配備精銳力量,24小時(shí)待命,提供基于高通量測(cè)序方法的新型冠狀病毒應(yīng)急方案,支持臨床鑒別提供診斷依據(jù)包括新型冠狀病毒在內(nèi)的其他冠狀病毒和呼吸道病原感染,實(shí)現(xiàn)病毒序列快速檢測(cè),并為監(jiān)測(cè)可能存在的病毒變異提供支持。

華大智造也開通了應(yīng)急技術(shù)支持專線(4000-966-988,按語音提示輸入5,即可實(shí)現(xiàn)呼叫),全力協(xié)助疫情防控。

華大智造2019-nCoV高通量測(cè)序解決方案總聯(lián)系人

江博士,15972014336

華大智造2019-nCoV全國(guó)各區(qū)應(yīng)急小組組長(zhǎng)

華北區(qū):杜先生,18911279162

華東區(qū):趙先生,17621034555

華南區(qū):曾先生,18718924024

華中區(qū):蔣先生,13681802511

 
 
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