二代測序(NGS)又稱為大規(guī)模平行測序,能夠同時(shí)對上百萬甚至數(shù)十億個(gè)DNA分子進(jìn)行測序,實(shí)現(xiàn)了大規(guī)模、高通量測序的目標(biāo)。在2019中國科學(xué)儀器發(fā)展年會(ACCSI2019)上,青島大學(xué)附屬醫(yī)院分子病理診斷科的邢曉明主任接受了91儀器信息網(wǎng)的采訪,就二代測序技術(shù)的臨床應(yīng)用、分子病理診斷科室基于二代技術(shù)開展的診斷項(xiàng)目、二代測序技術(shù)對傳統(tǒng)醫(yī)療帶來的變化等問題進(jìn)行了解答。
二代測序技術(shù)的主要臨床應(yīng)用
邢主任講到,二代測序的優(yōu)勢在于高通量、快速準(zhǔn)確?;谶@兩個(gè)特點(diǎn),其臨床應(yīng)用主要包括兩方面:(1)精準(zhǔn)診斷——單基因疾病檢測,如耳聾基因、色盲基因等;兒童代謝疾病,如苯丙酮尿癥,兒童先天性甲狀腺功能低下等;而目前應(yīng)用最廣泛的是腫瘤的精準(zhǔn)診斷方面,包括腫瘤靶向藥物的選擇,腫瘤愈后復(fù)發(fā)相關(guān)基因檢測等。(2)藥物基因組學(xué)的鑒定,比如化療藥物敏感性鑒定。
在分子病理診斷科室,二代測序技術(shù)在腫瘤的診斷應(yīng)用最廣泛,比如跟NCCN(美國國立綜合癌癥網(wǎng)絡(luò))指南密切相關(guān)的靶點(diǎn)(肺癌、淋巴瘤、結(jié)直腸癌等腫瘤的致病基因)檢測。而檢測的標(biāo)本種類很多,如組織標(biāo)本,血液等都可作為二代測序樣本。
從“千人一律”到“因人而異”
在被問到“二代測序技術(shù)為傳統(tǒng)醫(yī)療帶來哪些變化”時(shí),邢主任認(rèn)為這是一個(gè)非常好的問題。她回答道,“我們都是從傳統(tǒng)過來的,從病理的角度講,最傳統(tǒng)的是組織病理學(xué),之前一直堅(jiān)守組織病理學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)是精標(biāo)準(zhǔn)。但隨著精準(zhǔn)醫(yī)療的發(fā)展,現(xiàn)在步入“形態(tài)學(xué)+分子”共同發(fā)展的時(shí)代——既要依賴組織,也要依賴分子。二代測序?qū)τ诰珳?zhǔn)治療具有推動作用,傳統(tǒng)治療是粗放式的,千人一律,而精準(zhǔn)醫(yī)療則是根據(jù)不同人的基因狀態(tài)及個(gè)體狀態(tài)選擇不同的治療方法,這就是二代測序技術(shù)對于傳統(tǒng)醫(yī)療帶來的最大的變化?!?/p>
“認(rèn)證”是儀器進(jìn)入醫(yī)院的首要因素
邢主任還對醫(yī)院選擇基因測序儀的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行了解答。她表示,選擇基因測序儀時(shí),首先考慮儀器有沒有認(rèn)證,“認(rèn)證”是儀器進(jìn)入醫(yī)院最主要的因素;其次,要看檢測項(xiàng)目是否符合國家政策要求;最后還要綜合考量儀器的準(zhǔn)確性、靈敏性、兼容性等本身的特點(diǎn)。