1.使用顯微鏡時，首先應注意顯微鏡的接電規(guī)格（１１０Ｖ或２２０Ｖ）并插接正確的插座。
 
２.由保存箱中取出顯微鏡或移開防塵套，取出時應以右手持鏡臂，左手
  托住鏡座。取出后應檢查顯微鏡是否髒污，如有髒污應以拭鏡紙沾些
  許９５％酒精除去接物鏡上的塵埃或污染物。
 
３.打開并調整適當光源，避免燈源過高度太強，使微生物檢體乾凅死。
 

４.以塑膠吸管取出待觀察之微生物置于載玻片上，再用蓋玻片以４５度
  角蓋下，避免產生氣泡。
 
５.將已制作完成的檢體標本置于顯微鏡載物臺上，以玻片夾固定兩端；
  操作者的左眼對準接目鏡觀察，調整光源與光圈使顯微鏡視野亮度均
  勻，通常先以低倍接物鏡開始檢測為生物
 
6. 眼鏡就接目鏡位置，轉動粗調節(jié)輪使低倍物鏡下降幾乎與檢體玻片相
  接，待物象出現(xiàn)后，再轉動細調節(jié)輪反覆微調，直到影像清晰為止。
 
7. 鏡檢時兩眼同視，尋找適當目標，將目標調到視野中央觀察。
 
8. 更換高倍物鏡觀察，并利用細調節(jié)輪對準焦距，重新調整光圈至適當
  亮度，再轉動細調節(jié)輪反覆微調，直到物象清晰為止。
 
9. 觀察時兩眼同時張開以左眼觀察，右眼描繪結果。由于高倍率物鏡焦
  距很淺，因此必須一方面轉動細調節(jié)輪，一面描繪結果。描繪時不可
  有操作者的主觀意識，且所觀察之實驗結果應全數(shù)繪入，不可選擇性
  填入。