賽默飛世爾科技(以下簡稱賽默飛)近日最新發(fā)布了兩篇數據非依賴采集 (DIA) 應用報告,展示了超高場Orbitrap和翻譯后修飾的DIA 分析性能。Orbitrap的強大性能使當前最熱門的質譜采集技術之一DIA如虎添翼,引領定量蛋白質組學新發(fā)展。
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應用一:超高分辨質譜一小時 DIA 定量 4000 個 Hela 蛋白
本實驗使用Thermo ScientificTM Q Exactiv HF 超高分質譜儀測試了超高場Orbitrap在DIA分析方面的性能。實驗使用1小時梯度,分析僅500ng上樣量的Hela細胞總蛋白裂解液,重復三針。結果顯示,三針DIA分別定量到27558、27604、27483種肽段和4067、4080、4073種蛋白。譜圖庫中95%的蛋白都獲得了可靠的DIA解析(Q<0.01),靈敏度極高;峰面積cv值<20%的肽段占90.3%,重現(xiàn)性極佳。< p="">
應用方法下載:
www.thermoscientific.cn/content/dam/tfs/Country%20Specific%20Assets/zh-ch/CMD/MS/LCMS/documents/DIA%20quantification%20of%204000%20proteins%20in%20Hela%20lysis.pdf
應用二:精確修飾位點譜圖庫的建立與磷酸化蛋白質組的 DIA 解析
PTM位點鑒定錯誤的概率較高,將位點錯誤的鑒定結果作為譜圖庫,會導致DIA解析結果的不可靠。實驗使用Thermo ScientificTM Orbitrap Fusion三合一質譜儀,基于ptmRS/phosphoRS建立可靠的翻譯后修飾DIA流程,突破了PTM DIA解析的瓶頸。使用phosphoRS/ptmRS篩選PTM定位準確的譜圖,作為譜圖庫用于DIA,結果顯示,具有精確PTM定位的譜圖庫中98.4%的磷酸化肽都獲得了可靠的DIA解析(Q<0.01),峰面積CV值<20%的肽段占86.9%,實現(xiàn)了準確可靠的大規(guī)模PTM DIA定量。
應用方法下載:
www.thermoscientific.cn/content/dam/tfs/Country%20Specific%20Assets/zh-ch/CMD/MS/LCMS/documents/PTM%20site%20localization%20for%20phospho-proteome%20DIA.pdf
更多產品信息,請查看:
Q Exactiv HF 超高分質譜儀測試了超高場Orbitrap
www.thermoscientific.cn/product/q-exactive-hf-hybrid-quadrupole-orbitrap.html
Orbitrap Fusion三合一質譜儀
www.thermoscientific.cn/product/orbitrap-fusion-tribrid-mass-spectrometer.html
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