第二屆電鏡網(wǎng)絡(luò)會議(iCEM 2016)特邀報告

生物冷凍電鏡大數(shù)據(jù)中的高效處理方法

張法 副研究員

中國科學院計算技術(shù)研究所

報告摘要：

　　近年來，隨著成像設(shè)備和處理方法的飛速發(fā)展，冷凍電鏡三維重構(gòu)技術(shù)已成為確定生物大分子三維結(jié)構(gòu)的第一選擇，生物學家利用冷凍電鏡解析了大量生物大分子的高分辨率三維結(jié)構(gòu)。我國已具有全世界最先進和最大規(guī)模的冷凍電鏡硬件實施，這些設(shè)施每天都在產(chǎn)生海量的生物大數(shù)據(jù)。如何對冷凍電鏡大數(shù)據(jù)進行高效處理已成為計算科學所面臨的關(guān)鍵科學問題。本報告將從科學計算的角度討論冷凍電鏡數(shù)據(jù)處理中的科學問題，并介紹本領(lǐng)域最近的研究成果。

報告人簡介：

　　張法，博士，中國科學院計算技術(shù)研究所副研究員，博士生導(dǎo)師。CCF生物信息學專業(yè)組委員，秘書長。中國生物物理學會冷凍電鏡顯微學分會理事。2002-2005年，作為國際交換學生在美國俄亥俄州立大學(Ohio State University)客座訪問，2009-2010年，在西班牙胡安卡洛斯國王大學(Universidad Rey Juan Carlos)進行客座訪問。

　　長期從事生物信息學和高性能計算方面的研究，目前主要從事生物大分子冷凍電鏡三維重構(gòu)方面的研究。作為項目負責人和主要參與人主持和參與了多項國家自然科學基金重點項目、國際合作重大項目、中科院知識創(chuàng)新重大項目、中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)項目(B類)等多項國家項目，作為第一作者或通信作者在國內(nèi)外著名期刊和國際會議上發(fā)表論文60余篇。開發(fā)完成了國內(nèi)首款冷凍電鏡三維重構(gòu)系統(tǒng)AuTOM，其中電子斷層數(shù)據(jù)對位軟件Markerauto 和三維重構(gòu)軟件ICON已成為本領(lǐng)域知名軟件，幫助生物學家取得了重要的生物學發(fā)現(xiàn)。

報告時間：2016年10月26日下午

報名鏈接：