2018年12月1-4日第60屆美國血液學(xué)年會(ASH)暨博覽會在美國加州圣迭戈舉行。每年的美國血液學(xué)年會是全世界血液學(xué)研究者的盛會。年會上公布和發(fā)表世界各國的最新血液學(xué)的研究進(jìn)展。本次會議中的一些研究強(qiáng)調(diào)了微滴式數(shù)字PCR(ddPCR)靈敏度高和準(zhǔn)確性高的特點(diǎn),對微小殘留病(MRD)的量化是一個(gè)強(qiáng)有力的工具,以下摘選了幾個(gè)報(bào)告的重點(diǎn)內(nèi)容:
01
ddPCR應(yīng)用于治療TP53突變的MDS和AML的1b期臨床試驗(yàn)
佛羅里達(dá)州Moffitt腫瘤研究中心的血液腫瘤學(xué)家David Sallman博士介紹了一項(xiàng)臨床試驗(yàn)的結(jié)果。Sallman博士及其團(tuán)隊(duì)研究了阿扎胞苷(一種化療藥物)與小分子藥物APR-246的聯(lián)合用于治療具有TP53突變的骨髓增生異常綜合征(MDS)和急性髓性白血病(AML)的患者。前期數(shù)據(jù)已經(jīng)表明,單獨(dú)使用阿扎胞苷可使20-30%的TP53突變的MDS和AML患者完全緩解。當(dāng)加入小分子藥物APR-246后,這些患者的完全緩解率達(dá)到了82%,這比單獨(dú)使用阿扎胞苷具有更顯著的療效。研究人員使用NGS與ddPCR的方法量化MRD來分析緩解深度。Sallman博士說到“在我們的試驗(yàn)中,我們發(fā)現(xiàn)ddPCR在定量患者特異性緩解深度方面具有顯著的效果”。
Sallman博士指出,該臨床試驗(yàn)的第2階段將繼續(xù)使用ddPCR作為確定緩解深度的方法之一,也將會用于阿扎胞苷與APR-246聯(lián)合治療患者的預(yù)后評估。
02
ddPCR有助于預(yù)測AML患者的緩解
同種異體造血干細(xì)胞移植(HSCT)是AML等血液系統(tǒng)惡性腫瘤的治愈方法之一。但是在移植后,許多患者會出現(xiàn)復(fù)發(fā)??屏_拉多大學(xué)和科羅拉多兒童醫(yī)學(xué)的Amanda Winters博士和她團(tuán)隊(duì)利用ddPCR檢測MRD以預(yù)測哪些患者可能在HSCT后會產(chǎn)生復(fù)發(fā)。雖然先前的實(shí)驗(yàn)已經(jīng)證實(shí)MRD對化療后的患者復(fù)發(fā)具有高度預(yù)測性,但很少有研究評估MRD在患者HSCT后復(fù)發(fā)的預(yù)測能力。
該團(tuán)隊(duì)使用ddPCR跟蹤檢測36名患者的21種AML相關(guān)突變,36名患者均接受了骨髓移植并同意組織樣本庫協(xié)議,在診斷時(shí)至少被檢出具有21個(gè)突變中的一個(gè)。研究發(fā)現(xiàn),基于ddPCR的MRD評估可預(yù)測AML患者HSCT后的復(fù)發(fā)和存活。移植后1個(gè)月時(shí),MRD的存在與復(fù)發(fā)率和死亡率顯著相關(guān)。基于這些發(fā)現(xiàn),Winters博士和她的團(tuán)隊(duì)認(rèn)為骨髓移植后利用ddPCR檢測AML的相關(guān)突變可以幫助醫(yī)生更早地發(fā)現(xiàn)疾病的復(fù)發(fā)。
03
ddPCR定量MLL融合轉(zhuǎn)錄本監(jiān)測MLL-r AML的MRD
目前實(shí)時(shí)定量PCR(RQ-PCR)是MLL重排(MLL-r)白血病患者M(jìn)RD監(jiān)測的標(biāo)準(zhǔn)方法。然而,當(dāng)只存在少量白血病細(xì)胞時(shí),這種方法就顯得不夠精確了。來自澳大利亞昆士蘭大學(xué)的Sadia Afrin博士及其團(tuán)隊(duì)評估了使用ddPCR定量MLL融合轉(zhuǎn)錄水平是否可以提高M(jìn)LL-r白血病患者M(jìn)RD檢測的靈敏度。
首先對44名MLL-r AML與ALL患者進(jìn)行測序,確定每個(gè)患者特異性的融合序列,然后設(shè)計(jì)對應(yīng)的融合檢測探針用ddPCR進(jìn)行MRD的評估,樣本同時(shí)采用RQ-PCR的方法進(jìn)行平行檢測。將ddPCR與RQ-PCR檢測的結(jié)果進(jìn)行比較,遵循EuroMRD的指南。
結(jié)果顯示ddPCR法表現(xiàn)出更高的檢測靈敏度與可靠性,其中4個(gè)低于EuroMRD指南RQ-PCR檢出陰性的樣本均可用ddPCR檢出,顯示出ddPCR比標(biāo)準(zhǔn)的RQ-PCR法可提供更穩(wěn)定且更高靈敏度的MRD分析結(jié)果。
Afrin博士認(rèn)為ddPCR是一種很有前景的技術(shù),可以準(zhǔn)確、靈敏地定量MLL融合轉(zhuǎn)錄本,監(jiān)測MLL-r白血病的MRD。ddPCR的高靈敏度和高穩(wěn)定性可以改善基于反應(yīng)的治療分層以及預(yù)測復(fù)發(fā)。