Benzonase核酸酶Benzonase核酸酶,是一種核酸內(nèi)切酶,可將核酸降解成2~5個堿基的5‘單磷酸核苷酸,因其能高效降解任何形式(雙鏈,單鏈,線狀,環(huán)狀)的DNA和RNA而沒有蛋白裂解活性,又被稱為“全能核酸酶”。Benzonase核酸酶能有效降低蛋白樣品粘度,去除蛋白樣品中核酸的污染,且無蛋白酶活性殘留,核酸酶活性達1×106 U/mg蛋白。Benzonase核酸酶在降低粘性的同時, 也具有多種其他用途,如:減少了樣品處理時間,增加了蛋白產(chǎn)量,離心時時沉淀和上清分離的更徹底,更便于溶液的離心(尤其是超濾);提高色譜純化的效率等。
本公司Benzonase核酸酶包括四種,分別為不含任何標簽的Benzonase核酸酶(科研級別)、無內(nèi)毒素Benzonase核酸酶、Strep tagII Benzonase核酸酶(科研級別)和無內(nèi)毒素的Strep tagII Benzonase核酸酶,可適應(yīng)不同下游用途的需求。其中Strep tagII Benzonase核酸酶可在消化完核酸后通過Strep Tactin XT Resin高效去除,而無內(nèi)毒素的兩種Benzonase核酸酶,內(nèi)毒素含量 40EU/mL(按照單位換算量計算為,每1000U中含有的內(nèi)毒素 0.15EU),可適用于藥用級別的研發(fā)和生產(chǎn)。另外,核酸酶殘留可通過我公司開發(fā)的基于 熒光探針的Benzonase核酸酶殘留檢測試劑盒進行評測,15min即可完成檢測,低可檢測到2ng/ml的核酸酶殘留。
用量推薦實驗類型電泳蛋白樣品制備非藥物蛋白生產(chǎn)藥物蛋白生產(chǎn)疫苗、病毒生產(chǎn)細胞藥物推薦產(chǎn)品Benzonase(科研級)Benzonase(科研級)Strep-tagII Benzonase(科研級)Benzonase(無內(nèi)毒素級)Strep-tagII Benzonase(無內(nèi)毒素級)細胞數(shù)量1X106個細胞(10mg組織)1g濕重 (重懸液10mL)1L 發(fā)酵上清液1L 培養(yǎng)物低用量125U (0.5 μL)25U/mL(1 μL)25U/mL(1 μL)0.1U/mL(0.4 μL)0.1U/mL(0.4 μL)推薦用量500U (2 μL)250U/mL(10 μL)250U/mL(10 μL)25U/mL(100 μL)5U/mL(20 μL)作用時間通常作用時間37℃在15~60min;25℃在30~120min;單位定義37℃,pH 8.0反應(yīng)條件下,在30分鐘內(nèi)使△A260 值降低1.0(相當于完全消化37 μg DNA )的酶量定義為一個活性單位。
注意:含大量蛋白、細胞壁、其它鹽分的粗制品,對該酶活性有部分抑制作用,使用時需要增加酶的用量。應(yīng)用
蛋白提取時去除核酸污染:在重組蛋白純化或組織細胞樣品蛋白提取時,Benzonase核酸酶可有效降低樣品粘度,利于下游操作
與細胞或細菌裂解液配合使用,去除粗提物中的核酸,降低溶液粘性,提高蛋白質(zhì)產(chǎn)量
減少存放的外周血單細胞(PBMC)的結(jié)塊現(xiàn)象
降解核酸,利于不可溶性蛋白復(fù)性前高質(zhì)量包涵體制備
有效去除帶負電荷的核酸對雙向SDS-PAGE蛋白樣品的影響,改善蛋白質(zhì)的分離效果,增強2-DE分辨率
疫苗和病毒樣品制備中DNA污染的去除儲存置于-20°C,可保存2年。實例分析Fig1. 分別取不同量(0、0.125、0.25、0.5、1、5、10U)的Benzonase核酸酶消化人基因組DNA10min,進行瓊脂糖電泳。Fig2. A為未加Benzonase處理的,B為加Benzonase處理的
樣品進行二維電泳。如圖所示,Benzonase處理的樣品可顯
著增加二維電泳的分辨率。 Fig3.經(jīng)RIPA裂解未經(jīng)Benzonase核酸酶處理的樣品,
大量基因組DNA釋放出來,呈鼻涕狀。Fig4.離心后,左管為未加Bezonase核酸酶,有鼻涕狀
粘稠物質(zhì)懸浮在管中,右管為加Bezonase核酸酶,上
清為透明液體。超強兼容性全能核酸酶在非常廣泛的條件下,都能保持很高的穩(wěn)定性和消化核酸的活性,這使其能夠與多種細胞裂解液,如RIPA,或含有多種離子和非離子型去污劑、還原劑的蛋白提取試劑等兼容。例如: 100mM的鹽酸胍會完全抑制Benzonase活性,1mM的EDTA會部分抑制Benzonase活性,5mM的EDTA會使活性喪失90%,1mM的PMSF則不會抑制核酸酶活性。 濃度 0.4%的Triton X-100對核酸酶活性幾乎無影響, 0.4%的脫氧膽酸鈉使核酸酶可保持70%的活性,超過該臨界值之后核酸酶活性會急劇降低,1%的濃度會使活性喪失70%;0.05%的SDS對核酸酶活性幾乎無影響,而SDS濃度在0.1%-1%之間時,核酸酶在變性后活性會急劇降低,可通過增加核酸酶的量使活性得到補償。另外,核酸酶可耐受6M尿素,當尿素達到7M時,核酸酶在變性后活性會急劇降低,亦可通過增加核酸酶的量使活性得到補償。條件參數(shù)最適條件可作用條件范圍Mg2+1-2mM1-10mMpH8.0–9.26–10溫度37°C0–42°CDTT0–100mM 100mMβ-Mercaptoethanol0–100mM 100mM一價陽離子濃度(如Na+,K+)0–20mM0–150mMPO43-0–10 mM0–100mMBenzonase的去除對于Strep-tag II標簽的Benzonase核酸酶(C2003,C2004)可通過Strep Tactin XT Resin(聯(lián)邁生物,C0402)直接 去除,去除率 95%;對于不帶標簽的Benzonase核酸酶(C2001,C2002),可通過色譜純化去除核酸酶,然后可通過檢測殘留活性(聯(lián)邁生物, C2005)或ELISA檢測來判斷去除是否成功。常見的色譜純化方式有陽離子交換介質(zhì)和陰離子交換介質(zhì),具體的Benzonase去除條件如下表:陰離子交換介質(zhì)pH樣品和平衡緩沖液Benzonase核酸酶TMAE7.050mM Tris/200mM NaClnot boundTMAE7.050mM Tris/50mM NaClnot boundTMAE8.050mM Tris/250mM NaClnot boundTMAE8.0 50mM Tris/100mM NaClnot boundTMAE9.0 50mM Tris/200mM NaClnot boundTMAE9.050mM Tris/100mM NaClnot boundDEAE7.050mM Tris/200mM NaClnot boundDEAE7.050mM Tris/50mM NaClnot boundDEAE8.050mM Tris/250mM NaClnot boundDEAE8.0 50mM Tris/100mM NaClnot boundDEAE9.0 50mM Tris/250mM NaClnot boundDEAE9.050mM Tris/50mM NaClnot boundDMAE8.0 50mM Tris/250mM NaClnot boundDMAE8.050mM Tris/50mM NaClnot bound陽離子交換介質(zhì)pH樣品和平衡緩沖液Benzonase核酸酶SO3-6.020mM phosphate/100mM NaClboundSO3-6.020mM phosphate/200mM NaClnot boundSO3-5.020mM acetate/200mM NaClboundSO3-5.0 20mM acetate/700mM NaClnot boundSO3-4.0 20mM acetate/300mM NaClboundSO3-4.020mM acetate/800mM NaClnot boundC00-6.020mM phosphate/0mM NaClnot boundC00-5.020mM acetate/40mM NaClboundC00-5.020mM acetate/100mM NaClnot boundC00-4.0 20mM acetate/150mM NaClpartially boundC00-4.020mM acetate/400mM NaClnot bound