DNA即脫氧核糖核酸,又稱去氧核糖核苷酸,是染色體主要組成成分,同時(shí)也是主要遺傳物質(zhì)。有時(shí)被稱為“遺傳微?!保?yàn)樵诜敝尺^(guò)程中,父代把它們自己DNA的一部分復(fù)制傳遞到子代中,從而完成性狀的傳播。DNA分子結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
一、DNA分子的結(jié)構(gòu)
1、DNA的結(jié)構(gòu)單位:脫氧核苷酸(4種)
2、DNA的空間結(jié)構(gòu):規(guī)則的雙螺旋結(jié)構(gòu)
①DNA分子雙鏈反向平行:一條走向是5′→3′,另一條走向是3′→5′,有規(guī)則地盤繞成雙螺旋結(jié)構(gòu)。
②外側(cè)磷酸與脫氧核糖交替排列,構(gòu)成基本骨架,堿基排列在內(nèi)側(cè)。
③堿基互補(bǔ)配對(duì)原則:腺嘌呤(A)通過(guò)兩個(gè)氫鍵與胸腺嘧啶(T)配對(duì),鳥(niǎo)嘌呤(G)通過(guò)三個(gè)氫鍵與胞嘧啶(C)配對(duì)。
歸納總結(jié):
五種元素:C、H、O、N、P;
四種堿基:A、G、C、T,相應(yīng)的有四種脫氧核苷酸;
三種物質(zhì):磷酸、脫氧核糖、含氮堿基;
兩條長(zhǎng)鏈:兩條反向平行的脫氧核苷酸鏈;
一條螺旋:規(guī)則的雙螺旋結(jié)構(gòu)。
3、雙鏈DNA分子中堿基數(shù)量關(guān)系
①堿基互補(bǔ)配對(duì)原則的應(yīng)用:在雙鏈DNA分子中,四種堿基的比例和為1。
②A+T+C+G=1;A=T,C=G,A+G=C+T=A+C=G+T=總堿基數(shù)的1/2。
③互補(bǔ)堿基之和的比例(A+T):(C+G)在已知鏈、互補(bǔ)鏈和整個(gè)DNA分子中相等;非互補(bǔ)堿基和的比值如(A+C):(T+C)在已知鏈與互補(bǔ)鏈間互為倒數(shù),在整個(gè)DNA分子中該比值為1。
④在一個(gè)雙鏈DNA分子中,某堿基占?jí)A基總量的百分?jǐn)?shù)等于每條鏈中的平均值。
⑤DNA分子中,A與T之間有兩個(gè)氫鍵,C與G之間有三個(gè)氫鍵,因此C-G對(duì)相對(duì)含量多的DNA分子熱穩(wěn)定性高。
二、DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型
1、制作原理:DNA的脫氧核苷酸雙鏈反向平行,磷酸與脫氧核糖交替連接排列在外側(cè)。堿基排列在內(nèi)側(cè),堿基對(duì)通過(guò)氫鍵連接,堿基互補(bǔ)配對(duì)。
2、設(shè)計(jì)模型:繪出DNA模型的設(shè)計(jì)圖,確定制作的DNA分子雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的大小(如高度與直徑的比例)、維系立體結(jié)構(gòu)的方法,選擇代表磷酸、脫氧核糖、堿基的材料等。
3、制作模型
①使用各種材料分別“制作”若干個(gè)磷酸、脫氧核糖、堿基;將各種配件整合在一起,并連接成脫氧核苷酸鏈;連接兩條脫氧核苷酸鏈,拼成DNA分子平面結(jié)構(gòu)圖;再“旋轉(zhuǎn)”成雙螺旋結(jié)構(gòu)。
②根據(jù)設(shè)計(jì)計(jì)劃,對(duì)制作的DNA分子雙螺結(jié)構(gòu)模型進(jìn)行檢查,對(duì)模型的不足加以修正。
4、需要注意的問(wèn)題
①熟悉制作模型用的各種零件代表的物質(zhì),寫(xiě)出4種堿基的字母名稱。
②兩條鏈的長(zhǎng)度、堿基總數(shù)一致,堿基互補(bǔ)、方向相反。
③磷酸、脫氧核糖、堿基三者之間的連接部位要正確。
④制作中各零件連接應(yīng)牢固,避免旋轉(zhuǎn)中脫落。
⑤各組模型制作以不同數(shù)量和順序的A-T、C-G、T-A、G-C四種堿基對(duì)排列,領(lǐng)悟DNA分子的多樣性。
三、堿基互補(bǔ)配對(duì)規(guī)律的有關(guān)計(jì)算問(wèn)題
堿基比率數(shù)量計(jì)算,是教材的難點(diǎn)之一,解決此類問(wèn)題可根據(jù)以下幾條規(guī)律:
1、DNA雙鏈中的兩條互補(bǔ)鏈的堿基相等,任意兩個(gè)不互補(bǔ)的堿基之和恒等,占?jí)A基總數(shù)的50%,即A+G=T+C=A+C=T+G=50%,(A+G)/(T+C)=(A+C)/(T+G)=(T+C)/(A+G)=1。
2、在DNA雙鏈中的一條單鏈的(A+G)/(T+C)的值與另一條互補(bǔ)鏈的(A+G)/(T+C)的值互為倒數(shù)關(guān)系。
3、DNA雙鏈中,一條單鏈的(A+T)/(G+C)值與另一條互補(bǔ)鏈的(A+T)/(G+C)值是相等的,也與整個(gè)DNA分子中的(A+T)/(G+C)的值相等。
4、在雙鏈DNA及其轉(zhuǎn)錄的RNA之間,有下列關(guān)系:
①在堿基數(shù)量上,在RNA和DNA的單鏈內(nèi),互補(bǔ)堿基的和相等,且等于雙鏈DNA的一半。即a鏈上的(A+T)=b鏈上的(A+T)=RNA分子中(A+U)=1/2DNA雙鏈中的(A+T),a鏈上的(G+C)=b鏈上的(G+C)=RNA分子中的(G+C)=1/2DNA雙鏈中的(G+C)。
②互補(bǔ)堿基的和占各自堿基總數(shù)的比例在DNA分子的每一條單鏈和DNA分子雙鏈中是相等的,且等于RNA中與之配對(duì)堿基的和所占RNA中堿基總數(shù)的比例,即a鏈中(A+T)占a鏈總數(shù)的百分比=b鏈中(A+T)占b鏈總數(shù)的百分比=RNA中(A+U)占RNA總數(shù)的百分比=DNA雙鏈中(A+T)占雙鏈中堿基總數(shù)的百分比,簡(jiǎn)式為(C+G)a=(G+C)b=(G+C)RNA=(G+C)DNA。
如mRNA中,A占15%,U占17%,則在DNA分子的每一條單鏈中及在整個(gè)DNA分子中(A+T)都占?jí)A基總數(shù)的32%;在mRNA中,在DNA分子的每一條單鏈中,及在DNA分子中(G+C)都占?jí)A基總數(shù)的68%。
四、DNA分子結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
1、穩(wěn)定性:規(guī)則的雙螺旋結(jié)構(gòu)使其結(jié)構(gòu)相對(duì)穩(wěn)定,一般不易改變。
2、多樣性:雖然構(gòu)成DNA的堿基只有四種,但由于構(gòu)成每個(gè)DNA分子的堿基對(duì)數(shù)、堿基種類及排列順序多樣,可形成多種多樣的DNA分子。
3、特異性:對(duì)一個(gè)具體的DNA分子而言,其堿基對(duì)特定的排列順序可使其攜帶特定的遺傳信息,決定該DNA分子的特異性。DNA分子結(jié)構(gòu)研究進(jìn)展
1、DNA雙螺旋的精細(xì)結(jié)構(gòu)
Watson-Crick的雙螺旋模型設(shè)想的DNA分子為有規(guī)則的大溝與小溝交替排列的右手螺旋,隨著分析技術(shù)的提高,人們研究了單晶DNA分子,其x-射線衍射圖譜顯示DNA雙螺旋并非想象的均勻排列,而是有一定起伏波動(dòng),也就是說(shuō)雙螺旋的一系列參數(shù)如螺旋扭角、堿基轉(zhuǎn)角、主鏈扭角等隨堿基序列的不同在一定范圍內(nèi)起伏變化,這種變化即為雙螺旋的精細(xì)結(jié)構(gòu)。
Calladine認(rèn)為螺旋的起伏主要因?yàn)殡p環(huán)的嘌呤堿基尺寸較大,堿基配對(duì)時(shí)會(huì)伸向嘧啶一側(cè),同樣對(duì)側(cè)的嘌呤也會(huì)伸向這一側(cè),兩個(gè)嘌呤環(huán)就會(huì)發(fā)生“沖突”,為緩解這一“沖突”,整個(gè)螺旋結(jié)構(gòu)將通過(guò)減少該部位的螺旋扭角或者加大沖突一側(cè)的堿基轉(zhuǎn)角等作以調(diào)整。Dickerson還根據(jù)堿基序列推導(dǎo)出求和規(guī)則,計(jì)算出的螺旋參數(shù)可近似預(yù)測(cè)螺旋的起伏變化。
Nussinov曾經(jīng)分析了60種原核生物DNA序列,發(fā)現(xiàn)大的構(gòu)象起伏剛好位于蛋白質(zhì)或酶特異性識(shí)別的某些DNA位點(diǎn)附近,轉(zhuǎn)錄過(guò)程中RNA聚合酶識(shí)別DNA的序列處雙螺旋起伏很大,推測(cè)DNA螺旋的局部起伏變化可能更有利于一些蛋白質(zhì)或酶的識(shí)別并與DNA結(jié)合,DNA局部精細(xì)結(jié)構(gòu)有可能貯存有DNA序列的某些信息,如果真是如此,對(duì)精細(xì)結(jié)構(gòu)的研究將更具深遠(yuǎn)意義。
2、三股螺旋結(jié)構(gòu)
三股螺旋結(jié)構(gòu)是由三條多核苷酸鏈形成的螺旋,它是在原來(lái)雙螺旋的基礎(chǔ)上,第三條鏈繞進(jìn)雙螺旋大溝中。三股螺旋形成的部位均有特殊的核苷酸序列。
研究發(fā)現(xiàn),DNA某些區(qū)段中兩條核苷酸鏈為同型嘌呤鏈(HPu鏈)或同型嘧啶鏈(HPy鏈),HPu鏈?zhǔn)侨坑舌堰屎塑账峤M成的DNA鏈,HPy鏈全部由嘧啶核苷酸組成,而且每條鏈均呈現(xiàn)映像重復(fù),稱之為H-回文序列。
一條鏈的回文結(jié)構(gòu)可與另一鏈回文結(jié)構(gòu)的5’或3’部分形成氫鍵,從而使該鏈繞進(jìn)雙螺旋內(nèi)形成三股螺旋結(jié)構(gòu),剩余的半條回文結(jié)構(gòu)以單鏈形式游離,這種三股螺旋和單鏈DNA的復(fù)合區(qū)域被稱為H-DNA。
近年來(lái)發(fā)現(xiàn)真核細(xì)胞染色質(zhì)中基因調(diào)控區(qū)和染色質(zhì)重組部位含有H-回文序列,實(shí)驗(yàn)證明細(xì)胞完整染色體中確實(shí)存在有H-DNA,這表明H-DNA與基因轉(zhuǎn)錄、染色體基因重組及DNA復(fù)制有關(guān),具體的機(jī)制還需作進(jìn)一步研究。
3、DNA結(jié)構(gòu)的多態(tài)性
Watson-Crick模型中的DNA分子為B構(gòu)象,這是Z常見(jiàn)的DNA構(gòu)象。研究表明DNA結(jié)構(gòu)并不是固定不變的,在脫水DNA以及DNA-RNA雜交分子中DNA為A構(gòu)象,實(shí)驗(yàn)室中甚至觀察到C、D和E構(gòu)象,這表明DNA分子呈現(xiàn)動(dòng)態(tài)變化。以上構(gòu)象都是右手螺旋,反向平行的核苷酸借氫鍵連在一起,鏈的重復(fù)單位是單核苷酸,螺旋中有一個(gè)大溝和一個(gè)小溝,只是溝的寬窄和深淺有所不同。
Rich等研究人工合成的CGCGCG單晶的x-射線衍射圖譜時(shí)發(fā)現(xiàn)這種六聚體構(gòu)象與以上均不相同,它為左手螺旋,主鏈中各磷酸根呈鋸齒狀排列,稱之為Z構(gòu)象(英文Zigzag的diyi個(gè)字母),這種構(gòu)象的重復(fù)單位是二核苷酸,只有一個(gè)狹而深的小螺旋溝。
Z-DNA的形成是嘌呤與嘧啶交替排列的結(jié)果,這種排列會(huì)造成核苷酸中糖苷鍵的順式和反式構(gòu)象的交替存在,順式時(shí)彼此接近,反式時(shí)離得很遠(yuǎn),從而使Z-DNA主鏈呈鋸齒狀,而B(niǎo)-DNA中糖苷鍵都是反式的。
實(shí)驗(yàn)證明細(xì)胞中有一些因素可使B-DNA轉(zhuǎn)變?yōu)閆-DNA,如胞嘧啶第五位碳原子的甲基化,周圍形成的疏水區(qū)使B-DNA不穩(wěn)定而轉(zhuǎn)變?yōu)閆-DNA,因此DNA中某些區(qū)段具有Z-DNA構(gòu)象是可能的。
Z-DNA中帶負(fù)電的磷酸根離得太近產(chǎn)生靜電排斥而不穩(wěn)定,但DNA局部的不穩(wěn)定區(qū)則可能成為潛在的解鏈位點(diǎn),SV40增強(qiáng)子區(qū)中有Z-DNA結(jié)構(gòu),鼠類微小病毒DNA復(fù)制區(qū)起始點(diǎn)附近有GC交替排列,因此Z-DNA的存在與DNA的多種功能如復(fù)制、轉(zhuǎn)錄以及基因調(diào)控都有密切聯(lián)系,是其功能表達(dá)的重要結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
DNA結(jié)構(gòu)的新發(fā)現(xiàn)豐富了DNA結(jié)構(gòu)學(xué)說(shuō)的內(nèi)容,也使人類在探索生命現(xiàn)象本質(zhì)的道路上前進(jìn)了一大步。
2018-07-18 22540