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CoolMPS測序數(shù)據(jù)披露 海外用戶高度認可華大智造DNBSEQ測序平臺

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2020-02-28  來源:儀器信息網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):913
核心提示:美國時間2月26日,在基因測序技術(shù)領(lǐng)域的全球盛會Advances in Genome Biology and Technology (AGBT)上,華大智造首席科學(xué)家Rade Drmanac博士聯(lián)合多位海外科學(xué)家共同分享了基于DNBSEQ測序平臺上的CoolMPS 測序數(shù)據(jù)。CoolMPS 是DNBSEQ平臺上首款基于抗體的大規(guī)模平行測序試劑,它利用天然堿基來進行更清晰的堿基識別,有效避免傳統(tǒng)測序方法中的DNA“疤痕”積聚對后續(xù)讀取準確性的影響,實現(xiàn)更準確和更長的測序。該方法使得在每個測序循環(huán)中,與抗體相

美國時間2月26日,在基因測序技術(shù)領(lǐng)域的全球盛會Advances in Genome Biology and Technology (AGBT)上,華大智造首席科學(xué)家Rade Drmanac博士聯(lián)合多位海外科學(xué)家共同分享了基于DNBSEQ測序平臺上的CoolMPS 測序數(shù)據(jù)。

1華大智造926c.jpg

CoolMPS 是DNBSEQ平臺上首款基于抗體的大規(guī)模平行測序試劑,它利用天然堿基來進行更清晰的堿基識別,有效避免傳統(tǒng)測序方法中的DNA“疤痕”積聚對后續(xù)讀取準確性的影響,實現(xiàn)更準確和更長的測序。該方法使得在每個測序循環(huán)中,與抗體相連的多個熒光染料分子能提供更高的信噪比;同時結(jié)合天然堿基,每個測序循環(huán)之間沒有干擾,錯誤率低。

2 CoolMPS高通量測序試劑套裝.jpg

CoolMPS高通量測序試劑套裝

華大智造首席科學(xué)家Rade Drmanac博士表示凝聚獨特的DNB文庫技術(shù)、低深度高精度的PCR-free技術(shù)、Patterned Array規(guī)則陣列技術(shù),以及本次推出的基于抗體技術(shù)的CoolMPS 方法,有望重新定義大規(guī)模平行測序(MPS, Massively Parallel Sequencing),盡快實現(xiàn)百萬基因組測序,邁入人人基因組時代。

3 華大智造首席科學(xué)家Rade Drmanac博士在AGBT上發(fā)表演講b.jpg

華大智造首席科學(xué)家Rade Drmanac博士在AGBT上發(fā)表演講

華大智造DNBSEQ測序平臺獲海外用戶高度認可

英國癌癥研究所腫瘤分析團隊(the Tumour Profiling Unit at the Institute of Cancer Research in the UK)的Nik Matthews博士,基于華大智造DNBSEQ-G400測序平臺,分別利用StandardMPS和CoolMPS測序反應(yīng)通用試劑套裝,進行了WGS全基因組分析。

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Q30提升

“這完全讓我感到震驚?!盢ik說,“當我第一次看到數(shù)據(jù)結(jié)果時,我才發(fā)現(xiàn),原來僅將測序試劑的化學(xué)方法更換為CoolMPS版本,就可以進一步提高Q30、降低錯誤率,也就是說,通過‘幾乎不做任何事情’,就獲得了更多的數(shù)據(jù),這太酷了?!?/p>

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錯誤率進一步降低

加拿大卑詩省癌癥研究所(BC Cancer Agency)邁克爾史密斯基因組科學(xué)中心(Genome Sciences Centre,GSC)副主任、生物信息學(xué)負責人Steven Jones博士在他的實驗室利用DNBSEQ 平臺展開了一系列針對腫瘤樣本的研究工作,包括WGS,RNA和單細胞ATAC測序。

通過對比分析基于華大智造DNBSEQ-G400和Illumina HiSeq的下機數(shù)據(jù),Steven博士表示:數(shù)據(jù)表明腫瘤基因組分析結(jié)果在不同平臺間“基本一致”。特別是基于華大智造DNBSEQ-G400的PCR-free方法獲得的WGS數(shù)據(jù),在15X的測序深度就可以達到傳統(tǒng)的PCR WGS 30X的數(shù)據(jù)質(zhì)量,重復(fù)讀取的次數(shù)則更少、產(chǎn)生的有效數(shù)據(jù)更多,更具成本效益。

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7 錯誤率進一步降低0084.jpg

蒙特利爾麥吉爾大學(xué)(McGill University)的基因組學(xué)負責人Jiannis Ragoussis教授在AGBT發(fā)表了關(guān)于在DNBSEQ-G400上評估單細胞RNA測序性能表現(xiàn)的主題演講,并將該數(shù)據(jù)與Illumina NovaSeq 6000進行了比較。 

結(jié)果表明,MGI DNBSEQ-G400和Illumina NovaSeq 6000這兩個平臺之間的性能可比,數(shù)據(jù)相似,而MGI DNBSEQ-400實際上更加靈活且實用?!盎贛GI平臺,我們以可控的測序成本,獲得了更多的reads數(shù)。我們不再囿于昂貴的試劑耗材而不得不混合多個文庫?!?/p>

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高性能產(chǎn)品   滿足用戶更高要求

PCR-Free是華大智造在2019年推出的一款文庫制備技術(shù),在測序全流程無PCR擴增,使用1 g 基因組DNA僅需3.5個小時就能獲得高準確度的全基因組文庫。相比于傳統(tǒng)個人全基因組測序(WGS),利用MGIEasy PCR-Free DNA文庫制備試劑套裝獲得的變異檢測性能,尤其是InDel檢測靈敏度和準確性等方面已達到業(yè)界領(lǐng)先水平,無PCR擴增錯誤累積,基因組覆蓋均一性好,變異檢測性能優(yōu)。

 
 
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