使用傳統(tǒng)的菌落計(jì)數(shù)器時(shí)，是在主機(jī)上連接計(jì)數(shù)筆，將電源開(kāi)關(guān)打開(kāi)，在白光板上放入培養(yǎng)皿，將白光燈打開(kāi)，使用計(jì)數(shù)筆觸動(dòng)計(jì)數(shù)，所計(jì)數(shù)量通過(guò)LED顯示屏顯示。當(dāng)計(jì)數(shù)完成時(shí)，總數(shù)可由計(jì)數(shù)筆暫記在稿紙上，將電源重新開(kāi)關(guān)，LED顯示屏自動(dòng)歸零，對(duì)比稿紙上總數(shù)和第二次計(jì)數(shù)總數(shù)，若數(shù)量相同，則表示結(jié)果較準(zhǔn)確。與此同時(shí)，根據(jù)細(xì)菌計(jì)數(shù)檢驗(yàn)規(guī)程規(guī)定，當(dāng)有數(shù)量大于300個(gè)細(xì)菌生長(zhǎng)在一只培養(yǎng)皿中時(shí)，應(yīng)當(dāng)稀釋檢驗(yàn)樣品重作，從而使計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性得以保證，因此，通常的菌落計(jì)數(shù)器儀器顯示計(jì)為三位數(shù)。

傳統(tǒng)的菌落計(jì)數(shù)方法是一種全人工操作的方法，不僅費(fèi)時(shí)費(fèi)力，而且很容易出現(xiàn)錯(cuò)誤。

如今，伴隨科技的進(jìn)步，菌落計(jì)數(shù)技術(shù)也變得更加的完善。越來(lái)越全的功能以及越來(lái)越高的配置是菌落計(jì)數(shù)技術(shù)日趨完善的主要體現(xiàn)。不僅具有越來(lái)越快速的計(jì)數(shù)速度，而且具有越來(lái)越精確的準(zhǔn)確性。具體在以下幾個(gè)方面體現(xiàn)。

一、數(shù)據(jù)庫(kù)的處理功能

和傳統(tǒng)的菌落計(jì)數(shù)器相比，智能查詢(xún)，數(shù)據(jù)存儲(chǔ)，數(shù)據(jù)導(dǎo)出等功能被增加了，有些全自動(dòng)菌落計(jì)數(shù)器還具有對(duì)操作者使用權(quán)限進(jìn)行設(shè)置，對(duì)權(quán)限設(shè)置數(shù)據(jù)進(jìn)行修改等功能，能夠更加安全的獲取量的數(shù)據(jù)，同時(shí)，還能夠在線編輯，報(bào)表打印。

二、測(cè)量功能和抑菌圈自動(dòng)測(cè)量功能

原來(lái)的菌落計(jì)數(shù)器沒(méi)有測(cè)量功能和抑菌圈自動(dòng)測(cè)量功能。藥敏分析功能甚至出現(xiàn)在一些更加先進(jìn)的儀器上。然而，大多在微生物實(shí)驗(yàn)室等數(shù)據(jù)要求較高的領(lǐng)域使用這種菌落計(jì)數(shù)器，其價(jià)格非常昂貴，市場(chǎng)價(jià)格大多在8，9萬(wàn)左右。

三、圖像拍攝功能

在成像方面，傳統(tǒng)的手動(dòng)菌落計(jì)數(shù)器使用的是放大鏡，通常能夠放大1.7倍到3倍。如今圖片拍攝功能已經(jīng)被應(yīng)用在了菌落計(jì)數(shù)器上，并且有越來(lái)越高的CCD的規(guī)格，300萬(wàn)到1000萬(wàn)像素不等是目前市場(chǎng)上銷(xiāo)售的儀器所配置的CCD常見(jiàn)規(guī)格，分辨率由從前的0.08mm變成了如今的0.01mm，大大提升了圖像的清晰度。此外，根據(jù)基層微生物實(shí)驗(yàn)室的使用需求，圖像特性獲取功能也被增添了。

四、圖像處理功能

全自動(dòng)菌落計(jì)數(shù)器具有傳統(tǒng)的菌落計(jì)數(shù)器所不具備的圖像調(diào)節(jié)，圖像增強(qiáng)，圖像濾波，邊緣檢測(cè)，形態(tài)學(xué)運(yùn)算等功能。

五、統(tǒng)計(jì)功能

全自動(dòng)菌落計(jì)數(shù)器不再被傳統(tǒng)的數(shù)量統(tǒng)計(jì)所局限，目前市場(chǎng)上出現(xiàn)的全自動(dòng)菌落計(jì)數(shù)器，一些智能識(shí)別技術(shù)已經(jīng)被增加，能夠進(jìn)行全皿菌落統(tǒng)計(jì)，區(qū)域選擇統(tǒng)計(jì)，鼠標(biāo)點(diǎn)擊統(tǒng)計(jì)，排污區(qū)域計(jì)數(shù)，直徑分類(lèi)統(tǒng)計(jì)，顏色識(shí)別統(tǒng)計(jì)等。自動(dòng)雜質(zhì)剔除，菌落粘連分割大腸桿菌技術(shù)等也由更先進(jìn)的全自動(dòng)菌落計(jì)數(shù)器所具備。

總而言之，，菌落計(jì)數(shù)器也隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展而不斷的改進(jìn)。需求者選購(gòu)時(shí)可以依據(jù)自己的計(jì)數(shù)側(cè)重點(diǎn)。