2014年年初以來(lái),在利比里亞、塞拉利昂和幾內(nèi)亞等西非國(guó)家，埃博拉病毒殺死了超過(guò)10000人，造成近25000人受感染。中國(guó)積極響應(yīng)WHO（World Health Organization，世界衛(wèi)生組織）呼吁，援助西非抗擊埃博拉疫情，派出公共衛(wèi)生專家組前往疫區(qū)。

病原微生物生物安全國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室童貽剛教授及其團(tuán)隊(duì)在西非塞拉利昂抗擊埃博拉病毒的第一線，利用賽默飛Ion半導(dǎo)體測(cè)序系統(tǒng)對(duì)埃博拉病毒進(jìn)行深度測(cè)序。測(cè)序工作具有非常重要的意義，通過(guò)測(cè)序可以確認(rèn)流行的病毒株系，用以進(jìn)行溯源分析和了解傳播路徑；由于現(xiàn)有實(shí)驗(yàn)室診斷方法（定量PCR）、治療藥物與疫苗研發(fā)都與埃博拉病毒基因組序列密切相關(guān)，病毒基因突變可能導(dǎo)致定量PCR檢測(cè)時(shí)引物不匹配從而發(fā)生漏檢，也可能因?yàn)橥蛔兾稽c(diǎn)涉及藥物或者疫苗作用靶點(diǎn)而產(chǎn)生耐藥或者導(dǎo)致疫苗無(wú)效，因此通過(guò)測(cè)序了解病毒的變異對(duì)于病毒檢測(cè)及疫苗、藥物的研發(fā)都具有重要意義。

此次測(cè)序?qū)娜ツ暌咔楦叻迤?月至11月間收集的175個(gè)埃博拉病毒樣本進(jìn)行全基因組序列測(cè)定?；诖舜螠y(cè)序數(shù)據(jù)，確定目前在塞拉利昂流行的埃博拉病毒主要株系是由早前發(fā)表于《Science》文章中提出的三個(gè)主要的流行株中的第三分支進(jìn)一步演變而產(chǎn)生。此外，此次測(cè)序也確認(rèn)埃博拉病毒的突變速度并沒(méi)有加快。與之前《Science》測(cè)序數(shù)據(jù)相比，此次測(cè)序數(shù)據(jù)取樣時(shí)間跨度更長(zhǎng)，樣本量更大，因此結(jié)果更為翔實(shí)可靠。

針對(duì)此次測(cè)序工作，童貽剛教授肯定了賽默飛Ion半導(dǎo)體測(cè)序平臺(tái)的測(cè)序速度具有非常明顯的優(yōu)勢(shì)，能夠在24小時(shí)內(nèi)完成從核酸提取到獲得測(cè)序結(jié)果的整個(gè)過(guò)程；教授同時(shí)贊賞半導(dǎo)體試劑具有非常好的性價(jià)比，測(cè)序芯片多樣化，可適用于不同的應(yīng)用需求

童貽剛教授及其團(tuán)隊(duì)在抗擊埃博拉病毒的第一線，通過(guò)半導(dǎo)體測(cè)序平臺(tái)所完成的埃博拉病毒深度測(cè)序的研究成果“Genetic diversity and evolutionary dynamics of Ebola virus in Sierra Leone”已于5月13日在《Nature》雜志在線發(fā)表（http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature14490.html）。

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