發(fā)表于新英格蘭醫(yī)學(xué)期刊(The New England Journal of Medicine)的文章《Copy-Number Variation and False Positive Prenatal Screening Results》中,來自Illumina和Tufts醫(yī)學(xué)中心的科學(xué)家得出了新的研究結(jié)論,在一個最新的測序方法的幫助下,無創(chuàng)產(chǎn)前檢測(non-invasive prenatal test, NIPT)內(nèi)來自母體的假陽性結(jié)果可以被更好地篩除掉。
在這個Illumina資助的工作中,研究團隊重新分析了來自于1914名孕婦的序列數(shù)據(jù),以期更好地進行非整倍體風險評估比較的研究;這些提供數(shù)據(jù)的志愿者認為現(xiàn)在胎兒面臨著更高的染色體異常風險。研究團隊已經(jīng)開始在美國進行線粒體DNA的臨床定量工作,并且已經(jīng)向英國人類受孕與胚胎學(xué)管理局提出技術(shù)運用的申請。
Illumina臨床實驗室內(nèi)所用的分析算法在近期進行了更新,包括將亞染色體檢測步驟標準化以及完善了篩查亞染色體拷貝數(shù)變異的方法;使用更新后的算法,研究者發(fā)現(xiàn)原先11個假陽性結(jié)果中的6個可以被正確地重新歸類。
相關(guān)文章的作者解釋道,其中的3個在此前被認為是母體基因拷貝數(shù)變異所造成的非整倍體假陽性結(jié)果,而另外的3個則是步驟標準化后被糾正的。2015年,一篇由華盛頓大學(xué)和費雷德哈欽森癌癥中心的研究人員發(fā)表于新英格蘭醫(yī)學(xué)期刊的文章中提到,母體拷貝數(shù)變異會影響NIPT的檢測結(jié)果,有引起假陽性結(jié)果的可能性。其他的5個假陽性結(jié)果未被從重新分類的原因則是胎兒染色體嵌合現(xiàn)象。
綜合來看,新的算法有效提升了檢測的陽性預(yù)測值,針對21、18、13三染色體綜合癥,提升程度分別為46%到63%、40%到67%、24%到50%?!爸匦路治鰯?shù)據(jù)后獲得的結(jié)果表明,不完善的生物學(xué)知識和檢測技術(shù)造成了原先的假陽性結(jié)果,”團隊在文章中寫道,“包括胎兒胎盤的鑲嵌現(xiàn)象以及母體拷貝數(shù)變異?!?p> 盡管我們在不斷地努力去完善NIPT技術(shù),去克服假陽性結(jié)果,然而持續(xù)不斷的爭論還在進行中,使用母體血液中的胎兒DNA來檢測拷貝數(shù)變異現(xiàn)象和亞染色體畸形的有效性和實用性一直遭受質(zhì)疑。
去年在美國人類遺傳學(xué)雜志上發(fā)表的一篇論文中,一個英國團隊報道稱,當檢測所用的樣本中含有超過3/5的母系拷貝時,要從小于6,000,000 bp的片段中成功地檢測出微缺失、微重復(fù)會變得十分的困難。
上周,瑞士研究人員在醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志中發(fā)表的研究結(jié)果有利于拓寬NIPT的應(yīng)用,即能夠可以檢測到更多罕見的亞染色體畸形。
從6400名單胎孕婦獲得的數(shù)據(jù)結(jié)果后,研究團隊將檢測出異常的患者分類了三類,第一類有50位患者,問題是罕見的常染色體三倍體現(xiàn)象,第二類的53位患者則是出現(xiàn)了性染色體畸形的問題,有119名的第三類則是常規(guī)的染色體三倍體癥。相關(guān)文章的作者呼吁對疾病相關(guān)的復(fù)發(fā)性拷貝數(shù)變異加強關(guān)注,這類病癥的表性原因至今尚未可知。