為應對全球來自競爭對手、投資者和不斷膨脹的世界經(jīng)濟體量等巨大的全球性壓力,制藥行業(yè)正在積極努力尋求降低成本的方法和手段。為了使自己在市場上保持領(lǐng)先地位,各大公司不斷進行藥物儲備,即保持新化學實體(NCEs)持續(xù)不斷地進入市場和取得進展。從統(tǒng)計來看,這些公司的費用投資占比最大的便是用在研發(fā)部門(R&D)。然而,這一戰(zhàn)略已經(jīng)難以維繼。潛在的NCEs耗盡,候選藥物變得更加復雜,都令他們頭痛不已。簡化藥物研發(fā)的技術(shù)因此變得極為重要。
縮短藥品投入市場的時間和追求投資回報率最大化,是制藥行業(yè)的兩大重要目標。本文簡要介紹一種可被用于制藥行業(yè)的強大技術(shù)——分子排阻色譜(SEC),這一技術(shù)正在被越來越多地用于天然聚合物、合成聚合物和蛋白質(zhì)的分離與表征。重組靶向蛋白的探索
?????? 新藥探索的目標仍然是鑒定新的具有穩(wěn)定物化結(jié)構(gòu)的化合物,要求其能夠與生物靶點相互作用,以產(chǎn)生更好的療效。偶然發(fā)現(xiàn)一種具有活性的藥物的幾率越來越小,盡管如此,制藥公司還必須專注于對NCEs的探索,這種探索就只能通過真正從分子水平上理解疾病和傳染行為的表現(xiàn)方式來實現(xiàn)。21世紀的靶向藥物研發(fā)熱潮由此興起。
分子靶點很豐富,其中多數(shù)是蛋白質(zhì),特別是膜蛋白。一旦被識別和分離,有機小分子就被篩選出來測試靶向反應。理想情況下,有機小分子可能會增加蛋白質(zhì)的信號通路或激活蛋白質(zhì)的某種功能,從而阻止發(fā)病或者緩解癥狀。
不幸的是,小分子/蛋白質(zhì)的相互作用往往是特定的,非選擇性的小分子就會產(chǎn)生副作用,最初的候選藥物能夠直接達到治療預期希望渺茫。因此,需要一定數(shù)量的基因操作才能達到預期。設(shè)計和測試這些重組蛋白質(zhì)及其相互作用就成為了對現(xiàn)代分析方法的真正考驗。分子排阻色譜法(SEC)
在研究聚合物的科學家圈子里,SEC已經(jīng)是應用廣泛的成熟技術(shù)(他們更習慣于稱這種技術(shù)為GPC)。而對于藥物研發(fā)者而言,SEC還是一種未被廣泛采用的新技術(shù),它提供了一種快速純化樣品,并測量樣品尺寸大小及多分散度的方法。在SEC實驗中,樣品溶液通過一組色譜柱(色譜柱由謹慎選擇孔隙大小的固定相組成),較大的分子無法滲透固定相中的較小孔隙,因此,會更快地從色譜柱中洗脫出來。就這樣,根據(jù)分子大小的不同,樣品就被分成若干部分。比如一份蛋白質(zhì)樣品,就會通過色譜柱將折疊的、錯誤折疊的、未折疊的蛋白質(zhì)片段分離出來。樣品被分離后,進入到檢測器。
傳統(tǒng)的SEC系統(tǒng)通常使用紫外檢測器(UV)或示差檢測器(RI),以此來測量樣品中不同成分的濃度,然后在系統(tǒng)校正的基礎(chǔ)上,提供相對的分子量(MW)信息。然而,這類配置的系統(tǒng)具有極大的局限性,并不能充分發(fā)揮SEC這種分析方法的全部性能。
隨著技術(shù)的進步,SEC分析方法有了長足的發(fā)展。目前最先進的SEC分析系統(tǒng)包含多種檢測器,如小角光散射檢測器(LALS)、紫外檢測器(UV)、示差折光檢測器(RI)和粘度計等,這些檢測器所得結(jié)果可以相互結(jié)合,從而在極短時間內(nèi)給出豐富的數(shù)據(jù)信息,如絕對分子量、分子尺寸,以及關(guān)于結(jié)構(gòu)和支化等等的信息,同時并不依賴于任何假設(shè)、校正或者數(shù)據(jù)擬合,大大簡化藥物研發(fā)的成本。
在傳統(tǒng)SEC設(shè)置中,色譜柱校正通常用普魯蘭多糖(水相)和聚苯乙烯(有機相)標準品來校準,用MW與洗脫體積的對應關(guān)系來確定每種新樣品的MW相對值。當結(jié)合光散射檢測器的時候,樣品從色譜柱中洗脫出來,高級SEC可以直接測量樣品的絕對分子量分布,無需依賴于洗脫體積。選擇LALS(小角光散射)檢測技術(shù),還可以不依賴于數(shù)學模型直接得到準確結(jié)果。此外,配有光散射檢測器的SEC提供MW的絕對測量,省去了復雜的預校正,只需簡單運行一個窄分布標準品,就可以修正所有檢測器延遲、峰展寬所引起的偏差。
????? ??將粘度計包含在檢測器設(shè)置中,意味著可以直接測量特性粘度(η)和分子密度。利用這一信息,結(jié)合RI或UV檢測器提供的濃度測量值,以及絕對MW數(shù)值,便可以得到流體力學體積(Rh)的真實數(shù)值。UV檢測器提供了除RI檢測以外的另一個濃度測量,使測量共聚物和共軛蛋白的MW絕對值成為可能。
在藥物研發(fā)這類嚴格把控的行業(yè),高級SEC系統(tǒng)的好處不言而喻,它可以提供直接的和豐富的測量數(shù)據(jù)。有能力解決與蛋白質(zhì)、聚合物和輔料相關(guān)的多種應用。下面是一些使用這類系統(tǒng)的應用實例。? 利用高級SEC純化蛋白
一些候選藥物是在大腸桿菌中重組蛋白得到的,這些蛋白質(zhì)通常含有DNA碎片,必須清除和丟棄。光散射檢測器可以用于分離和定量分析樣本中的碎片和聚集體。
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圖1:牛血清白蛋白樣品中聚集體分布圖
(使用帶有RALS的三重檢測器測量)
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以牛血清蛋白(BSA)為例,如圖1所示,用直角光散射檢測器(RALS)(圖中綠色曲線)測量散射光,其對聚合分子測量的靈敏度遠高于RI(圖中紅色曲線)或UV(圖中紫色曲線)。大量研究已經(jīng)明確,BSA單體大約在保留體積(橫坐標)14.00 mL處,二聚體約在11.80 mL處,三聚體在略多于11 mL處,更大的蛋白質(zhì)聚合物大約在保留體積8mL處,還有一個未知的低聚物拖尾。在分析8mL處的蛋白質(zhì)聚集體時,UV和RI兩個濃度檢測器幾乎沒有信號,RALS檢測器則清楚地顯示了在這段保留時間處存在兩個不同的峰。這是因為光散射強度是MW和濃度的雙重函數(shù),而不只與濃度相關(guān)。利用高級SEC定量蛋白質(zhì)寡聚體
帶有多重檢測器的SEC還提供了一個收集純化樣品的定量數(shù)據(jù)的絕佳方法。從蛋白質(zhì)研究角度看,這使得評估寡聚化成為可能。
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圖2 人血清蛋白(HSA)色譜圖
(使用三重檢測器測量)
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圖2是一個人血清蛋白(HSA)分離樣品RI濃度(圖中紅色曲線)和MW(圖中黑色曲線)與保留體積關(guān)系的圖。這些結(jié)果產(chǎn)生的定量數(shù)據(jù)如表1所示,展示了此方法的簡潔。舉個例子,單體的MW可以直接從表中讀出,即66550道爾頓。
由于每個寡聚體的MW是可以獲得的,因而所有四個峰值的重量分數(shù)(Wt Fr)也可以算出。表1顯示該樣品由94.5%的單體、5.1%的二聚體、0.4%的三聚體和0.1%的四聚體組成。這是一個用帶有三重檢測器的SEC獲得深度定量信息的范例。即使初始濃度低至0.1%,光散射測量仍然可以得到準確的MW,如表1中四聚體峰的結(jié)果。
表1人血清蛋白(HSA)數(shù)據(jù)表
(使用帶三重檢測器的SEC測量)蛋白質(zhì)/緩沖液匹配性的研究
所有的NCEs都需要測試其在不同緩沖條件下的穩(wěn)定性。當鹽種類和濃度不同時,一些蛋白質(zhì)片段可能已經(jīng)從根本上改變了構(gòu)象。所以建立一個緩沖溶液體系來模擬樣品原始條件至關(guān)重要。圖3所示的例子顯示,鈣離子存在的體系中,一個多肽片段發(fā)生伸展。?
圖3洗脫液中是否含有鈣離子對結(jié)構(gòu)域的影響
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這種重復序列毒素的多肽結(jié)構(gòu)域(RD)的構(gòu)象,與鈣離子有關(guān)。在這個實驗中,同一種RD使用兩種不同的流動相進樣,濃度使用UV測量。第一種洗脫液中有鈣離子,而第二種則沒有。如圖3所示,峰值從14 mL減小到大約10.5 mL。這表明RD發(fā)生了構(gòu)象變化或者色譜柱中存在靜電相互作用。
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圖4 RALS信號[紅色曲線]和粘度計[藍色曲線]的信號
至apo-RD[虛線]或holo-RD[平滑線]區(qū)分蛋白質(zhì)構(gòu)象變化
在上面的例子中,盡管我們已經(jīng)知道了變化,并理解了產(chǎn)生這一變化的可能原因,但傳統(tǒng)的基于蛋白保留體積的SEC并不能對靜電相互作用或構(gòu)象改變做進一步區(qū)分。圖4所示的結(jié)果表明,結(jié)合了RALS和粘度計的高級SEC清楚地顯示了RD的apo-(未折疊的)和holo-(穩(wěn)定的三級結(jié)構(gòu))狀態(tài)是單分子結(jié)構(gòu)。
表2顯示了這個例子中apo-RD的特性粘度較高(0.35 dL/g),說明RD可能在缺鈣時采取水合物和/或展開的構(gòu)象。結(jié)合RALS數(shù)據(jù),可以計算出絕對分子量。
表2 利用RALS、RI和粘度計測量的數(shù)據(jù)結(jié)果
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數(shù)據(jù)結(jié)果表明,盡管它們的粘度不同,但是具有相同的絕對分子量,這證實了它們是單體。流體力學體積大小的差異暗示RD發(fā)生了解折疊。 結(jié)論
現(xiàn)在,想要在醫(yī)藥開發(fā)市場中生存并且壯大,需要高效的分析技術(shù)作為支撐。日漸興起的高級SEC技術(shù)提供了驗證和優(yōu)化NCEs的新手段。隨著研究中化學物質(zhì)越來越復雜,對結(jié)果精確度的要求就會越來越高,依賴于假設(shè)或數(shù)學擬合算法得到的結(jié)果將逐步被直接測量所替代。配有多重檢測器的SEC系統(tǒng)可以在相同的測試過程中收集更多的信息,它將有效縮短新藥研發(fā)時間,有助于制藥企業(yè)提升市場競爭力。