近期,中科普瑞整合IsoTex-BD China單細(xì)胞研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室經(jīng)過(guò)近一年的研發(fā)測(cè)試和應(yīng)用,正式投入科研服務(wù)應(yīng)用。
BD(China)—Sinotech Genomics(中科普瑞)單細(xì)胞研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室
中科普瑞自2018年3月BD(中國(guó))-云泰生物單細(xì)胞研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室成立以來(lái),聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室完成了多項(xiàng)技術(shù)研發(fā)測(cè)試,已獲得了數(shù)百例腫瘤組織的單細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),并針對(duì)性設(shè)計(jì)靶向panel進(jìn)行驗(yàn)證,完成合作研發(fā)項(xiàng)目五十余項(xiàng)。
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)在2018年繼續(xù)飛速發(fā)展,各類相關(guān)技術(shù)和應(yīng)用紛紛上線,與此同時(shí),單細(xì)胞水平轉(zhuǎn)錄組與蛋白質(zhì)組的檢測(cè),也逐漸廣泛應(yīng)用于免疫、癌癥和干細(xì)胞等研究領(lǐng)域。BD公司旗下的單細(xì)胞平臺(tái)—BD Rhapsody作為單細(xì)胞研究應(yīng)用領(lǐng)域的利器,既可通過(guò)單細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組和靶向轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的整合策略,在單細(xì)胞水平構(gòu)建從新靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)到多樣本驗(yàn)證的完整研究體系,又可利用其最新的BD? AbSeq assay檢測(cè)單細(xì)胞水平的蛋白表達(dá),實(shí)現(xiàn)特異高效的轉(zhuǎn)錄組和蛋白組的多組學(xué)研究方案。
為了更好地聚焦單細(xì)胞腫瘤臨床研究應(yīng)用,中科普瑞攜其下屬科研服務(wù)子公司—上海鯨舟基因推出單細(xì)胞研究系統(tǒng)解決方案。立足于BD Rhapsody 單細(xì)胞研究平臺(tái)開(kāi)展單細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組和靶向轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù),并以單細(xì)胞腫瘤臨床研究為中心,著力進(jìn)行單細(xì)胞甲基化檢測(cè)等技術(shù)研發(fā)和應(yīng)用,進(jìn)而建立涵蓋單細(xì)胞甲基化研究、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究以及單細(xì)胞蛋白組研究的立體式系統(tǒng)解決方案,為單細(xì)胞研究提供新的解決方案和思路。
聚焦單細(xì)胞腫瘤臨床研究
腫瘤研究的逐步深入和高通量測(cè)序技術(shù)的不斷精進(jìn)促使了精準(zhǔn)醫(yī)療策略的提出。而解析腫瘤組織內(nèi)細(xì)胞的高度異質(zhì)性,是實(shí)現(xiàn)更精確的癌癥分型,選擇更合理的個(gè)體化治療策略的迫切需求。針對(duì)腫瘤組織及其免疫微環(huán)境的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以幫助科學(xué)家繪制腫瘤組織內(nèi)細(xì)胞的異質(zhì)性轉(zhuǎn)錄組圖譜,通過(guò)鑒別腫瘤細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞與浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞的不同細(xì)胞亞群,來(lái)解析不同細(xì)胞亞群生物學(xué)功能異同,最終構(gòu)建腫瘤細(xì)胞及免疫微環(huán)境的互作網(wǎng)絡(luò),并探究腫瘤細(xì)胞產(chǎn)生耐藥或免疫逃逸等機(jī)制。
中科普瑞單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)可利用高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),通過(guò)揭示腫瘤發(fā)生發(fā)展進(jìn)程中各種細(xì)胞亞群轉(zhuǎn)錄組的變化與差異,助力科學(xué)家開(kāi)展腫瘤的早期診斷、病情監(jiān)測(cè)及預(yù)后判斷等方面的研究。中科普瑞還與國(guó)家大數(shù)據(jù)中心進(jìn)行戰(zhàn)略合作,結(jié)合大數(shù)據(jù)共享和應(yīng)用分析,通過(guò)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究整合多組學(xué)和臨床數(shù)據(jù),構(gòu)建健康與疾病的信息網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù),以期為不同遺傳背景的患者提供個(gè)體化診斷及精準(zhǔn)治療。
同時(shí),中科普瑞還將利用BD? AbSeq assay這一單細(xì)胞蛋白組分析利器,大幅提高客戶對(duì)其感興趣的稀有或未知細(xì)胞的檢測(cè)能力,以促進(jìn)藥物治療反應(yīng)、細(xì)胞治療等腫瘤免疫學(xué)應(yīng)用研究的進(jìn)展。
聚焦單細(xì)胞甲基化研究
近年來(lái),基于血漿ctDNA甲基化的腫瘤早期診斷、溯源及預(yù)后的技術(shù)突破,為腫瘤風(fēng)險(xiǎn)篩查和防治提供了新的曙光。DNA甲基化還可用于疾病分型、預(yù)后以及用藥指導(dǎo)等臨床領(lǐng)域。單細(xì)胞甲基化檢測(cè)技術(shù)在未來(lái)的疾病研究與臨床應(yīng)用中有著光明前景和無(wú)限可能,既可從單細(xì)胞水平研究DNA甲基化修飾在組織分化、發(fā)育過(guò)程中的特異性,幫助醫(yī)生判斷轉(zhuǎn)移癌組織的原發(fā)病灶,進(jìn)而明確診斷疾病;還可針對(duì)特定腫瘤組織DNA甲基化修飾的異常,進(jìn)行對(duì)應(yīng)的診療指導(dǎo)或藥物開(kāi)發(fā)。
2018年3月以來(lái),中科普瑞作為中國(guó)十萬(wàn)人甲基化組計(jì)劃(表觀星圖計(jì)劃)的項(xiàng)目實(shí)施方,通過(guò)與國(guó)內(nèi)外基因組隊(duì)列計(jì)劃聯(lián)動(dòng),建立中國(guó)人甲基化基準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(kù),為表觀遺傳領(lǐng)域研究、應(yīng)用和臨床檢測(cè)等建立基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫(kù)。表觀星圖計(jì)劃除利用甲基化芯片進(jìn)行甲基化基準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(kù)的建立外,還將利用BD(China) — Sinotech Genomics(中科普瑞)單細(xì)胞研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室在單細(xì)胞研究方面的技術(shù)優(yōu)勢(shì),聚焦單細(xì)胞甲基化研究,以期為腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)篩查和預(yù)防提供新的手段。