實施效果
來源:計算模擬平臺
通過 Discovery Studio 軟件和 Pipeline Pilot軟件虛擬篩選出針對 FMS 樣酪氨酸激酶3受體(FLT3)的抑制劑小分子,該小分子結(jié)構新穎,并具有較強的抑制效果,其 IC50 為18 M。
方案詳情
外周神經(jīng)性疼痛(PNP)是一種比較難治療的慢性疾病。背脊髓相關背根神經(jīng)節(jié)中存在的體感神經(jīng)元致敏性是一個關鍵的生理病理過程。研究發(fā)現(xiàn),造血細胞在神經(jīng)損傷位置可產(chǎn)生細胞因子 FL,即 FMS 樣酪氨酸激酶3受體(FLT3)的配體。通過坐骨神經(jīng)內(nèi)注射 FL 激活 FLT3,產(chǎn)生疼痛的超敏感性,進而激活了外周神經(jīng)性疼痛相關的基因表達,產(chǎn)生短期或長期的敏感神經(jīng)元的敏感性。本研究通過一系列實驗,基于不同的老鼠模型發(fā)現(xiàn)背神經(jīng)節(jié)中的 FLT3 對于外周神經(jīng)性疼痛的產(chǎn)生和持續(xù)起關鍵作用。同時發(fā)現(xiàn)阻礙 FL-FLT3 之間相互作用的抑制劑可以減緩外周神經(jīng)性疼痛,該方法有望成為治療外周神經(jīng)性疼痛的一種新療法。
為了尋求該類抑制劑,文章作者對商業(yè)可獲得的類藥化合物庫共 290 萬個化合物,使用 Pipeline Pilot 按照氫鍵受體大于等于 1,氫鍵供體大于等于 4,可旋轉(zhuǎn)鍵數(shù)目小于等于 10,芳香環(huán)數(shù)目大于等于1,極性表面積小于等于 90 ,預測的水溶性大于等于 50 M 等規(guī)則進行了第yi輪篩選,并通過結(jié)構預處理,得到 343,847 個具有三維結(jié)構的異構體構象。然后使用Discovery Studio中的Receptor-Ligand Pharmacophore Generation 工具產(chǎn)生基于FL-FLT3晶體復合物結(jié)構的藥效團模型,并利用 DS_Screen Library 模塊對之前 343,847 個化合物進行了第二輪篩選。以 Fitvalue 值在 3 以上為標準,得到 285 個結(jié)構不同的化合物,后進行聚類分析和相互作用觀察,得到 28 個化合物,經(jīng)購買和活性測試發(fā)現(xiàn)化合物 BDT001 是一種全新的 FLT3 抑制劑,其 IC50 為 18 M。
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