（一）培養(yǎng)基原料的選擇
在菌種制備過程中，從母種、原種至栽培種，各個(gè)階段的目的要求有所不同，所選用的培養(yǎng)基的配比也應(yīng)有所區(qū)別。母種初生菌絲一般較嫩弱，分解養(yǎng)分能力差，要求營養(yǎng)豐富、完全，氮源、維生素的比例應(yīng)高，須選用易被菌絲吸收利用的物質(zhì)，如葡萄糖、蔗糖、馬鈴薯、玉米粉、麥芽汁、酵母汁、蛋白胨、無機(jī)鹽類及生長素等為原料。原種和栽培種所需數(shù)量較多，且菌絲分解養(yǎng)分能力強(qiáng)，可選用農(nóng)作物的秸桿、糞草、鋸木屑、麩皮、米糠等原料作為培養(yǎng)基。
（二）營養(yǎng)成分的配比
培養(yǎng)基中的碳、氮比例很重要。若培養(yǎng)基中碳源供應(yīng)不足時(shí)，易引起菌種的過早衰老和自溶；若氮源過多或過少，則會引起菌絲過于旺盛生長或生長緩慢，對菌種培養(yǎng)不利。菌種培養(yǎng)基中的pH值也是影響菌絲生長的重要因素。一般培養(yǎng)基經(jīng)高壓滅菌后會使pH值有所下降，必須經(jīng)檢驗(yàn)后加以調(diào)整。調(diào)節(jié)pH值時(shí)，可用石灰澄清液，也可用氫氧化鈉或鹽酸。 在配制培養(yǎng)基時(shí)，為了避免沉淀物的生成而造成營養(yǎng)物的損失，應(yīng)掌握加入各種營養(yǎng)物的順序。一般應(yīng)先加入緩沖化合物，溶解后加入主要元素，然后是微量元素，zui后加入維生素等，是前一種營養(yǎng)成份溶解后再加入第二種營養(yǎng)成份。此外，培養(yǎng)基加入糖類時(shí)，應(yīng)采用適當(dāng)?shù)臏缇椒?，因葡萄糖在高壓下易被破壞，多糖和雙糖也因高溫易被水解和變質(zhì)。
二、培養(yǎng)基的類型
培養(yǎng)基的種類繁多，分類方法主要是按其成分、物理狀態(tài)、用途等分類。
（一）根據(jù)營養(yǎng)物質(zhì)來源分類
1.天然培養(yǎng)基 是用營養(yǎng)豐富的天然有機(jī)物配制而成。如木屑、稻草、麥粒、米糠、蔗渣、棉籽殼和動植物浸出液（土豆煎汁、麥芽汁、牛肉膏）等。都是配制天然培養(yǎng)基的原料。這些有機(jī)物來源廣、價(jià)格低廉、使用方便，但其化學(xué)成分不恒定，即人們在使用時(shí)不能完全掌握它的化學(xué)成分，這類培養(yǎng)基只能用于生產(chǎn)，不適宜作的科學(xué)實(shí)驗(yàn)。
2.合成培養(yǎng)基 是用已知其化學(xué)成分的各類營養(yǎng)物質(zhì)，定量地配制而成。適用于專門的營養(yǎng)生理等研究。生產(chǎn)上使用較少。
3.半合成培養(yǎng)基 是指在天然培養(yǎng)基中，添加一些已知成分的營養(yǎng)物質(zhì)。在生產(chǎn)上應(yīng)用較多。
（二）根據(jù)培養(yǎng)基質(zhì)的物理性狀分類
1.液體培養(yǎng)基 是將食用菌生長發(fā)育所需的營養(yǎng)物質(zhì)，按一定比例配制的營養(yǎng)液。菌絲體在這種培養(yǎng)基中生長迅速，在短時(shí)間內(nèi)可生出大量的菌絲體。這些菌絲體可作為各級種使用，充分縮短生長周期。但液體培養(yǎng)基的深層發(fā)酵工藝要求嚴(yán)格，成本投資大。另一方面是生產(chǎn)的菌種菌齡較難控制且易老化。
2.固體培養(yǎng)基 常見的固體培養(yǎng)基有兩類：一是將液體培養(yǎng)基加入凝固劑（如瓊脂），制成常見的試管斜面或培養(yǎng)皿平板。這種培養(yǎng)基多用于菌種的分離、純化或擴(kuò)大保存。另一類是利用天然纖維物質(zhì)或固形物，如木屑、秸桿、棉殼、廢棉、土壤、畜糞等，加入適量的輔助營養(yǎng)料和水配制而成的培養(yǎng)基，生產(chǎn)上應(yīng)用很廣。
3.半固體培養(yǎng)基 這類培養(yǎng)基配制后呈軟膏狀，國外有部分應(yīng)用，國內(nèi)生產(chǎn)上很少用。
（三）根據(jù)用途分類
根據(jù)用途將培養(yǎng)基質(zhì)分為母種培養(yǎng)基，原種培養(yǎng)基、栽培種培養(yǎng)基三種類型。
（四）根據(jù)表面形狀分類
1.斜面培養(yǎng)基 將滅菌瓊脂培養(yǎng)液注入試管，放置成斜面凝固而成。用于菌種擴(kuò)大轉(zhuǎn)管及菌種保藏。
2.平面培養(yǎng)基 將滅菌瓊脂培養(yǎng)液倒入培養(yǎng)皿與三角燒瓶中凝固而成。用于菌種分離及研究菌類的某些特性。
3.高層培養(yǎng)基 將瓊脂培養(yǎng)基注入試管內(nèi)，滅菌，但不擺成斜面。這樣接入菌種后雖然發(fā)育的面小了一點(diǎn)，但培養(yǎng)基的厚度增大，營養(yǎng)豐富，時(shí)間長些也不容易干燥、開裂。常用于保存菌種

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