我們在微陣列芯片制作與應(yīng)用過程中,常涉及到微陣列分析。與DNA順序分析和基因分型不同,微陣列基因表達(dá)分析的分析物是信使RNAs。信使RNAs的不穩(wěn)定性要比RNA大得多,對操作要求非常高,以避免由于Rnase酶降解二產(chǎn)生假象。在大多數(shù)微陣列分析中,都是逆轉(zhuǎn)錄形成cDNA的。
微陣列用于細(xì)胞遺傳學(xué)分析
細(xì)胞遺傳學(xué)分析微陣列檢測
用于全基因組分析的完整微陣列和試劑盒。微陣列通常用于檢測結(jié)構(gòu)性變異并準(zhǔn)確分析導(dǎo)致疾病的染色體畸變。我們的微陣列和試劑盒提供穩(wěn)健而可靠的低通量和高通量處理方法。
CytoScan 細(xì)胞遺傳學(xué)套件提供平衡的全基因組覆蓋
與其他由于探針密度、重現(xiàn)性和放置受限而缺乏獲得真正平衡的全基因組覆蓋能力的探針相比,CytoScan 細(xì)胞遺傳學(xué)套件陣列提供多態(tài)性與非多態(tài)性探針的Z佳平衡,以實(shí)現(xiàn)細(xì)胞遺傳學(xué)應(yīng)用的全面覆蓋。
微陣列可用作轉(zhuǎn)錄組譜分析
表型異常很少是單個(gè)基因表達(dá)變化的結(jié)果,因此,在研究正常生物學(xué)過程和疾病過程時(shí),生成全面的表達(dá)譜至關(guān)重要。此外,重要的表達(dá)改變,如選擇性剪接事件導(dǎo)致的差異性外顯子使用,則可能在進(jìn)行基因水平譜分析時(shí)被遮蓋。微陣列提供了同時(shí)檢測上百萬個(gè)不同序列的極大優(yōu)勢,這使得該技術(shù)不會受到檢測和測量低豐度轉(zhuǎn)錄本或罕見選擇性剪接事件中所遇問題的影響。
Clariom 和 GeneChip 陣列能夠通過專為測量轉(zhuǎn)錄組多聚腺嘌呤組分的 3’端而設(shè)計(jì)的陣列和檢測提供編碼和非編碼基因的廣泛覆蓋范圍,或者通過專為測量多聚腺嘌呤和非多聚腺嘌呤轉(zhuǎn)錄本的全轉(zhuǎn)錄本而設(shè)計(jì)的檢測和陣列提供整個(gè)基因的所有轉(zhuǎn)錄外顯子的覆蓋范圍。
Affymetrix 全轉(zhuǎn)錄本分析方法讓研究人員不僅能檢測到表達(dá)水平,還能檢測到表達(dá)內(nèi)容,包括替代同種型或基因組缺失。這為采用經(jīng)典的基于 3’端的微陣列無法解決的問題提供了解決方案的新見解。
Clariom D 檢測可詳細(xì)顯示轉(zhuǎn)錄組細(xì)節(jié)視圖,采用Z快路徑得到可操作結(jié)果。Clariom D 分析可用于人類、小鼠和大鼠,讓轉(zhuǎn)錄研究科學(xué)家快速而簡單地得到高保真度的生物標(biāo)記物簽名。創(chuàng)新 Clariom D 檢測設(shè)計(jì)用于提供Z為復(fù)雜的全轉(zhuǎn)錄組范圍基因水平和外顯子水平的表達(dá)譜,包括在一項(xiàng)為期三天的實(shí)驗(yàn)中,檢測編碼和長鏈非編碼 (Inc) RNA 的選擇性剪接事件
利用微陣列的拷貝數(shù)分析
微陣列是檢測諸如染色體插入、重復(fù)和缺失等 DNA 結(jié)構(gòu)變異 (SV) 的shou選平臺。除了這些拷貝數(shù)變異 (CNV),同時(shí)覆蓋多態(tài)性 (SNP) 區(qū)域和非多態(tài)性區(qū)域的全基因組陣列還可額外檢測到提示雜合性缺失 (AOH)、雜合性丟失 (LOH) 或純合性過長連續(xù)延伸 (LCSH) 的染色體不平衡和等位基因失衡。
基于微陣列檢測的優(yōu)勢:
涵蓋目前已確立為重要的基因以及有新出現(xiàn)證據(jù)支持的基因的全基因組覆蓋范圍
檢測靈敏度高:用于闡明克隆進(jìn)化模式的低水平嵌合、異質(zhì)樣本、結(jié)構(gòu)不一致和 gDNA 或細(xì)胞污染
靈活的工作流程:用于經(jīng)濟(jì)實(shí)惠地手動(dòng)或自動(dòng)處理數(shù)份至上千份樣本。
高質(zhì)量、可重現(xiàn)的數(shù)據(jù),便于集成并與公共數(shù)據(jù)庫和合作方資源對比。
從送樣到出結(jié)果的周轉(zhuǎn)時(shí)間迅速,包括數(shù)據(jù)分析在內(nèi)僅需 2 到 3 天
利用微陣列芯片的人類基因分型
Axiom? 基因分型解決方案提供了可定制陣列或預(yù)設(shè)計(jì)陣列的獨(dú)特靈活選擇,其填補(bǔ)設(shè)計(jì)覆蓋的種群范圍超過其他任何一種技術(shù)。專有的光刻陣列幫助確保生產(chǎn)批次間的保真度和一致性,按用戶需要保持設(shè)計(jì)長時(shí)間可用。所有陣列可訪問填補(bǔ)優(yōu)化后的設(shè)計(jì),可將 GWAS、復(fù)制和精細(xì)定位結(jié)合在同一項(xiàng)研究中。它是唯yi一種可提供 1000 萬余種經(jīng)傳統(tǒng)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室驗(yàn)證且完全注釋的標(biāo)記物選項(xiàng)的基因分型解決方案,由此研究人員可輕松而經(jīng)濟(jì)實(shí)惠地為其應(yīng)用創(chuàng)建優(yōu)化后的陣列設(shè)計(jì)。
微陣列芯片和GBS的農(nóng)業(yè)基因組學(xué)解決方案
Affymetrix 農(nóng)業(yè)基因組學(xué)基因分型解決方案為育種人員和研究人員提供了強(qiáng)大的基因分型工具和靈活的范圍,以便高效地驗(yàn)證、識別、篩選植物和動(dòng)物中的復(fù)雜遺傳性狀。穩(wěn)健的、可重現(xiàn)性高、可擴(kuò)展的產(chǎn)品系列,有助于標(biāo)記輔助選育、全基因組關(guān)聯(lián)研究、數(shù)量性狀位點(diǎn)分析、親子代關(guān)系和可追溯性,這些都將為您快速追蹤基因組選擇程序提供幫助。
2018-05-09 3243次